seq1 = pF1KB9418.tfa, 1857 bp
seq2 = pF1KB9418/gi568815585r_40833428.tfa (gi568815585r:40833428_41082054), 248627 bp

>pF1KB9418 1857
>gi568815585r:40833428_41082054 (Chr13)

(complement)

1-72  (100001-100072)   100% ->
73-253  (123039-123219)   100% ->
254-361  (130619-130726)   100% ->
362-529  (132082-132249)   100% ->
530-613  (138130-138213)   100% ->
614-806  (138911-139103)   100% ->
807-1256  (140685-141134)   99% ->
1257-1857  (148027-148627)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCTGCTGTTGTCCAACAGAACGACCTAGTATTTGAATTTGCTAGTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCTGCTGTTGTCCAACAGAACGACCTAGTATTTGAATTTGCTAGTAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGTCATGGAGGATGAACGACAG         CTTGGTGATCCAGCTATTT
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 100051 CGTCATGGAGGATGAACGACAGGTA...CAGCTTGGTGATCCAGCTATTT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TTCCTGCCGTAATTGTGGAACATGTTCCTGGTGCTGATATTCTCAATAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123058 TTCCTGCCGTAATTGTGGAACATGTTCCTGGTGCTGATATTCTCAATAGT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TATGCCGGTCTAGCCTGTGTGGAAGAGCCCAATGACATGATTACTGAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123108 TATGCCGGTCTAGCCTGTGTGGAAGAGCCCAATGACATGATTACTGAGAG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TTCACTGGATGTTGCTGAAGAAGAAATCATAGACGATGATGATGATGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123158 TTCACTGGATGTTGCTGAAGAAGAAATCATAGACGATGATGATGATGACA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TCACCCTTACAG         TTGAAGCTTCTTGTCATGACGGGGATGAA
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 123208 TCACCCTTACAGGTG...CAGTTGAAGCTTCTTGTCATGACGGGGATGAA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 ACAATTGAAACTATTGAGGCTGCTGAGGCACTCCTCAATATGGATTCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130648 ACAATTGAAACTATTGAGGCTGCTGAGGCACTCCTCAATATGGATTCCCC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TGGCCCTATGCTGGATGAAAAACGAATAA         ATAATAATATAT
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 130698 TGGCCCTATGCTGGATGAAAAACGAATAAGTG...TAGATAATAATATAT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 TTAGTTCACCTGAAGATGACATGGTTGTTGCCCCAGTCACCCATGTGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132094 TTAGTTCACCTGAAGATGACATGGTTGTTGCCCCAGTCACCCATGTGTCC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GTCACATTAGATGGGATTCCTGAAGTGATGGAAACACAGCAGGTGCAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132144 GTCACATTAGATGGGATTCCTGAAGTGATGGAAACACAGCAGGTGCAAGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 AAAATATGCAGACTCACCGGGAGCCTCATCACCAGAACAGCCTAAGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132194 AAAATATGCAGACTCACCGGGAGCCTCATCACCAGAACAGCCTAAGAGGA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 AAAAAG         GAAGAAAAACTAAACCACCACGACCAGATTCCCCA
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132244 AAAAAGGTA...CAGGAAGAAAAACTAAACCACCACGACCAGATTCCCCA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 GCCACTACGCCAAATATATCTGTGAAGAAGAAAAACAAAGATGGAAAGG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 138165 GCCACTACGCCAAATATATCTGTGAAGAAGAAAAACAAAGATGGAAAGGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    614         GAAACACAATTTATCTTTGGGAGTTTTTACTGGCACTGCTCC
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138215 TA...CAGGAAACACAATTTATCTTTGGGAGTTTTTACTGGCACTGCTCC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 AGGACAAGGCTACTTGTCCTAAATACATCAAGTGGACCCAGCGAGAGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138953 AGGACAAGGCTACTTGTCCTAAATACATCAAGTGGACCCAGCGAGAGAAA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 GGCATTTTTAAATTGGTGGATTCTAAAGCAGTGTCCAGGTTGTGGGGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139003 GGCATTTTTAAATTGGTGGATTCTAAAGCAGTGTCCAGGTTGTGGGGGAA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 GCACAAAAACAAACCTGATATGAATTATGAGACCATGGGAAGAGCACTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139053 GCACAAAAACAAACCTGATATGAATTATGAGACCATGGGAAGAGCACTCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 G         GTACTATTACCAAAGGGGTATTCTGGCAAAAGTGGAAGGT
