seq1 = pF1KB9271.tfa, 1764 bp
seq2 = pF1KB9271/gi568815579r_34659037.tfa (gi568815579r:34659037_34869556), 210520 bp

>pF1KB9271 1764
>gi568815579r:34659037_34869556 (Chr19)

(complement)

1-18  (96716-96733)   100% ->
19-145  (100002-100128)   100% ->
146-241  (102146-102241)   100% ->
242-1764  (108998-110520)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGGCGCCGGCGTTG         GCATTAGTATCATTTGAAGACGT
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
  96716 ATGGCGGCGCCGGCGTTGGTG...CAGGCATTAGTATCATTTGAAGACGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 GGTTGTGACCTTCACTGGAGAGGAATGGGGGCACCTGGACCTGGCCCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100025 GGTTGTGACCTTCACTGGAGAGGAATGGGGGCACCTGGACCTGGCCCAGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 GGACCCTGTACCAGGAGGTGATGCTGGAGACCTGCAGGCTCCTGGTCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100075 GGACCCTGTACCAGGAGGTGATGCTGGAGACCTGCAGGCTCCTGGTCTCA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CTGG         GGCATCCTGTTCCCAAACCAGAGCTGATCTATCTACT
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100125 CTGGGTA...CAGGGCATCCTGTTCCCAAACCAGAGCTGATCTATCTACT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 GGAACATGGACAGGAACTGTGGACAGTGAAGAGAGGCCTCTCCCAAAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102183 GGAACATGGACAGGAACTGTGGACAGTGAAGAGAGGCCTCTCCCAAAGCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 CCTGCGCAG         GTGAAAAAGCAAAACCCAAGATTACAGAGCCT
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 102233 CCTGCGCAGGTT...CAGGTGAAAAAGCAAAACCCAAGATTACAGAGCCT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 ACTGCTTCTCAGCTGGCCTTCTCTGAGGAATCCTCTTTCCAGGAACTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109030 ACTGCTTCTCAGCTGGCCTTCTCTGAGGAATCCTCTTTCCAGGAACTTCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 GGCACAGAGATCCTCAAGAGATTCCAGGTTGGGGCAAGCTAGAGATGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109080 GGCACAGAGATCCTCAAGAGATTCCAGGTTGGGGCAAGCTAGAGATGAGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 AAAAGCTAATAAAAATTCAGGAAGGGAACTTGAGGCCAGGAACAAACCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109130 AAAAGCTAATAAAAATTCAGGAAGGGAACTTGAGGCCAGGAACAAACCCC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 CACAAAGAGATATGCCCTGAGAAGTTGAGTTATAAACATGATGATTTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109180 CACAAAGAGATATGCCCTGAGAAGTTGAGTTATAAACATGATGATTTGGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 GCCAGATGATAGTCTGGGCTTAAGGGTTTTACAGGAACGAGTCACTCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109230 GCCAGATGATAGTCTGGGCTTAAGGGTTTTACAGGAACGAGTCACTCCAC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 AAGATGCTCTCCATGAGTGTGACTCTCAAGGACCAGGAAAAGACCCCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109280 AAGATGCTCTCCATGAGTGTGACTCTCAAGGACCAGGAAAAGACCCCATG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 ACTGATGCAAGGAATAACCCTTACACATGCACGGAATGTGGGAAAGGGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109330 ACTGATGCAAGGAATAACCCTTACACATGCACGGAATGTGGGAAAGGGTT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 TAGCAAGAAGTGGGCCCTTGTTCGGCATCAACAGATTCATGCTGGAGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109380 TAGCAAGAAGTGGGCCCTTGTTCGGCATCAACAGATTCATGCTGGAGTGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 AGCCCTATGAGTGCAATGAGTGTGGGAAAGCCTGTCGTTATATGGCTGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109430 AGCCCTATGAGTGCAATGAGTGTGGGAAAGCCTGTCGTTATATGGCTGAT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 GTCATTCGACATATGAGGCTTCATACTGGGGAAAAACCATACAAGTGTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109480 GTCATTCGACATATGAGGCTTCATACTGGGGAAAAACCATACAAGTGTAT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 TGAGTGTGGGAAAGCCTTCAAACGCAGGTTTCACCTCACGGAGCACCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109530 TGAGTGTGGGAAAGCCTTCAAACGCAGGTTTCACCTCACGGAGCACCAGC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    824 