seq1 = pF1KB9415.tfa, 2070 bp
seq2 = pF1KB9415/gi568815575r_119489355.tfa (gi568815575r:119489355_119692497), 203143 bp

>pF1KB9415 2070
>gi568815575r:119489355_119692497 (ChrX)

(complement)

1-115  (100001-100115)   100% ->
116-2070  (101189-103143)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAAAAAATTCTCCAAATGGCTGAAGGTATTGATATTGGGGAGATGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAAAAAATTCTCCAAATGGCTGAAGGTATTGATATTGGGGAGATGCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TTCATATGATCTGGTGCTGTCCAAACCTTCCAAAGGTCAAAAACGCCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TTCATATGATCTGGTGCTGTCCAAACCTTCCAAAGGTCAAAAACGCCACC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCTCAACATGTGATG         GTCAAAATCCTCCTAAAAAGCAAGCC
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 100101 TCTCAACATGTGATGGTG...TAGGTCAAAATCCTCCTAAAAAGCAAGCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GGTTCCAAATTCCATGCGAGACCTCGTTTTGAGCCTGTACATTTTGTAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101215 GGTTCCAAATTCCATGCGAGACCTCGTTTTGAGCCTGTACATTTTGTAGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TAGTAGTTCAAAAGATGAAAGACAGGAAGATCCTTATGGCCCTCAAACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101265 TAGTAGTTCAAAAGATGAAAGACAGGAAGATCCTTATGGCCCTCAAACAA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 AAGAGGTAAATGAACAAACACATTTTGCCAGCATGCCAAGAGACATCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101315 AAGAGGTAAATGAACAAACACATTTTGCCAGCATGCCAAGAGACATCTAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 CAAGATTATACTCAAGACTCTTTCAGTATACAAGATGGGAATTCTCAGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101365 CAAGATTATACTCAAGACTCTTTCAGTATACAAGATGGGAATTCTCAGTA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 TTGTGATTCATCAGGATTCATTCTCACAAAAGACCAGCCTGTAACAGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101415 TTGTGATTCATCAGGATTCATTCTCACAAAAGACCAGCCTGTAACAGCCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 ACATGTATTTTGACAGTGGGAACCCTGCCCCAAGCACCACATCACAGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101465 ACATGTATTTTGACAGTGGGAACCCTGCCCCAAGCACCACATCACAGCAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 GCAAACTCTCAGTCAACTCCTGAGCCTTCACCATCACAGACATTTCCCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101515 GCAAACTCTCAGTCAACTCCTGAGCCTTCACCATCACAGACATTTCCCGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 GTCTGTGGTAGCCGAGAAGCAGTATTTTATTGAAAAATTAACGGCGACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101565 GTCTGTGGTAGCCGAGAAGCAGTATTTTATTGAAAAATTAACGGCGACAA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 TCTGGAAGAACCTTTCTAATCCAGAAATGACTTCTGGATCTGATAAAATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101615 TCTGGAAGAACCTTTCTAATCCAGAAATGACTTCTGGATCTGATAAAATT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 AATTATACATATATGTTAACTCGTTGTATTCAGGCGTGTAAGACAAATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101665 AATTATACATATATGTTAACTCGTTGTATTCAGGCGTGTAAGACAAATCC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 TGAGTATATATATGCTCCTTTAAAGGAAATTCCTCCTGCCGACATCCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101715 TGAGTATATATATGCTCCTTTAAAGGAAATTCCTCCTGCCGACATCCCCA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 AAAATAAAAAACTTCTAACTGATGGCTATGCTTGTGAAGTTAGATGCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101765 AAAATAAAAAACTTCTAACTGATGGCTATGCTTGTGAAGTTAGATGCCAA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 AATATCTACTTAACTACAGGTTATGCTGGCAGCAAGAATGGGTCCAGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101815 AATATCTACTTAACTACAGGTTATGCTGGCAGCAAGAATGGGTCCAGGGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    792 TCGAGCTACAGAGCTAGCTGTAAAACTCTTGCAGAAACGTATTGAAGTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101865 TCGAGCTACAGAGCTAGCTGTAAAACTCTTGCAGAAACGTATTGAAGTTA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    842 GAGTTGTCCGGCGGAAATTCAAGCATACATTTGGAGAGGACCTCGTGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101915 GAGTTGTCCGGCGGAAATTCAAGCATACATTTGGAGAGGACCTCGTGGTG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    892 TGTCAGATTGGCATGTCCTCCTATGAATTTCCTCCAGCTCTGAAGCCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101965 TGTCAGATTGGCATGTCCTCCTATGAATTTCCTCCAGCTCTGAAGCCACC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    942 AGAAGATCTGGTGGTGCTGGGTAAAGATGCTTCCGGGCAGCCAATTTTTA
        |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102015 AGAAGACCTGGTGGTGCTGGGTAAAGATGCTTCCGGGCAGCCAATTTTTA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    992 ATGCTTCTGCCAAACACTGGACCAATTTTGTCATTACAGAAAATGCAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102065 ATGCTTCTGCCAAACACTGGACCAATTTTGTCATTACAGAAAATGCAAAT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1042 GATGCAATTGGTATCCTTAACAATTCTGCCTCATTCAACAAGATGTCAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102115 GATGCAATTGGTATCCTTAACAATTCTGCCTCATTCAACAAGATGTCAAT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1092 TGAATACAAATATGAGATGATGCCAAATCGCACATGGCGTTGTCGAGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102165 TGAATACAAATATGAGATGATGCCAAATCGCACATGGCGTTGTCGAGTGT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1142 TTTTACAAGATCACTGCTTAGCTGAAGGTTATGGAACCAAGAAAACAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102215 TTTTACAAGATCACTGCTTAGCTGAAGGTTATGGAACCAAGAAAACAAGT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1192 AAACATGCAGCTGCCGACGAGGCTTTGAAAATTCTTCAAAAAACACAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102265 AAACATGCAGCTGCCGACGAGGCTTTGAAAATTCTTCAAAAAACACAGCC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1242 CACTTATCCATCTGTCAAAAGTTCACAATGCCATACAGGCTCTTCACCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102315 CACTTATCCATCTGTCAAAAGTTCACAATGCCATACAGGCTCTTCACCCA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1292 GAGGATCTGGAAAGAAGAAAGATATAAAGGATCTTGTAGTTTATGAGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102365 GAGGATCTGGAAAGAAGAAAGATATAAAGGATCTTGTAGTTTATGAGAAT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1342 TCTTCAAATCCCGTGTGCACGCTGAACGACACAGCTCAGTTTAACCGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102415 TCTTCAAATCCCGTGTGCACGCTGAACGACACAGCTCAGTTTAACCGAAT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1392 GACAGTTGAGTATGTCTATGAAAGGATGACAGGCCTCCGCTGGAAATGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102465 GACAGTTGAGTATGTCTATGAAAGGATGACAGGCCTCCGCTGGAAATGCA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1442 AAGTGATTCTAGAGAGTGAAGTAATTGCAGAAGCAGTTGGGGTGAAGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102515 AAGTGATTCTAGAGAGTGAAGTAATTGCAGAAGCAGTTGGGGTGAAGAAA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1492 ACTGTCAAATATGAAGCTGCTGGGGAAGCTGTGAAAACCCTCAAAAAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102565 ACTGTCAAATATGAAGCTGCTGGGGAAGCTGTGAAAACCCTCAAAAAGAC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1542 CCAGCCAACTGTCATTAACAACTTGAAGAAAGGAGCTGTTGAAGATGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102615 CCAGCCAACTGTCATTAACAACTTGAAGAAAGGAGCTGTTGAAGATGTGA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1592 TTTCAAGAAATGAAATTCAGGGCCGCTCAGCAGAGGAGGCTTACAAACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102665 TTTCAAGAAATGAAATTCAGGGCCGCTCAGCAGAGGAGGCTTACAAACAG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1642 CAAATCAAAGAAGATAATATTGGAAATCAGCTGCTGAGAAAGATGGGTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102715 CAAATCAAAGAAGATAATATTGGAAATCAGCTGCTGAGAAAGATGGGTTG

