seq1 = pF1KB9428.tfa, 1554 bp
seq2 = pF1KB9428/gi568815584r_24236178.tfa (gi568815584r:24236178_24439598), 203421 bp

>pF1KB9428 1554
>gi568815584r:24236178_24439598 (Chr14)

(complement)

1-20  (99773-99792)   100% ->
21-161  (100002-100142)   100% ->
162-471  (100275-100584)   100% ->
472-617  (101032-101177)   100% ->
618-664  (101304-101350)   100% ->
665-832  (101559-101726)   100% ->
833-900  (101837-101904)   100% ->
901-1275  (102139-102513)   100% ->
1276-1336  (102654-102714)   100% ->
1337-1554  (103204-103421)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCGTGCGTCAAGTTATG         GCCCAGCGGTGCCCCCGCCCC
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
  99773 ATGTCGTGCGTCAAGTTATGGTG...CAGGCCCAGCGGTGCCCCCGCCCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 CTTGGTGTCCATCGAGGAACTGGAGAACCAGGAGCTCGTCGGCAAAGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100023 CTTGGTGTCCATCGAGGAACTGGAGAACCAGGAGCTCGTCGGCAAAGGCG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 GGTTCGGCACAGTGTTCCGGGCGCAACATAGGAAGTGGGGCTACGATGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100073 GGTTCGGCACAGTGTTCCGGGCGCAACATAGGAAGTGGGGCTACGATGTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GCGGTCAAGATCGTAAACTC         GAAGGCGATATCCAGGGAGGT
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 100123 GCGGTCAAGATCGTAAACTCGTG...TAGGAAGGCGATATCCAGGGAGGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 CAAGGCCATGGCAAGTCTGGATAACGAATTCGTGCTGCGCCTAGAAGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100296 CAAGGCCATGGCAAGTCTGGATAACGAATTCGTGCTGCGCCTAGAAGGGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TTATCGAGAAGGTGAACTGGGACCAAGATCCCAAGCCGGCTCTGGTGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100346 TTATCGAGAAGGTGAACTGGGACCAAGATCCCAAGCCGGCTCTGGTGACT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 AAATTCATGGAGAACGGCTCCTTGTCGGGGCTGCTGCAGTCCCAGTGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100396 AAATTCATGGAGAACGGCTCCTTGTCGGGGCTGCTGCAGTCCCAGTGCCC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TCGGCCCTGGCCGCTCCTTTGCCGCCTGCTGAAAGAAGTGGTGCTTGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100446 TCGGCCCTGGCCGCTCCTTTGCCGCCTGCTGAAAGAAGTGGTGCTTGGGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 TGTTTTACCTGCACGACCAGAACCCGGTGCTCCTGCACCGGGACCTCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100496 TGTTTTACCTGCACGACCAGAACCCGGTGCTCCTGCACCGGGACCTCAAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 CCATCCAACGTCCTGCTGGACCCAGAGCTGCACGTCAAG         CT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 100546 CCATCCAACGTCCTGCTGGACCCAGAGCTGCACGTCAAGGTC...CAGCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 GGCAGATTTTGGCCTGTCCACATTTCAGGGAGGCTCACAGTCAGGGACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101034 GGCAGATTTTGGCCTGTCCACATTTCAGGGAGGCTCACAGTCAGGGACAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 GGTCCGGGGAGCCAGGGGGCACCCTGGGCTACTTGGCCCCAGAACTGTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101084 GGTCCGGGGAGCCAGGGGGCACCCTGGGCTACTTGGCCCCAGAACTGTTT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 GTTAACGTAAACCGGAAGGCCTCCACAGCCAGTGACGTCTACAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 101134 GTTAACGTAAACCGGAAGGCCTCCACAGCCAGTGACGTCTACAGGTA...