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139103 GGTA...TAGGTACTATTACCAAAGGGGTATTCTGGCAAAAGTGGAAGGT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 CAGCGCTTGGTGTATCAGTTTAAAGAAATGCCAAAAGATCTTATATATAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140725 CAGCGCTTGGTGTATCAGTTTAAAGAAATGCCAAAAGATCTTATATATAT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 AAATGATGAGGATCCAAGTTCCAGCATAGAGTCTTCAGATCCATCACTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
 140775 AAATGATGAGGATCCAAGTTCCAGCATAGAGTCTTCAGATCCATCGCTAT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 CTTCATCAGCCACTTCAAATAGGAATCAAACCAGCCGGTCGAGAGTATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140825 CTTCATCAGCCACTTCAAATAGGAATCAAACCAGCCGGTCGAGAGTATCT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 TCAAGTCCAGGGGTAAAAGGAGGAGCCACTACAGTTCTAAAACCAGGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140875 TCAAGTCCAGGGGTAAAAGGAGGAGCCACTACAGTTCTAAAACCAGGGAA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1047 TTCTAAAGCTGCAAAACCCAAAGATCCTGTGGAAGTTGCACAACCATCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140925 TTCTAAAGCTGCAAAACCCAAAGATCCTGTGGAAGTTGCACAACCATCAG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1097 AAGTTTTGAGGACAGTGCAGCCCACGCAGTCTCCATATCCTACCCAGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140975 AAGTTTTGAGGACAGTGCAGCCCACGCAGTCTCCATATCCTACCCAGCTC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1147 TTCCGGACTGTTCATGTAGTACAGCCAGTACAGGCTGTCCCAGAGGGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141025 TTCCGGACTGTTCATGTAGTACAGCCAGTACAGGCTGTCCCAGAGGGAGA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1197 AGCAGCTAGAACCAGTACCATGCAGGATGAAACATTAAATTCTTCCGTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141075 AGCAGCTAGAACCAGTACCATGCAGGATGAAACATTAAATTCTTCCGTTC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1247 AGAGTATTAG         GACTATACAGGCTCCAACCCAAGTTCCAGTG
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 141125 AGAGTATTAGGTG...TAGGACTATACAGGCTCCAACCCAAGTTCCAGTG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1288 GTTGTGTCTCCTAGGAATCAGCAGTTGCATACAGTAACACTCCAAACAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148058 GTTGTGTCTCCTAGGAATCAGCAGTTGCATACAGTAACACTCCAAACAGT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1338 GCCACTCACAACAGTTATAGCCAGCACAGATCCATCAGCAGGTACTGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148108 GCCACTCACAACAGTTATAGCCAGCACAGATCCATCAGCAGGTACTGGAT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1388 CTCAGAAGTTTATTTTACAAGCCATTCCATCATCACAGCCCATGACAGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148158 CTCAGAAGTTTATTTTACAAGCCATTCCATCATCACAGCCCATGACAGTA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1438 CTGAAAGAAAATGTCATGCTGCAGTCACAAAAGGCGGGCTCTCCTCCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148208 CTGAAAGAAAATGTCATGCTGCAGTCACAAAAGGCGGGCTCTCCTCCTTC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1488 AATTGTCTTGGGCCCTGCCCAGGTTCAGCAGGTCCTTACTAGCAATGTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148258 AATTGTCTTGGGCCCTGCCCAGGTTCAGCAGGTCCTTACTAGCAATGTTC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1538 AGACCATTTGCAATGGAACCGTCAGTGTGGCTTCCTCTCCATCCTTCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148308 AGACCATTTGCAATGGAACCGTCAGTGTGGCTTCCTCTCCATCCTTCAGT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1588 GCTACTGCACCTGTGGTGACCTTTTCTCCTCGCAGTTCACAGCTGGTTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148358 GCTACTGCACCTGTGGTGACCTTTTCTCCTCGCAGTTCACAGCTGGTTGC

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1638 TCACCCACCTGGCACTGTAATCACTTCAGTTATCAAAACTCAAGAAACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148408 TCACCCACCTGGCACTGTAATCACTTCAGTTATCAAAACTCAAGAAACAA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1688 AAACTCTTACACAGGAAGTAGAGAAAAAGGAATCTGAAGATCATTTGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148458 AAACTCTTACACAGGAAGTAGAGAAAAAGGAATCTGAAGATCATTTGAAA

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1738 GAGAACACTGAGAAAACGGAGCAGCAGCCACAGCCTTATGTGATGGTAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148508 GAGAACACTGAGAAAACGGAGCAGCAGCCACAGCCTTATGTGATGGTAGT

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1788 GTCCAGTTCCAATGGATTTACTTCTCAGGTAGCTATGAAACAAAACGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148558 GTCCAGTTCCAATGGATTTACTTCTCAGGTAGCTATGAAACAAAACGAAC

   1900     .    :    .    :
   1838 TGCTGGAACCCAACTCTTTT
        ||||||||||||||||||||
 148608 TGCTGGAACCCAACTCTTTT