seq1 = pF1KB9419.tfa, 1629 bp
seq2 = pF1KB9419/gi568815580r_624427.tfa (gi568815580r:624427_856827), 232401 bp

>pF1KB9419 1629
>gi568815580r:624427_856827 (Chr18)

(complement)

1-271  (100001-100271)   100% ->
272-371  (105024-105123)   100% ->
372-470  (108810-108908)   100% ->
471-574  (110777-110880)   100% ->
575-724  (110971-111120)   100% ->
725-880  (113413-113568)   100% ->
881-1060  (113731-113910)   100% ->
1061-1137  (117017-117093)   100% ->
1138-1291  (119867-120020)   100% ->
1292-1423  (123863-123994)   100% ->
1424-1629  (132196-132401)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGCTGCATTAAAAGTAAAGAAAACAAAAGTCCAGCCATTAAATACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGCTGCATTAAAAGTAAAGAAAACAAAAGTCCAGCCATTAAATACAG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 ACCTGAAAATACTCCAGAGCCTGTCAGTACAAGTGTGAGCCATTATGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 ACCTGAAAATACTCCAGAGCCTGTCAGTACAAGTGTGAGCCATTATGGAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CAGAACCCACTACAGTGTCACCATGTCCGTCATCTTCAGCAAAGGGAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CAGAACCCACTACAGTGTCACCATGTCCGTCATCTTCAGCAAAGGGAACA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GCAGTTAATTTCAGCAGTCTTTCCATGACACCATTTGGAGGATCCTCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GCAGTTAATTTCAGCAGTCTTTCCATGACACCATTTGGAGGATCCTCAGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GGTAACGCCTTTTGGAGGTGCATCTTCCTCATTTTCAGTGGTGCCAAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GGTAACGCCTTTTGGAGGTGCATCTTCCTCATTTTCAGTGGTGCCAAGTT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CATATCCTGCTGGTTTAACAG         GTGGTGTTACTATATTTGTG
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 100251 CATATCCTGCTGGTTTAACAGGTG...TAGGTGGTGTTACTATATTTGTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GCCTTATATGATTATGAAGCTAGAACTACAGAAGACCTTTCATTTAAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105044 GCCTTATATGATTATGAAGCTAGAACTACAGAAGACCTTTCATTTAAGAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 GGGTGAAAGATTTCAAATAATTAACAATAC         GGAAGGAGATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 105094 GGGTGAAAGATTTCAAATAATTAACAATACGTA...CAGGGAAGGAGATT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 GGTGGGAAGCAAGATCAATCGCTACAGGAAAGAATGGTTATATCCCGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108821 GGTGGGAAGCAAGATCAATCGCTACAGGAAAGAATGGTTATATCCCGAGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 AATTATGTAGCGCCTGCAGATTCCATTCAGGCAGAAGA         ATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 108871 AATTATGTAGCGCCTGCAGATTCCATTCAGGCAGAAGAGTA...CAGATG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 GTATTTTGGCAAAATGGGGAGAAAAGATGCTGAAAGATTACTTTTGAATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110780 GTATTTTGGCAAAATGGGGAGAAAAGATGCTGAAAGATTACTTTTGAATC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 CTGGAAATCAACGAGGTATTTTCTTAGTAAGAGAGAGTGAAACAACTAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110830 CTGGAAATCAACGAGGTATTTTCTTAGTAAGAGAGAGTGAAACAACTAAA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 G         GTGCTTATTCCCTTTCTATTCGTGATTGGGATGAGATAAG
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110880 GGTA...CAGGTGCTTATTCCCTTTCTATTCGTGATTGGGATGAGATAAG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 GGGTGACAATGTGAAACACTACAAAATTAGGAAACTTGACAATGGTGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111011 GGGTGACAATGTGAAACACTACAAAATTAGGAAACTTGACAATGGTGGAT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 ACTATATCACAACCAGAGCACAATTTGATACTCTGCAGAAATTGGTGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111061 ACTATATCACAACCAGAGCACAATTTGATACTCTGCAGAAATTGGTGAAA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 CACTACACAG         AACATGCTGATGGTTTATGCCACAAGTTGAC
