seq1 = pF1KB9387.tfa, 864 bp
seq2 = pF1KB9387/gi568815582r_30892824.tfa (gi568815582r:30892824_31101603), 208780 bp

>pF1KB9387 864
>gi568815582r:30892824_31101603 (Chr16)

(complement)

1-30  (91208-91237)   100% ->
31-105  (100001-100075)   100% ->
106-205  (100411-100510)   100% ->
206-280  (100602-100676)   100% ->
281-354  (104029-104102)   100% ->
355-463  (104545-104653)   100% ->
464-537  (104848-104921)   100% ->
538-675  (108120-108257)   100% ->
676-786  (108364-108474)   100% ->
787-864  (108703-108780)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAAGGATCGGACTCAAGAGCTGCGGAGT         GCGAAAGACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
  91208 ATGAAGGATCGGACTCAAGAGCTGCGGAGTGTG...CAGGCGAAAGACAG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 TGATGATGAAGAGGAGGTGGTCCACGTGGATCGGGACCACTTCATGGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100012 TGATGATGAAGAGGAGGTGGTCCACGTGGATCGGGACCACTTCATGGATG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 AGTTCTTTGAACAG         GTGGAAGAGATCCGGGGCTGCATTGAG
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 100062 AGTTCTTTGAACAGGTA...CAGGTGGAAGAGATCCGGGGCTGCATTGAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 AAACTGTCGGAGGATGTGGAGCAGGTGAAAAAACAGCATAGCGCCATCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100438 AAACTGTCGGAGGATGTGGAGCAGGTGAAAAAACAGCATAGCGCCATCCT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 GGCCGCACCCAACCCAGATGAGA         AGACCAAACAGGAGCTGG
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 100488 GGCCGCACCCAACCCAGATGAGAGTG...CAGAGACCAAACAGGAGCTGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    224 AGGATCTCACTGCAGACATCAAGAAGACGGCCAACAAGGTTCGGTCCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100620 AGGATCTCACTGCAGACATCAAGAAGACGGCCAACAAGGTTCGGTCCAAA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 TTGAAAG         CGATCGAGCAAAGCATTGAACAGGAGGAGGGGCT
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100670 TTGAAAGGTG...CAGCGATCGAGCAAAGCATTGAACAGGAGGAGGGGCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    315 GAACCGTTCCTCCGCGGACCTGCGCATCCGCAAGACCCAG         C
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 104063 GAACCGTTCCTCCGCGGACCTGCGCATCCGCAAGACCCAGGTA...TAGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    356 ACTCCACACTGTCCCGGAAGTTCGTGGAGGTAATGACCGAATATAACGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104546 ACTCCACACTGTCCCGGAAGTTCGTGGAGGTAATGACCGAATATAACGCG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    406 ACCCAGTCCAAGTACCGGGACCGCTGCAAGGACCGGATCCAGCGGCAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104596 ACCCAGTCCAAGTACCGGGACCGCTGCAAGGACCGGATCCAGCGGCAACT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    456 GGAGATCA         CTGGAAGGACCACCACCAACGAAGAACTGGAAG
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 104646 GGAGATCAGTG...CAGCTGGAAGGACCACCACCAACGAAGAACTGGAAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    497 ACATGCTGGAGAGCGGGAAGCTGGCCATCTTCACAGATGAC         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 104881 ACATGCTGGAGAGCGGGAAGCTGGCCATCTTCACAGATGACGTG...TAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    538 ATCAAAATGGACTCACAGATGACGAAGCAGGCGCTGAATGAGATTGAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108120 ATCAAAATGGACTCACAGATGACGAAGCAGGCGCTGAATGAGATTGAGAC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    588 GAGGCACAATGAGATCATCAAGCTGGAGACCAGCATCCGCGAGCTGCACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108170 GAGGCACAATGAGATCATCAAGCTGGAGACCAGCATCCGCGAGCTGCACG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    638 ATATGTTTGTGGACATGGCCATGCTCGTAGAGAGCCAG         GGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 108220 ATATGTTTGTGGACATGGCCATGCTCGTAGAGAGCCAGGTA...CAGGGA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    679 GAGATGATTGACCGCATCGAGTACAACGTGGAACATTCTGTGGACTACGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108367 GAGATGATTGACCGCATCGAGTACAACGTGGAACATTCTGTGGACTACGT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    729 GGAGCGAGCTGTGTCTGACACCAAGAAAGCAGTGAAATATCAGAGCAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108417 GGAGCGAGCTGTGTCTGACACCAAGAAAGCAGTGAAATATCAGAGCAAGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    779 CCCGGAGG         AAGAAAATCATGATCATCATTTGCTGTGTGGTG
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 108467 CCCGGAGGGTG...CAGAAGAAAATCATGATCATCATTTGCTGTGTGGTG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .
    820 CTGGGGGTGGTCTTGGCGTCATCCATTGGGGGGACGCTGGGCTTG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108736 CTGGGGGTGGTCTTGGCGTCATCCATTGGGGGGACGCTGGGCTTG