seq1 = pF1KB9417.tfa, 2655 bp
seq2 = pF1KB9417/gi568815579f_41119393.tfa (gi568815579f:41119393_41359901), 240509 bp

>pF1KB9417 2655
>gi568815579f:41119393_41359901 (Chr19)

1-85  (100001-100085)   100% ->
86-308  (101244-101466)   100% ->
309-409  (101754-101854)   100% ->
410-586  (102488-102664)   100% ->
587-667  (111575-111655)   100% ->
668-783  (111791-111906)   100% ->
784-994  (118552-118762)   100% ->
995-1134  (119078-119217)   100% ->
1135-1285  (119772-119922)   100% ->
1286-1418  (123491-123623)   100% ->
1419-1510  (124224-124315)   100% ->
1511-1606  (129122-129217)   100% ->
1607-1684  (129351-129428)   100% ->
1685-1777  (132959-133051)   100% ->
1778-1899  (133454-133575)   100% ->
1900-2009  (134207-134316)   100% ->
2010-2169  (137060-137219)   100% ->
2170-2306  (138101-138237)   100% ->
2307-2655  (140161-140509)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGTGGCGGTGCCCCAGGATGGGCAGGGTCCCGCTGGCCTGGTGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGTGGCGGTGCCCCAGGATGGGCAGGGTCCCGCTGGCCTGGTGCTT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGCGCTGTGCGGCTGGGCGTGCATGGCCCCCAGGG         GCACGC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 100051 GGCGCTGTGCGGCTGGGCGTGCATGGCCCCCAGGGGTG...CAGGCACGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 AGGCTGAAGAAAGTCCCTTCGTGGGCAACCCAGGGAATATCACAGGTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101250 AGGCTGAAGAAAGTCCCTTCGTGGGCAACCCAGGGAATATCACAGGTGCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CGGGGACTCACGGGCACCCTTCGGTGTCAGCTCCAGGTTCAGGGAGAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101300 CGGGGACTCACGGGCACCCTTCGGTGTCAGCTCCAGGTTCAGGGAGAGCC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CCCCGAGGTACATTGGCTTCGGGATGGACAGATCCTGGAGCTCGCGGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101350 CCCCGAGGTACATTGGCTTCGGGATGGACAGATCCTGGAGCTCGCGGACA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 GCACCCAGACCCAGGTGCCCCTGGGTGAGGATGAACAGGATGACTGGATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101400 GCACCCAGACCCAGGTGCCCCTGGGTGAGGATGAACAGGATGACTGGATA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GTGGTCAGCCAGCTCAG         AATCACCTCCCTGCAGCTTTCCGA
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 101450 GTGGTCAGCCAGCTCAGGTG...CAGAATCACCTCCCTGCAGCTTTCCGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CACGGGACAGTACCAGTGTTTGGTGTTTCTGGGACATCAGACCTTCGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101778 CACGGGACAGTACCAGTGTTTGGTGTTTCTGGGACATCAGACCTTCGTGT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 CCCAGCCTGGCTATGTTGGGCTGGAGG         GCTTGCCTTACTTC
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 101828 CCCAGCCTGGCTATGTTGGGCTGGAGGGTG...TAGGCTTGCCTTACTTC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 CTGGAGGAGCCCGAAGACAGGACTGTGGCCGCCAACACCCCCTTCAACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102502 CTGGAGGAGCCCGAAGACAGGACTGTGGCCGCCAACACCCCCTTCAACCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 GAGCTGCCAAGCTCAGGGACCCCCAGAGCCCGTGGACCTACTCTGGCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102552 GAGCTGCCAAGCTCAGGGACCCCCAGAGCCCGTGGACCTACTCTGGCTCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 AGGATGCTGTCCCCCTGGCCACGGCTCCAGGTCACGGCCCCCAGCGCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102602 AGGATGCTGTCCCCCTGGCCACGGCTCCAGGTCACGGCCCCCAGCGCAGC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 CTGCATGTTCCAG         GGCTGAACAAGACATCCTCTTTCTCCTG
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 102652 CTGCATGTTCCAGGTG...TAGGGCTGAACAAGACATCCTCTTTCTCCTG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 CGAAGCCCATAACGCCAAGGGGGTCACCACATCCCGCACAGCCACCATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111603 CGAAGCCCATAACGCCAAGGGGGTCACCACATCCCGCACAGCCACCATCA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 CAG         TGCTCCCCCAGCAGCCCCGTAACCTCCACCTGGTCTCC
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111653 CAGGTG...CAGTGCTCCCCCAGCAGCCCCGTAACCTCCACCTGGTCTCC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 CGCCAACCCACGGAGCTGGAGGTGGCTTGGACTCCAGGCCTGAGCGGCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111829 CGCCAACCCACGGAGCTGGAGGTGGCTTGGACTCCAGGCCTGAGCGGCAT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 CTACCCCCTGACCCACTGCACCCTGCAG         GCTGTGCTGTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 111879 CTACCCCCTGACCCACTGCACCCTGCAGGTG...CAGGCTGTGCTGTCAG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 ACGATGGGATGGGCATCCAGGCGGGAGAACCAGACCCCCCAGAGGAGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118565 ACGATGGGATGGGCATCCAGGCGGGAGAACCAGACCCCCCAGAGGAGCCC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 CTCACCTCGCAAGCATCCGTGCCCCCCCATCAGCTTCGGCTAGGCAGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118615 CTCACCTCGCAAGCATCCGTGCCCCCCCATCAGCTTCGGCTAGGCAGCCT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 CCATCCTCACACCCCTTATCACATCCGCGTGGCATGCACCAGCAGCCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118665 CCATCCTCACACCCCTTATCACATCCGCGTGGCATGCACCAGCAGCCAGG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 GCCCCTCATCCTGGACCCACTGGCTTCCTGTGGAGACGCCGGAGGGAG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 118715 GCCCCTCATCCTGGACCCACTGGCTTCCTGTGGAGACGCCGGAGGGAGGT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    995        TGCCCCTGGGCCCCCCTGAGAACATTAGTGCTACGCGGAATGG
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118765 A...CAGTGCCCCTGGGCCCCCCTGAGAACATTAGTGCTACGCGGAATGG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 GAGCCAGGCCTTCGTGCATTGGCAAGAGCCCCGGGCGCCCCTGCAGGGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119121 GAGCCAGGCCTTCGTGCATTGGCAAGAGCCCCGGGCGCCCCTGCAGGGTA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1088 CCCTGTTAGGGTACCGGCTGGCGTATCAAGGCCAGGACACCCCAGAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 119171 CCCTGTTAGGGTACCGGCTGGCGTATCAAGGCCAGGACACCCCAGAGGTG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1135       GTGCTAATGGACATAGGGCTAAGGCAAGAGGTGACCCTGGAGCT
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119221 ...TAGGTGCTAATGGACATAGGGCTAAGGCAAGAGGTGACCCTGGAGCT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1179 GCAGGGGGACGGGTCTGTGTCCAATCTGACAGTGTGTGTGGCAGCCTACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119816 GCAGGGGGACGGGTCTGTGTCCAATCTGACAGTGTGTGTGGCAGCCTACA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1229 CTGCTGCTGGGGATGGACCCTGGAGCCTCCCAGTACCCCTGGAGGCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119866 CTGCTGCTGGGGATGGACCCTGGAGCCTCCCAGTACCCCTGGAGGCCTGG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1279 CGCCCAG         TGAAGGAACCTTCAACTCCTGCCTTCTCGTGGCC
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119916 CGCCCAGGTA...TAGTGAAGGAACCTTCAACTCCTGCCTTCTCGTGGCC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1320 CTGGTGGTATGTACTGCTAGGAGCAGTCGTGGCCGCTGCCTGTGTCCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123525 CTGGTGGTATGTACTGCTAGGAGCAGTCGTGGCCGCTGCCTGTGTCCTCA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1370 TCTTGGCTCTCTTCCTTGTCCACCGGCGAAAGAAGGAGACCCGTTATGG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 123575 TCTTGGCTCTCTTCCTTGTCCACCGGCGAAAGAAGGAGACCCGTTATGGG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1419         AGAAGTGTTTGAACCAACAGTGGAAAGAGGTGAACTGGTAGT
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123625 TG...CAGAGAAGTGTTTGAACCAACAGTGGAAAGAGGTGAACTGGTAGT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1461 CAGGTACCGCGTGCGCAAGTCCTACAGTCGTCGGACCACTGAAGCTACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124266 CAGGTACCGCGTGCGCAAGTCCTACAGTCGTCGGACCACTGAAGCTACCT

