Result of SIM4 for pF1KB9259

seq1 = pF1KB9259.tfa, 2937 bp
seq2 = pF1KB9259/gi568815597r_34766086.tfa (gi568815597r:34766086_35005383), 239298 bp

>pF1KB9259 2937
>gi568815597r:34766086_35005383 (Chr1)

(complement)

1-1107  (100001-101107)   100% ->
1108-1313  (105111-105316)   100% ->
1314-1386  (105643-105715)   100% ->
1387-1600  (119099-119312)   100% ->
1601-1914  (119593-119906)   100% ->
1915-2000  (120321-120406)   100% ->
2001-2485  (136295-136779)   100% ->
2486-2577  (137757-137848)   100% ->
2578-2721  (138193-138336)   100% ->
2722-2937  (139083-139298)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAGGGGTTACCATGGCGACCGAGGCAGCCATCCCCGCCCAGCCCGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAGGGGTTACCATGGCGACCGAGGCAGCCATCCCCGCCCAGCCCGCTT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGCTGACCAACAGCATATGGACGTGGGCCCTGCTGCCAGGGCCCCATACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TGCTGACCAACAGCATATGGACGTGGGCCCTGCTGCCAGGGCCCCATACC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGCTGGGCTCCAGGGAGGCCTTCTCCACCGAGCCCCGCTTCTGTGCCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TGCTGGGCTCCAGGGAGGCCTTCTCCACCGAGCCCCGCTTCTGTGCCCCG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 AGAGCTGGCCTGGGACACATTTCTCCTGAAGGGCCCCTGAGCCTGAGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 AGAGCTGGCCTGGGACACATTTCTCCTGAAGGGCCCCTGAGCCTGAGTGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GGGGCCGTCGGTAGGCCCTGAGGGAGGGCCAGCGGGGGCCGGGGTTGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GGGGCCGTCGGTAGGCCCTGAGGGAGGGCCAGCGGGGGCCGGGGTTGGGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GGGGTAGCAGCACCTTCCCCAGGATGTACCCTGGCCAGGGCCCCTTCGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GGGGTAGCAGCACCTTCCCCAGGATGTACCCTGGCCAGGGCCCCTTCGAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 ACCTGTGAAGACTGTGTGGGCCACCCACAGGGCAAGGGTGCCCCCCGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 ACCTGTGAAGACTGTGTGGGCCACCCACAGGGCAAGGGTGCCCCCCGCCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GCCTCCTACACTCCTGGATCAGTTTGAAAAGCAGTTGCCAGTTCAACAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GCCTCCTACACTCCTGGATCAGTTTGAAAAGCAGTTGCCAGTTCAACAAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 ATGGCTTCCACACACTACCATACCAGCGAGGGCCAGCAGGGGCAGGGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 ATGGCTTCCACACACTACCATACCAGCGAGGGCCAGCAGGGGCAGGGCCC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GGGCCAGCGCCAGGGACGGGCACTGCCCCAGAGCCCCGCAGTGAGAGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GGGCCAGCGCCAGGGACGGGCACTGCCCCAGAGCCCCGCAGTGAGAGCCC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 TAGCCGCATCCGGCACCTGGTTCATTCTGTGCAGAAGCTCTTTGCCAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 TAGCCGCATCCGGCACCTGGTTCATTCTGTGCAGAAGCTCTTTGCCAAGT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 CCCACTCTCTGGAGGCGCCGGGGAAGCGGGACTATAATGGGCCCAAGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 CCCACTCTCTGGAGGCGCCGGGGAAGCGGGACTATAATGGGCCCAAGGCT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GAGGGAAGAGGTGGCTCTGGAGGAGACAGCTACCCCGGCCCGGGCTCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 GAGGGAAGAGGTGGCTCTGGAGGAGACAGCTACCCCGGCCCGGGCTCTGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 AGGCCCCCACACCTCCCATCACCACCATCACCACCACCATCACCACCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 AGGCCCCCACACCTCCCATCACCACCATCACCACCACCATCACCACCACC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 ACCAGTCCCGGCACGGCAAGAGGAGCAAGAGCAAGGACCGCAAGGGGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 ACCAGTCCCGGCACGGCAAGAGGAGCAAGAGCAAGGACCGCAAGGGGGAT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 GGGCGGCACCAGGCCAAGTCCACAGGCTGGTGGAGTTCCGATGACAACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 GGGCGGCACCAGGCCAAGTCCACAGGCTGGTGGAGTTCCGATGACAACTT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 GGACAGTGATAGCGGCTTCCTGGCGGGTGGGAGGCCCCCTGGGGAGCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 GGACAGTGATAGCGGCTTCCTGGCGGGTGGGAGGCCCCCTGGGGAGCCTG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 GTGGTCCCTTCTGCCTGGAGGGTCCAGATGGGTCCTACCGGGACTTGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 GTGGTCCCTTCTGCCTGGAGGGTCCAGATGGGTCCTACCGGGACTTGAGC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 TTCAAGGGGCGCTCGGGCGGGTCGGAAGGCCGCTGCCTTGCCTGCACTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 TTCAAGGGGCGCTCGGGCGGGTCGGAAGGCCGCTGCCTTGCCTGCACTGG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 CATGTCCATGTCACTGGATGGACAGTCGGTCAAGCGAAGTGCCTGGCATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 CATGTCCATGTCACTGGATGGACAGTCGGTCAAGCGAAGTGCCTGGCATA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 CCATGATGGTCAGCCAGGGCCGGGATGGATACCCGGGGGCCGGGCCAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 CCATGATGGTCAGCCAGGGCCGGGATGGATACCCGGGGGCCGGGCCAGGC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 AAGGGGCTCCTGGGTCCGGAGACCAAGGCCAAAGCCAGGACTTATCACTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 AAGGGGCTCCTGGGTCCGGAGACCAAGGCCAAAGCCAGGACTTATCACTA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 TCTGCAG         GTGCCGCAAGATGACTGGGGGGGTTACCCCACCG
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 TCTGCAGGTG...CAGGTGCCGCAAGATGACTGGGGGGGTTACCCCACCG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1142 GTGGCAAGGATGGGGAGATCCCCTGCCGCAGGATGCGGAGCGGCAGCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105145 GTGGCAAGGATGGGGAGATCCCCTGCCGCAGGATGCGGAGCGGCAGCTAC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1192 ATCAAAGCCATGGGGGATGAGGAGAGCGGAGACTCAGACGGCAGCCCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105195 ATCAAAGCCATGGGGGATGAGGAGAGCGGAGACTCAGACGGCAGCCCCAA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1242 GACATCTCCCAAAGCAGTCGCCCGACGCTTCACCACCCGTCGCTCCTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105245 GACATCTCCCAAAGCAGTCGCCCGACGCTTCACCACCCGTCGCTCCTCCA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1292 GCGTGGACCAGGCCAGGATCAA         CTGCTGTGTCCCACCCCGG
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 105295 GCGTGGACCAGGCCAGGATCAAGTA...CAGCTGCTGTGTCCCACCCCGG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1333 ATCCACCCCCGGAGCTCCATCCCTGGCTACAGCCGTTCCCTCACCACTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105662 ATCCACCCCCGGAGCTCCATCCCTGGCTACAGCCGTTCCCTCACCACTGG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1383 ACAG         CTCAGCGATGAGTTGAACCAGCAGCTGGAGGCCGTGT
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105712 ACAGGTA...CAGCTCAGCGATGAGTTGAACCAGCAGCTGGAGGCCGTGT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1424 GCGGGTCGGTGTTTGGGGAGCTGGAGTCCCAGGCCGTGGACGCCCTGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119136 GCGGGTCGGTGTTTGGGGAGCTGGAGTCCCAGGCCGTGGACGCCCTGGAC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1474 CTGCCCGGCTGTTTCCGCATGCGGAGCCACAGCTACCTCCGGGCCATCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119186 CTGCCCGGCTGTTTCCGCATGCGGAGCCACAGCTACCTCCGGGCCATCCA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1524 GGCCGGCTGCTCTCAAGACGACGACTGCCTGCCCCTCCTCGCTACCCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119236 GGCCGGCTGCTCTCAAGACGACGACTGCCTGCCCCTCCTCGCTACCCCTG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1574 CCGCTGTCTCAGGGAGGCCCGGCTCCT         CCTTCAACTTCAGA
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 119286 CCGCTGTCTCAGGGAGGCCCGGCTCCTGTG...CAGCCTTCAACTTCAGA

