seq1 = pF1KB9437.tfa, 1785 bp
seq2 = pF1KB9437/gi568815580f_22071145.tfa (gi568815580f:22071145_22300820), 229676 bp

>pF1KB9437 1785
>gi568815580f:22071145_22300820 (Chr18)

1-1135  (100001-101135)   100% ->
1136-1302  (105811-105977)   100% ->
1303-1428  (110309-110434)   100% ->
1429-1516  (111613-111700)   100% ->
1517-1620  (111796-111899)   100% ->
1621-1785  (129512-129676)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCTTGACTGACGGCGGCTGGTGCTTGCCGAAGCGCTTCGGGGCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCCTTGACTGACGGCGGCTGGTGCTTGCCGAAGCGCTTCGGGGCCGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGGTGCGGACGCCAGCGACTCCAGAGCCTTTCCAGCGCGGGAGCCCTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGGTGCGGACGCCAGCGACTCCAGAGCCTTTCCAGCGCGGGAGCCCTCCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CGCCGCCTTCCCCCATCTCTTCCTCGTCCTCCTCCTGCTCCCGGGGCGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CGCCGCCTTCCCCCATCTCTTCCTCGTCCTCCTCCTGCTCCCGGGGCGGA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GAGCGGGGCCCCGGCGGCGCCAGCAACTGCGGGACGCCTCAGCTCGACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GAGCGGGGCCCCGGCGGCGCCAGCAACTGCGGGACGCCTCAGCTCGACAC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GGAGGCGGCGGCCGGACCCCCGGCCCGCTCGCTGCTGCTCAGTTCCTACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GGAGGCGGCGGCCGGACCCCCGGCCCGCTCGCTGCTGCTCAGTTCCTACG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CTTCGCATCCCTTCGGGGCTCCCCACGGACCTTCGGCGCCTGGGGTCGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CTTCGCATCCCTTCGGGGCTCCCCACGGACCTTCGGCGCCTGGGGTCGCG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GGCCCCGGGGGCAACCTGTCGAGCTGGGAGGACTTGCTGCTGTTCACTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GGCCCCGGGGGCAACCTGTCGAGCTGGGAGGACTTGCTGCTGTTCACTGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CCTCGACCAAGCCGCGACCGCCAGCAAGCTGCTGTGGTCCAGCCGCGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CCTCGACCAAGCCGCGACCGCCAGCAAGCTGCTGTGGTCCAGCCGCGGCG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 CCAAGCTGAGCCCCTTCGCACCCGAGCAGCCGGAGGAGATGTACCAGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 CCAAGCTGAGCCCCTTCGCACCCGAGCAGCCGGAGGAGATGTACCAGACC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 CTCGCCGCTCTCTCCAGCCAGGGTCCGGCCGCCTACGACGGCGCGCCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 CTCGCCGCTCTCTCCAGCCAGGGTCCGGCCGCCTACGACGGCGCGCCCGG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CGGCTTCGTGCACTCTGCGGCCGCGGCGGCAGCAGCCGCGGCGGCGGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CGGCTTCGTGCACTCTGCGGCCGCGGCGGCAGCAGCCGCGGCGGCGGCCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 GCTCCCCGGTCTACGTGCCCACCACCCGCGTGGGTTCCATGCTGCCCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 GCTCCCCGGTCTACGTGCCCACCACCCGCGTGGGTTCCATGCTGCCCGGC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 CTACCGTACCACCTGCAGGGGTCGGGCAGTGGGCCAGCCAACCACGCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 CTACCGTACCACCTGCAGGGGTCGGGCAGTGGGCCAGCCAACCACGCGGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CGGCGCGGGCGCGCACCCCGGCTGGCCTCAGGCCTCGGCCGACAGCCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CGGCGCGGGCGCGCACCCCGGCTGGCCTCAGGCCTCGGCCGACAGCCCTC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 CATACGGCAGCGGAGGCGGCGCGGCTGGCGGCGGGGCCGCGGGGCCTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 CATACGGCAGCGGAGGCGGCGCGGCTGGCGGCGGGGCCGCGGGGCCTGGC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 GGCGCTGGCTCAGCCGCGGCGCACGTCTCGGCGCGCTTCCCCTACTCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 GGCGCTGGCTCAGCCGCGGCGCACGTCTCGGCGCGCTTCCCCTACTCTCC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 CAGCCCGCCCATGGCCAACGGCGCCGCGCGGGAGCCGGGAGGCTACGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 CAGCCCGCCCATGGCCAACGGCGCCGCGCGGGAGCCGGGAGGCTACGCGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 CGGCGGGCAGTGGGGGCGCGGGAGGCGTGAGCGGCGGCGGCAGTAGCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 CGGCGGGCAGTGGGGGCGCGGGAGGCGTGAGCGGCGGCGGCAGTAGCCTG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 GCGGCCATGGGCGGCCGCGAGCCCCAGTACAGCTCGCTGTCGGCCGCGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 GCGGCCATGGGCGGCCGCGAGCCCCAGTACAGCTCGCTGTCGGCCGCGCG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 GCCGCTGAACGGGACGTACCACCACCACCACCACCACCACCACCACCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 GCCGCTGAACGGGACGTACCACCACCACCACCACCACCACCACCACCATC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 CGAGCCCCTACTCGCCCTACGTGGGGGCGCCACTGACGCCTGCCTGGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 CGAGCCCCTACTCGCCCTACGTGGGGGCGCCACTGACGCCTGCCTGGCCC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 GCCGGACCCTTCGAGACCCCGGTGCTGCACAGCCTGCAGAGCCGCGCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 GCCGGACCCTTCGAGACCCCGGTGCTGCACAGCCTGCAGAGCCGCGCCGG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 AGCCCCGCTCCCGGTGCCCCGGGGTCCCAGTGCAG         ACCTGC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 101101 AGCCCCGCTCCCGGTGCCCCGGGGTCCCAGTGCAGGTA...CAGACCTGC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1142 TGGAGGACCTGTCCGAGAGCCGCGAGTGCGTGAACTGCGGCTCCATCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105817 TGGAGGACCTGTCCGAGAGCCGCGAGTGCGTGAACTGCGGCTCCATCCAG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1192 ACGCCGCTGTGGCGGCGGGACGGCACCGGCCACTACCTGTGCAACGCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105867 ACGCCGCTGTGGCGGCGGGACGGCACCGGCCACTACCTGTGCAACGCCTG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1242 CGGGCTCTACAGCAAGATGAACGGCCTCAGCCGGCCCCTCATCAAGCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105917 CGGGCTCTACAGCAAGATGAACGGCCTCAGCCGGCCCCTCATCAAGCCGC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1292 AGAAGCGCGTG         CCTTCATCACGGCGGCTTGGATTGTCCTGT
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 105967 AGAAGCGCGTGGTG...TAGCCTTCATCACGGCGGCTTGGATTGTCCTGT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1333 GCCAACTGTCACACCACAACTACCACCTTATGGCGCAGAAACGCCGAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110339 GCCAACTGTCACACCACAACTACCACCTTATGGCGCAGAAACGCCGAGGG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1383 TGAACCCGTGTGCAATGCTTGTGGACTCTACATGAAACTCCATGGG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 110389 TGAACCCGTGTGCAATGCTTGTGGACTCTACATGAAACTCCATGGGGTA.