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1511          TGAACAGCCTGGGCATCAGTGAAGAGCTGAAGGAGAAGCTG
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124316 GTA...CAGTGAACAGCCTGGGCATCAGTGAAGAGCTGAAGGAGAAGCTG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1552 CGGGATGTGATGGTGGACCGGCACAAGGTGGCCCTGGGGAAGACTCTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129163 CGGGATGTGATGGTGGACCGGCACAAGGTGGCCCTGGGGAAGACTCTGGG

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1602 AGAGG         GAGAGTTTGGAGCTGTGATGGAAGGCCAGCTCAACC
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129213 AGAGGGTG...CAGGAGAGTTTGGAGCTGTGATGGAAGGCCAGCTCAACC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1643 AGGACGACTCCATCCTCAAGGTGGCTGTGAAGACGATGAAGA        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 129387 AGGACGACTCCATCCTCAAGGTGGCTGTGAAGACGATGAAGAGTG...AA

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1685  TTGCCATCTGCACGAGGTCAGAGCTGGAGGATTTCCTGAGTGAAGCGGT
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132958 GTTGCCATCTGCACGAGGTCAGAGCTGGAGGATTTCCTGAGTGAAGCGGT

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1734 CTGCATGAAGGAATTTGACCATCCCAACGTCATGAGGCTCATCG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 133008 CTGCATGAAGGAATTTGACCATCCCAACGTCATGAGGCTCATCGGTG...