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1615 AAGGCCCCGCCCCCCATCCCGCCGGGAAGCCAGGCCCCGCCCCGCATCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119607 AAGGCCCCGCCCCCCATCCCGCCGGGAAGCCAGGCCCCGCCCCGCATCTC

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1665 CATCACCGCCCAGAGCAGCACCGACTCCGCGCACGAGAGCTTCACGGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119657 CATCACCGCCCAGAGCAGCACCGACTCCGCGCACGAGAGCTTCACGGCGG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1715 CCGAGGGCCCCGCCCGGCGCTGCAGCTCCGCCGACGGGCTGGACGGCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119707 CCGAGGGCCCCGCCCGGCGCTGCAGCTCCGCCGACGGGCTGGACGGCCCC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1765 GCCATGGGTGCGCGCACACTGGAGTTGGCGCCGGTGCCGCCCCGGGCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119757 GCCATGGGTGCGCGCACACTGGAGTTGGCGCCGGTGCCGCCCCGGGCCAG

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1815 CCCCAAGCCCCCCACACTCATCATCAAGACCATCCCTGGCAGGGAGGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119807 CCCCAAGCCCCCCACACTCATCATCAAGACCATCCCTGGCAGGGAGGAGC

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1865 TGCGGAGCCTGGCGCGGCAGCGGAAGTGGCGGCCGTCCATTGGGGTGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119857 TGCGGAGCCTGGCGCGGCAGCGGAAGTGGCGGCCGTCCATTGGGGTGCAG

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1915          GTGGAGACGATCTCAGATTCGGACACCGAGAACAGGAGCCG
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119907 GTA...CAGGTGGAGACGATCTCAGATTCGGACACCGAGAACAGGAGCCG

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1956 GAGGGAGTTCCACTCTATTGGCGTGCAGGTGGAAGAGGACAAGAG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 120362 GAGGGAGTTCCACTCTATTGGCGTGCAGGTGGAAGAGGACAAGAGGTA..