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1429      GTGCCCAGACCACTTGCTATGAAAAAAGAGGGAATTCAAACCAGG
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110439 ..TAGGTGCCCAGACCACTTGCTATGAAAAAAGAGGGAATTCAAACCAGG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1474 AAACGAAAACCTAAGAACATAAATAAATCAAAGACTTGCTCTG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 111658 AAACGAAAACCTAAGAACATAAATAAATCAAAGACTTGCTCTGGTA...C

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1517   GTAATAGCAATAATTCCATTCCCATGACTCCAACTTCCACCTCTTCTA
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111794 AGGTAATAGCAATAATTCCATTCCCATGACTCCAACTTCCACCTCTTCTA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1565 ACTCAGATGATTGCAGCAAAAATACTTCCCCCACAACACAACCTACAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111844 ACTCAGATGATTGCAGCAAAAATACTTCCCCCACAACACAACCTACAGCC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1615 TCAGGG         GCGGGTGCCCCGGTGATGACTGGTGCGGGAGAGAG
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111894 TCAGGGGTA...CAGGCGGGTGCCCCGGTGATGACTGGTGCGGGAGAGAG

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1656 CACCAATCCCGAGAACAGCGAGCTCAAGTATTCGGGTCAAGATGGGCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129547 CACCAATCCCGAGAACAGCGAGCTCAAGTATTCGGGTCAAGATGGGCTCT

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1706 ACATAGGCGTCAGTCTCGCCTCGCCGGCCGAAGTCACGTCCTCCGTGCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129597 ACATAGGCGTCAGTCTCGCCTCGCCGGCCGAAGTCACGTCCTCCGTGCGA

   1800     .    :    .    :    .    :
   1756 CCGGATTCCTGGTGCGCCCTGGCCCTGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||
 129647 CCGGATTCCTGGTGCGCCCTGGCCCTGGCC