seq1 = pF1KB9284.tfa, 585 bp
seq2 = pF1KB9284/gi568815596r_130952906.tfa (gi568815596r:130952906_131182646), 229741 bp

>pF1KB9284 585
>gi568815596r:130952906_131182646 (Chr2)

(complement)

1-70  (100001-100070)   100% ->
71-154  (110709-110792)   100% ->
155-297  (126952-127094)   100% ->
298-475  (127198-127375)   100% ->
476-585  (129632-129741)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAATCCTGTTTATAGTCCTGGATCTTCTGGGGTTCCCTATGCAAATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAATCCTGTTTATAGTCCTGGATCTTCTGGGGTTCCCTATGCAAATGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CAAAGGAATTGGTTATCCAG         CTGGTTTTCCCATGGGCTATG
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 100051 CAAAGGAATTGGTTATCCAGGTA...CAGCTGGTTTTCCCATGGGCTATG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CAGCAGCAGCTCCTGCCTATTCTCCTAACATGTATCCTGGAGCGAATCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110730 CAGCAGCAGCTCCTGCCTATTCTCCTAACATGTATCCTGGAGCGAATCCT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 ACCTTCCAAACAG         GTTACACTCCTGGCACACCTTACAAAGT
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 110780 ACCTTCCAAACAGGTA...CAGGTTACACTCCTGGCACACCTTACAAAGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 GTCCTGTTCCCCCACCAGCGGGGCTGTGCCACCGTACTCCTCCTCCCCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126980 GTCCTGTTCCCCCACCAGCGGGGCTGTGCCACCGTACTCCTCCTCCCCGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 ACCCCTACCAGACTGCCGTGTACCCTGTGCGAAGTGCCTACCCCCAGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127030 ACCCCTACCAGACTGCCGTGTACCCTGTGCGAAGTGCCTACCCCCAGCAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 AGCCCGTATGCACAG         CAAGGCACGTACTACACACAGCCGCT
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 127080 AGCCCGTATGCACAGGTA...CAGCAAGGCACGTACTACACACAGCCGCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 GTATGCAGCACCTCCTCACGTCATCCACCACACCACGGTGGTGCAGCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127224 GTATGCAGCACCTCCTCACGTCATCCACCACACCACGGTGGTGCAGCCCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 ACGGCATGCCTGCAACGGTGTACCCTGCTCCCATCCCCCCTCCTAGAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127274 ACGGCATGCCTGCAACGGTGTACCCTGCTCCCATCCCCCCTCCTAGAGGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 AACGGGGTCACCATGGGCATGGTGGCTGGGACCACCATGGCCATGTCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127324 AACGGGGTCACCATGGGCATGGTGGCTGGGACCACCATGGCCATGTCAGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 AG         GTACCCTGCTGACTGCTCACTCCCCAACTCCTGTCGCCC
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127374 AGGTA...CAGGTACCCTGCTGACTGCTCACTCCCCAACTCCTGTCGCCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 CCCACCCGGTCACTGTGCCCACGTACCGGGCCCCAGGAACGCCCACTTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129671 CCCACCCGGTCACTGTGCCCACGTACCGGGCCCCAGGAACGCCCACTTAC

    600     .    :    .    :
    565 AGCTATGTGCCCCCTCAGTGG
        |||||||||||||||||||||
 129721 AGCTATGTGCCCCCTCAGTGG