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1778    GTGTCTGTTTCCAGGGTTCTGAACGAGAGAGCTTCCCAGCACCTGTG
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133451 CAGGTGTCTGTTTCCAGGGTTCTGAACGAGAGAGCTTCCCAGCACCTGTG

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1825 GTCATCTTACCTTTCATGAAACATGGAGACCTACACAGCTTCCTCCTCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133501 GTCATCTTACCTTTCATGAAACATGGAGACCTACACAGCTTCCTCCTCTA

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1875 TTCCCGGCTCGGGGACCAGCCAGTG         TACCTGCCCACTCAGA
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 133551 TTCCCGGCTCGGGGACCAGCCAGTGGTA...CAGTACCTGCCCACTCAGA

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1916 TGCTAGTGAAGTTCATGGCAGACATCGCCAGTGGCATGGAGTATCTGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134223 TGCTAGTGAAGTTCATGGCAGACATCGCCAGTGGCATGGAGTATCTGAGT

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1966 ACCAAGAGATTCATACACCGGGACCTGGCGGCCAGGAACTGCAT      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 134273 ACCAAGAGATTCATACACCGGGACCTGGCGGCCAGGAACTGCATGTG...

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2010    GCTGAATGAGAACATGTCCGTGTGTGTGGCGGACTTCGGGCTCTCCA
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137057 CAGGCTGAATGAGAACATGTCCGTGTGTGTGGCGGACTTCGGGCTCTCCA

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2057 AGAAGATCTACAATGGGGACTACTACCGCCAGGGACGTATCGCCAAGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137107 AGAAGATCTACAATGGGGACTACTACCGCCAGGGACGTATCGCCAAGATG

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2107 CCAGTCAAGTGGATTGCCATTGAGAGTCTAGCTGACCGTGTCTACACCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137157 CCAGTCAAGTGGATTGCCATTGAGAGTCTAGCTGACCGTGTCTACACCAG

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2157 CAAGAGCGATGTG         TGGTCCTTCGGGGTGACAATGTGGGAGA
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 137207 CAAGAGCGATGTGGTA...CAGTGGTCCTTCGGGGTGACAATGTGGGAGA

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2198 TTGCCACAAGAGGCCAAACCCCATATCCGGGCGTGGAGAACAGCGAGATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138129 TTGCCACAAGAGGCCAAACCCCATATCCGGGCGTGGAGAACAGCGAGATT

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2248 TATGACTATCTGCGCCAGGGAAATCGCCTGAAGCAGCCTGCGGACTGTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138179 TATGACTATCTGCGCCAGGGAAATCGCCTGAAGCAGCCTGCGGACTGTCT

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2298 GGATGGACT         GTATGCCTTGATGTCGCGGTGCTGGGAGCTAA
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 138229 GGATGGACTGTG...TAGGTATGCCTTGATGTCGCGGTGCTGGGAGCTAA

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2339 ATCCCCAGGACCGGCCAAGTTTTACAGAGCTGCGGGAAGATTTGGAGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140193 ATCCCCAGGACCGGCCAAGTTTTACAGAGCTGCGGGAAGATTTGGAGAAC

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2389 ACACTGAAGGCCTTGCCTCCTGCCCAGGAGCCTGACGAAATCCTCTATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140243 ACACTGAAGGCCTTGCCTCCTGCCCAGGAGCCTGACGAAATCCTCTATGT

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2439 CAACATGGATGAGGGTGGAGGTTATCCTGAACCCCCTGGAGCTGCAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140293 CAACATGGATGAGGGTGGAGGTTATCCTGAACCCCCTGGAGCTGCAGGAG

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2489 GAGCTGACCCCCCAACCCAGCCAGACCCTAAGGATTCCTGTAGCTGCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140343 GAGCTGACCCCCCAACCCAGCCAGACCCTAAGGATTCCTGTAGCTGCCTC

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2539 ACTGCGGCTGAGGTCCATCCTGCTGGACGCTATGTCCTCTGCCCTTCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140393 ACTGCGGCTGAGGTCCATCCTGCTGGACGCTATGTCCTCTGCCCTTCCAC

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2589 AACCCCTAGCCCCGCTCAGCCTGCTGATAGGGGCTCCCCAGCAGCCCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140443 AACCCCTAGCCCCGCTCAGCCTGCTGATAGGGGCTCCCCAGCAGCCCCAG

   2800     .    :    .
   2639 GGCAGGAGGATGGTGCC
        |||||||||||||||||
 140493 GGCAGGAGGATGGTGCC