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 111111 CACTACACAGGTA...TAGAACATGCTGATGGTTTATGCCACAAGTTGAC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 AACTGTGTGTCCAACTGTGAAACCTCAGACTCAAGGTCTAGCAAAAGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113444 AACTGTGTGTCCAACTGTGAAACCTCAGACTCAAGGTCTAGCAAAAGATG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 CTTGGGAAATCCCTCGAGAATCTTTGCGACTAGAGGTTAAACTAGGACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113494 CTTGGGAAATCCCTCGAGAATCTTTGCGACTAGAGGTTAAACTAGGACAA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 GGATGTTTCGGCGAAGTGTGGATGG         GAACATGGAATGGAAC
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 113544 GGATGTTTCGGCGAAGTGTGGATGGGTA...TAGGAACATGGAATGGAAC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 CACGAAAGTAGCAATCAAAACACTAAAACCAGGTACAATGATGCCAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113747 CACGAAAGTAGCAATCAAAACACTAAAACCAGGTACAATGATGCCAGAAG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 CTTTCCTTCAAGAAGCTCAGATAATGAAAAAATTAAGACATGATAAACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113797 CTTTCCTTCAAGAAGCTCAGATAATGAAAAAATTAAGACATGATAAACTT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 GTTCCACTATATGCTGTTGTTTCTGAAGAACCAATTTACATTGTCACTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113847 GTTCCACTATATGCTGTTGTTTCTGAAGAACCAATTTACATTGTCACTGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1047 ATTTATGTCAAAAG         GAAGCTTATTAGATTTCCTTAAGGAAG
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 113897 ATTTATGTCAAAAGGTA...CAGGAAGCTTATTAGATTTCCTTAAGGAAG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1088 GAGATGGAAAGTATTTGAAGCTTCCACAGCTGGTTGATATGGCTGCTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117044 GAGATGGAAAGTATTTGAAGCTTCCACAGCTGGTTGATATGGCTGCTCAG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1138          ATTGCTGATGGTATGGCATATATTGAAAGAATGAACTATAT
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117094 GTA...AAGATTGCTGATGGTATGGCATATATTGAAAGAATGAACTATAT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1179 TCACCGAGATCTTCGGGCTGCTAATATTCTTGTAGGAGAAAATCTTGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119908 TCACCGAGATCTTCGGGCTGCTAATATTCTTGTAGGAGAAAATCTTGTGT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1229 GCAAAATAGCAGACTTTGGTTTAGCAAGGTTAATTGAAGACAATGAATAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119958 GCAAAATAGCAGACTTTGGTTTAGCAAGGTTAATTGAAGACAATGAATAC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1279 ACAGCAAGACAAG         GTGCAAAATTTCCAATCAAATGGACAGC
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 120008 ACAGCAAGACAAGGTA...TAGGTGCAAAATTTCCAATCAAATGGACAGC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1320 TCCTGAAGCTGCACTGTATGGTCGGTTTACAATAAAGTCTGATGTCTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123891 TCCTGAAGCTGCACTGTATGGTCGGTTTACAATAAAGTCTGATGTCTGGT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1370 CATTTGGAATTCTGCAAACAGAACTAGTAACAAAGGGCCGAGTGCCATAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123941 CATTTGGAATTCTGCAAACAGAACTAGTAACAAAGGGCCGAGTGCCATAT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1420 CCAG         GTATGGTGAACCGTGAAGTACTAGAACAAGTGGAGCG
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
 123991 CCAGGTA...TAGGTATGGTGAACCGTGAAGTATTAGAACAAGTGGAGCG

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1461 AGGATACAGGATGCCGTGCCCTCAGGGCTGTCCAGAATCCCTCCATGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132233 AGGATACAGGATGCCGTGCCCTCAGGGCTGTCCAGAATCCCTCCATGAAT

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1511 TGATGAATCTGTGTTGGAAGAAGGACCCTGATGAAAGACCAACATTTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132283 TGATGAATCTGTGTTGGAAGAAGGACCCTGATGAAAGACCAACATTTGAA

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1561 TATATTCAGTCCTTCTTGGAAGACTACTTCACTGCTACAGAGCCACAGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132333 TATATTCAGTCCTTCTTGGAAGACTACTTCACTGCTACAGAGCCACAGTA

   1700     .    :    .
   1611 CCAGCCAGGAGAAAATTTA
        |||||||||||||||||||
 132383 CCAGCCAGGAGAAAATTTA