GTATTCACACCGGAGATAAGCCCTATGAGTGCAAAGAATGTGGCAAAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109580 GTATTCACACCGGAGATAAGCCCTATGAGTGCAAAGAATGTGGCAAAGCA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    874 TTCACCCACCGCTCTTCTTTTATCCAGCATAATATGACTCACACTCGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109630 TTCACCCACCGCTCTTCTTTTATCCAGCATAATATGACTCACACTCGAGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    924 AAAACCCTTTTTATGCAAAGAATGTGGGAAAGCTTTTTACTACAGCTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109680 AAAACCCTTTTTATGCAAAGAATGTGGGAAAGCTTTTTACTACAGCTCCT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    974 CATTTGCTCAACATATGAGGATTCATACTGGAAAGAAACTCTATGAGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109730 CATTTGCTCAACATATGAGGATTCATACTGGAAAGAAACTCTATGAGTGC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1024 GGTGAATGTGGAAAGGCCTTCACGCACCGCTCCACATTTATCCAGCACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109780 GGTGAATGTGGAAAGGCCTTCACGCACCGCTCCACATTTATCCAGCACAA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1074 TGTGACCCACACAGGAGAAAAACCATTTTTATGTAAAGAATGTGGAAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109830 TGTGACCCACACAGGAGAAAAACCATTTTTATGTAAAGAATGTGGAAAAA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1124 CCTTTTGCCTCAACTCATCCTTCACTCAGCACATGAGGATTCACACTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109880 CCTTTTGCCTCAACTCATCCTTCACTCAGCACATGAGGATTCACACTGGA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1174 GAGAAACCCTATGAGTGCGGTGAATGTGGAAAGGCCTTTACTCATCGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109930 GAGAAACCCTATGAGTGCGGTGAATGTGGAAAGGCCTTTACTCATCGCTC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1224 CACTTTCATCCGACATAAGAGGACCCATACCGGAGAGAAGCCCTTTGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109980 CACTTTCATCCGACATAAGAGGACCCATACCGGAGAGAAGCCCTTTGAGT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1274 GCAAAGAATGTGGGAAGGCCTTTTGTGACAGCTCTTCCTTAATTCAACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110030 GCAAAGAATGTGGGAAGGCCTTTTGTGACAGCTCTTCCTTAATTCAACAT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1324 ATGAGGATTCACACTGGTGAGAAGCCTTATGAGTGCAGTGAATGTGGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110080 ATGAGGATTCACACTGGTGAGAAGCCTTATGAGTGCAGTGAATGTGGAAA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1374 GGCTTTTACACACCACTCTGTTTTTATTCGACATAATAGGACCCACAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110130 GGCTTTTACACACCACTCTGTTTTTATTCGACATAATAGGACCCACAGTG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1424 GACAAAAACCCTTGGAGTGCAAAGAATGTGCAAAAGCCTTTTACTATAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110180 GACAAAAACCCTTGGAGTGCAAAGAATGTGCAAAAGCCTTTTACTATAGC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1474 TCTTCCTTCACTCGACACATGAGGATTCACACTGGAGAGAAGCCCTATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110230 TCTTCCTTCACTCGACACATGAGGATTCACACTGGAGAGAAGCCCTATGT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1524 TTGTAGAGAATGTGGAAAGGCTTTTACCCAACCTGCAAATTTTGTTCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110280 TTGTAGAGAATGTGGAAAGGCTTTTACCCAACCTGCAAATTTTGTTCGGC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1574 ATAATAGGATCCACACTGGAGAAAAACCTTTTGAATGCAAAGAATGTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110330 ATAATAGGATCCACACTGGAGAAAAACCTTTTGAATGCAAAGAATGTGAG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1624 AAAGCCTTCTGTGACAACTTTGCTTTAACTCAGCACATGAGAACTCACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110380 AAAGCCTTCTGTGACAACTTTGCTTTAACTCAGCACATGAGAACTCACAC

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1674 TGGAGAGAAACCCTTTGAATGCAATGAATGTGGAAAGACCTTCAGCCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110430 TGGAGAGAAACCCTTTGAATGCAATGAATGTGGAAAGACCTTCAGCCACA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :
   1724 GTTCATCGTTCACTCACCATCGAAAGATTCATACCAGAGTT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110480 GTTCATCGTTCACTCACCATCGAAAGATTCATACCAGAGTT