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1692 GACTGGTGGTGGTTTAGGTAAATCTGGTGAGGGCATACGGGAGCCTATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102765 GACTGGTGGTGGTTTAGGTAAATCTGGTGAGGGCATACGGGAGCCTATCT

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1742 CAGTGAAAGAGCAGCATAAGCGGGAAGGGCTTGGTCTGGATGTAGAGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102815 CAGTGAAAGAGCAGCATAAGCGGGAAGGGCTTGGTCTGGATGTAGAGAGG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1792 GTGAATAAAATTGCCAAGAGAGATATTGAACAGATCATCAGAAACTACGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102865 GTGAATAAAATTGCCAAGAGAGATATTGAACAGATCATCAGAAACTACGC

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1842 CCGCTCCGAGAGCCACACAGATTTGACTTTCTCTAGAGAGCTGACTAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102915 CCGCTCCGAGAGCCACACAGATTTGACTTTCTCTAGAGAGCTGACTAATG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1892 ATGAACGGAAGCAAATACATCAGATTGCCCAGAAGTATGGTCTTAAGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102965 ATGAACGGAAGCAAATACATCAGATTGCCCAGAAGTATGGTCTTAAGAGT

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1942 AAGTCTCATGGGGTGGGCCATGATAGGTACCTAGTGGTAGGTAGAAAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103015 AAGTCTCATGGGGTGGGCCATGATAGGTACCTAGTGGTAGGTAGAAAAAG

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1992 ACGGAAGGAAGACCTACTAGATCAGCTCAAACAGGAAGGCCAAGTGGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103065 ACGGAAGGAAGACCTACTAGATCAGCTCAAACAGGAAGGCCAAGTGGGCC

   2050     .    :    .    :    .
   2042 ATTACGAGCTTGTTATGCCTCAAGCAAAT
        |||||||||||||||||||||||||||||
 103115 ATTACGAGCTTGTTATGCCTCAAGCAAAT