seq1 = pF1KB9433.tfa, 816 bp
seq2 = pF1KB9433/gi568815587r_85563814.tfa (gi568815587r:85563814_85764629), 200816 bp

>pF1KB9433 816
>gi568815587r:85563814_85764629 (Chr11)

(complement)

1-816  (100001-100816)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAGGAGGAGGCTATCGCCAGCCTCCCGGGGGAAGAGACGGAGGATAT
        |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAGGAGGAGGCGATCGCCAGCCTCCCGGGGGAAGAGACGGAGGATAT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGACTTTCTGTCTGGGCTGGAACTGGCGGATCTCCTGGACCCCAGGCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGACTTTCTGTCTGGGCTGGAACTGGCGGATCTCCTGGACCCCAGGCAAC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CGGACTGGCACCTGGACCCCGGGCTTAGCTCGCCGGGGCCTCTCTCCTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CGGACTGGCACCTGGACCCCGGGCTTAGCTCGCCGGGGCCTCTCTCCTCG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TCTGGCGGAGGCTCGGATAGCGGCGGCCTGTGGAGAGGGGACGATGACGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TCTGGCGGAGGCTCGGATAGCGGCGGCCTGTGGAGAGGGGACGATGACGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TGAGGCCGCGGCTGCTGAAATGCAGCGCTTCTCTGACCTGCTGCAAAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 TGAGGCCGCGGCTGCTGAAATGCAGCGCTTCTCTGACCTGCTGCAAAGGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TGTTAAACGGTATCGGAGGCTGCAGCAGCAGCAGTGACAGTGGCAGCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TGTTAAACGGTATCGGAGGCTGCAGCAGCAGCAGTGACAGTGGCAGCGCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GAAAAGAGGCGGAGAAAGTCCCCAGGAGGAGGCGGCGGTGGCGGCAGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GAAAAGAGGCGGAGAAAGTCCCCAGGAGGAGGCGGCGGTGGCGGCAGCGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 TAACGACAACAACCAGGCGGCGACAAAGAGTCCCCGGAAGGCGGCGGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 TAACGACAACAACCAGGCGGCGACAAAGAGTCCCCGGAAGGCGGCGGCGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 CCGCTGCCCGCCTTAATCGACTGAAGAAGAAGGAGTACGTGATGGGGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 CCGCTGCCCGCCTTAATCGACTGAAGAAGAAGGAGTACGTGATGGGGCTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GAGAGTCGAGTCCGGGGTCTGGCAGCCGAGAACCAGGAGCTGCGGGCCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GAGAGTCGAGTCCGGGGTCTGGCAGCCGAGAACCAGGAGCTGCGGGCCGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GAATCGGGAGCTGGGCAAACGCGTACAGGCACTGCAGGAGGAGAGTCGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GAATCGGGAGCTGGGCAAACGCGTACAGGCACTGCAGGAGGAGAGTCGCT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 ACCTACGGGCAGTCTTAGCCAACGAGACTGGACTGGCTCGCTTGCTGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 ACCTACGGGCAGTCTTAGCCAACGAGACTGGACTGGCTCGCTTGCTGAGC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 CGGCTGAGCGGCGTGGGACTGCGGCTGACCACCTCGCTCTTCAGAGACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 CGGCTGAGCGGCGTGGGACTGCGGCTGACCACCTCGCTCTTCAGAGACTC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 GCCCGCCGGTGACCACGACTACGCTCTGCCGGTGGGAAAGCAGAAGCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 GCCCGCCGGTGACCACGACTACGCTCTGCCGGTGGGAAAGCAGAAGCAGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 ACCTGCTGGAAGAGGACGACTCGGCGGGAGGAGTCTGTCTCCATGTGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 ACCTGCTGGAAGAGGACGACTCGGCGGGAGGAGTCTGTCTCCATGTGGAC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 AAGGATAAGGTGTCGGTGGAGTTCTGCTCGGCGTGCGCCCGGAAGGCGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 AAGGATAAGGTGTCGGTGGAGTTCTGCTCGGCGTGCGCCCGGAAGGCGTC

    800     .    :    .
    801 GTCTTCTCTTAAAATG
        ||||||||||||||||
 100801 GTCTTCTCTTAAAATG