seq1 = pF1KB9295.tfa, 609 bp
seq2 = pF1KB9295/gi568815583r_83051215.tfa (gi568815583r:83051215_83307414), 256200 bp

>pF1KB9295 609
>gi568815583r:83051215_83307414 (Chr15)

(complement)

1-84  (100001-100084)   100% ->
85-161  (143340-143416)   100% ->
162-300  (149374-149512)   100% ->
301-459  (149842-150000)   100% ->
460-609  (156054-156200)   98%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGCGTCCGCGGCCCCGCGAGTACAAAGCGGGCGACCTGGTCTTCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGCGTCCGCGGCCCCGCGAGTACAAAGCGGGCGACCTGGTCTTCGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CAAGATGAAGGGCTACCCGCACTGGCCGGCCCGG         ATTGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 100051 CAAGATGAAGGGCTACCCGCACTGGCCGGCCCGGGTG...TAGATTGATG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 AACTCCCAGAGGGCGCTGTGAAGCCTCCAGCAAACAAGTATCCTATCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143347 AACTCCCAGAGGGCGCTGTGAAGCCTCCAGCAAACAAGTATCCTATCTTC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TTTTTTGGCACCCATGAAAC         TGCATTTCTAGGTCCCAAAGA
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 143397 TTTTTTGGCACCCATGAAACGTA...CAGTGCATTTCTAGGTCCCAAAGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 CCTTTTTCCATATAAGGAGTACAAAGACAAGTTTGGAAAGTCAAACAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 149395 CCTTTTTCCATATAAGGAGTACAAAGACAAGTTTGGAAAGTCAAACAAAC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 GGAAAGGATTTAACGAAGGATTGTGGGAAATAGAAAATAACCCAGGAGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 149445 GGAAAGGATTTAACGAAGGATTGTGGGAAATAGAAAATAACCCAGGAGTA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 AAGTTTACTGGCTACCAG         GCAATTCAGCAACAGAGCTCTTC
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 149495 AAGTTTACTGGCTACCAGGTA...TAGGCAATTCAGCAACAGAGCTCTTC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 AGAAACTGAGGGAGAAGGTGGAAATACTGCAGATGCAAGCAGTGAGGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 149865 AGAAACTGAGGGAGAAGGTGGAAATACTGCAGATGCAAGCAGTGAGGAAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 AAGGTGATAGAGTAGAAGAAGATGGAAAAGGCAAAAGAAAGAATGAAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 149915 AAGGTGATAGAGTAGAAGAAGATGGAAAAGGCAAAAGAAAGAATGAAAAA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GCAGGCTCAAAACGGAAAAAGTCATATACTTCAAAG         AAATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 149965 GCAGGCTCAAAACGGAAAAAGTCATATACTTCAAAGGTT...TAGAAATC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 CTCTAAACAGTCCCGGAAATCTCCAGGAGATGAAGATGACAAAGACTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 156059 CTCTAAACAGTCCCGGAAATCTCCAGGAGATGAAGATGACAAAGACTGCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 AAGAAGAGGAAAACAAAAGCAGCTCTGAGGGTGGAGATGCGGGCAACGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 156109 AAGAAGAGGAAAACAAAAGCAGCTCTGAGGGTGGAGATGCGGGCAACGAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .
    565 ACAAGAAACACAACTTCAGACTTGCAGAAAACCAGTGAAGGGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||---
 156159 ACAAGAAACACAACTTCAGACTTGCAGAAAACCAGTGAAGGG