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    618    CTTCGGGATCCTAATGTGGGCAGTGCTTGCTGGAAGAGAAGTTGAGT
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101301 CAGCTTCGGGATCCTAATGTGGGCAGTGCTTGCTGGAAGAGAAGTTGAGT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665          TGCCAACCGAACCATCACTCGTGTACGAAGCAGTGTGCAAC
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101351 GTA...CAGTGCCAACCGAACCATCACTCGTGTACGAAGCAGTGTGCAAC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 AGGCAGAACCGGCCTTCATTGGCTGAGCTGCCCCAAGCCGGGCCTGAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101600 AGGCAGAACCGGCCTTCATTGGCTGAGCTGCCCCAAGCCGGGCCTGAGAC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 TCCCGGCTTAGAAGGACTGAAGGAGCTAATGCAGCTCTGCTGGAGCAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101650 TCCCGGCTTAGAAGGACTGAAGGAGCTAATGCAGCTCTGCTGGAGCAGTG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 AGCCCAAGGACAGACCCTCCTTCCAGG         AATGCCTACCAAAA
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 101700 AGCCCAAGGACAGACCCTCCTTCCAGGGTG...TAGAATGCCTACCAAAA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 ACTGATGAAGTCTTCCAGATGGTGGAGAACAATATGAATGCTGCTGTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101851 ACTGATGAAGTCTTCCAGATGGTGGAGAACAATATGAATGCTGCTGTCTC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 CACG         GTAAAGGATTTCCTGTCTCAGCTCAGGAGCAGCAATA
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101901 CACGGTG...CAGGTAAAGGATTTCCTGTCTCAGCTCAGGAGCAGCAATA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 GGAGATTTTCTATCCCAGAGTCAGGCCAAGGAGGGACAGAAATGGATGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102176 GGAGATTTTCTATCCCAGAGTCAGGCCAAGGAGGGACAGAAATGGATGGC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 TTTAGGAGAACCATAGAAAACCAGCACTCTCGTAATGATGTCATGGTTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102226 TTTAGGAGAACCATAGAAAACCAGCACTCTCGTAATGATGTCATGGTTTC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 TGAGTGGCTAAACAAACTGAATCTAGAGGAGCCTCCCAGCTCTGTTCCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102276 TGAGTGGCTAAACAAACTGAATCTAGAGGAGCCTCCCAGCTCTGTTCCTA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1088 AAAAATGCCCGAGCCTTACCAAGAGGAGCAGGGCACAAGAGGAGCAGGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102326 AAAAATGCCCGAGCCTTACCAAGAGGAGCAGGGCACAAGAGGAGCAGGTT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1138 CCACAAGCCTGGACAGCAGGCACATCTTCAGATTCGATGGCCCAACCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102376 CCACAAGCCTGGACAGCAGGCACATCTTCAGATTCGATGGCCCAACCTCC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1188 CCAGACTCCAGAGACCTCAACTTTCAGAAACCAGATGCCCAGCCCTACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102426 CCAGACTCCAGAGACCTCAACTTTCAGAAACCAGATGCCCAGCCCTACCT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1238 CAACTGGAACACCAAGTCCTGGACCCCGAGGGAATCAG         GGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 102476 CAACTGGAACACCAAGTCCTGGACCCCGAGGGAATCAGGTG...CAGGGG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1279 GCTGAGAGACAAGGCATGAACTGGTCCTGCAGGACCCCGGAGCCAAATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102657 GCTGAGAGACAAGGCATGAACTGGTCCTGCAGGACCCCGGAGCCAAATCC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1329 AGTAACAG         GGCGACCGCTCGTTAACATATACAACTGCTCTG
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 102707 AGTAACAGGTA...AAGGGCGACCGCTCGTTAACATATACAACTGCTCTG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1370 GGGTGCAAGTTGGAGACAACAACTACTTGACTATGCAACAGACAACTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103237 GGGTGCAAGTTGGAGACAACAACTACTTGACTATGCAACAGACAACTGCC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1420 TTGCCCACATGGGGCTTGGCACCTTCGGGCAAGGGGAGGGGCTTGCAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103287 TTGCCCACATGGGGCTTGGCACCTTCGGGCAAGGGGAGGGGCTTGCAGCA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1470 CCCCCCACCAGTAGGTTCGCAAGAAGGCCCTAAAGATCCTGAAGCCTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103337 CCCCCCACCAGTAGGTTCGCAAGAAGGCCCTAAAGATCCTGAAGCCTGGA

   1600     .    :    .    :    .    :    .
   1520 GCAGGCCACAGGGTTGGTATAATCATAGCGGGAAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103387 GCAGGCCACAGGGTTGGTATAATCATAGCGGGAAA