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2001     GCGAGCAAGGTTCAAGCGCTCCAATAGTGTGACGGCTGGCGTGCAG
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120412 .CAGGCGAGCAAGGTTCAAGCGCTCCAATAGTGTGACGGCTGGCGTGCAG

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2047 GCAGACCTGGAGCTGGAGGGCCTGGCAGGCCTGGCCACGGTGGCCACAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136341 GCAGACCTGGAGCTGGAGGGCCTGGCAGGCCTGGCCACGGTGGCCACAGA

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2097 AGACAAGGCCCTGCAGTTTGGACGCTCCTTCCAGAGGCACGCCTCTGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136391 AGACAAGGCCCTGCAGTTTGGACGCTCCTTCCAGAGGCACGCCTCTGAGC

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2147 CCCAGCCTGGGCCCCGGGCCCCCACCTACTCAGTCTTCCGCACGGTCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136441 CCCAGCCTGGGCCCCGGGCCCCCACCTACTCAGTCTTCCGCACGGTCCAC

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2197 ACGCAGGGCCAGTGGGCCTACCGCGAGGGCTACCCACTGCCGTACGAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136491 ACGCAGGGCCAGTGGGCCTACCGCGAGGGCTACCCACTGCCGTACGAGCC

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2247 GCCGGCCACCGATGGGTCGCCCGGCCCTGCCCCCGCCCCCACCCCCGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136541 GCCGGCCACCGATGGGTCGCCCGGCCCTGCCCCCGCCCCCACCCCCGGCC

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2297 CTGGGGCCGGCCGCCGTGACTCCTGGATAGAGCGCGGTTCACGTAGCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136591 CTGGGGCCGGCCGCCGTGACTCCTGGATAGAGCGCGGTTCACGTAGCCTC

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2347 CCCGACTCAGGCCGCGCATCCCCCTGCCCACGCGACGGCGAGTGGTTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136641 CCCGACTCAGGCCGCGCATCCCCCTGCCCACGCGACGGCGAGTGGTTCAT

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2397 CAAGATGCTGCGGGCAGAGGTGGAGAAGCTGGAGCACTGGTGCCAGCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136691 CAAGATGCTGCGGGCAGAGGTGGAGAAGCTGGAGCACTGGTGCCAGCAGA

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2447 TGGAGCGTGAGGCGGAGGACTATGAGCTACCCGAGGAGA         TC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 136741 TGGAGCGTGAGGCGGAGGACTATGAGCTACCCGAGGAGAGTG...TAGTC

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2488 CTGGAGAAGATCCGCAGTGCTGTGGGCAGCACACAACTTCTCCTGTCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137759 CTGGAGAAGATCCGCAGTGCTGTGGGCAGCACACAACTTCTCCTGTCCCA

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2538 GAAGGTTCAGCAGTTCTTCCGGCTGTGTCAGCAAAGCATG         G
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 137809 GAAGGTTCAGCAGTTCTTCCGGCTGTGTCAGCAAAGCATGGTG...CAGG

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2579 ATCCCACTGCGTTCCCTGTGCCCACCTTCCAGGACCTGGCGGGTTTCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138194 ATCCCACTGCGTTCCCTGTGCCCACCTTCCAGGACCTGGCGGGTTTCTGG

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2629 GACCTCCTACAGCTCTCCATCGAGGATGTGACCCTCAAGTTCCTGGAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138244 GACCTCCTACAGCTCTCCATCGAGGATGTGACCCTCAAGTTCCTGGAGCT

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2679 ACAGCAACTCAAGGCCAACAGCTGGAAACTCCTGGAGCCTAAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 138294 ACAGCAACTCAAGGCCAACAGCTGGAAACTCCTGGAGCCTAAGGTG...C

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2722   GAGGAGAAGAAGGTCCCTCCGCCGATACCAAAGAAGCCCCTGCGGGGC
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139081 AGGAGGAGAAGAAGGTCCCTCCGCCGATACCAAAGAAGCCCCTGCGGGGC

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2770 CGGGGCGTGCCGGTGAAGGAGCGCTCCCTGGACTCCGTGGACCGGCAGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139131 CGGGGCGTGCCGGTGAAGGAGCGCTCCCTGGACTCCGTGGACCGGCAGCG

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2820 GCAGGAAGCGCGCAAGCGGCTCCTGGCGGCCAAGCGCGCCGCTTCCTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139181 GCAGGAAGCGCGCAAGCGGCTCCTGGCGGCCAAGCGCGCCGCTTCCTTCC

   2950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2870 GCCACAGCTCGGCCACCGAGAGCGCCGACAGCATCGAGATCTACATCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139231 GCCACAGCTCGGCCACCGAGAGCGCCGACAGCATCGAGATCTACATCCCC

   3000     .    :    .
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