seq1 = pF1KB9213.tfa, 2517 bp
seq2 = pF1KB9213/gi568815580r_9447792.tfa (gi568815580r:9447792_9714271), 266480 bp

>pF1KB9213 2517
>gi568815580r:9447792_9714271 (Chr18)

(complement)

1-52  (99992-100046)   92% ->
53-188  (119119-119254)   100% ->
189-295  (120398-120504)   100% ->
296-438  (125419-125561)   100% ->
439-585  (126037-126183)   100% ->
586-713  (137081-137208)   100% ->
714-1240  (143589-144115)   100% ->
1241-1413  (150722-150894)   100% ->
1414-1509  (152197-152292)   100% ->
1510-1695  (154668-154853)   100% ->
1696-1857  (156890-157051)   100% ->
1858-1958  (160850-160950)   100% ->
1959-2079  (163874-163994)   100% ->
2080-2214  (164086-164220)   100% ->
2215-2356  (164934-165075)   100% ->
2357-2517  (166320-166480)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 AT GGCG  GACCTCTCGCTGCTTCAGGAGGACCTGCAGGAGGACGCAGA
         |-||||--|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  99992 CTCGGCGCAGACCTCTCGCTGCTTCAGGAGGACCTGCAGGAGGACGCAGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     48 CGGAT         TTGGTGTGGATGACTACAGCTCAGAGTCTGATGTGA
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100042 CGGATGTG...TAGTTGGTGTGGATGACTACAGCTCAGAGTCTGATGTGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     89 TTATTATACCTTCAGCCCTGGACTTTGTCTCACAAGATGAAATGTTGACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119155 TTATTATACCTTCAGCCCTGGACTTTGTCTCACAAGATGAAATGTTGACG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    139 CCCCTGGGGAGATTGGACAAGTATGCTGCAAGTGAGAACATATTTAACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119205 CCCCTGGGGAGATTGGACAAGTATGCTGCAAGTGAGAACATATTTAACAG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    189          ACAAATGGTGGCCCGGAGTTTGCTCGATACCTTGAGGGAAG
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119255 GTA...TAGACAAATGGTGGCCCGGAGTTTGCTCGATACCTTGAGGGAAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    230 TCTGCGATGATGAAAGAGATTGTATTGCTGTTTTGGAAAGAATTAGCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120439 TCTGCGATGATGAAAGAGATTGTATTGCTGTTTTGGAAAGAATTAGCAGA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    280 TTGGCCGATGATTCAG         AACCAACTGTGAGAGCGGAGCTGAT
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 120489 TTGGCCGATGATTCAGGTA...TAGAACCAACTGTGAGAGCGGAGCTGAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    321 GGAACAGGTGCCTCACATCGCACTGTTTTGTCAAGAAAACCGGCCTTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125444 GGAACAGGTGCCTCACATCGCACTGTTTTGTCAAGAAAACCGGCCTTCAA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    371 TACCATATGCTTTTTCAAAATTCTTACTACCTATTGTGGTTAGATACCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125494 TACCATATGCTTTTTCAAAATTCTTACTACCTATTGTGGTTAGATACCTT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    421 GCAGATCAGAATAATCAG         GTGAGGAAAACAAGTCAGGCAGC
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 125544 GCAGATCAGAATAATCAGGTA...TAGGTGAGGAAAACAAGTCAGGCAGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    462 TTTGCTGGCTCTGTTGGAGCAGGAGCTCATTGAACGATTTGATGTGGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126060 TTTGCTGGCTCTGTTGGAGCAGGAGCTCATTGAACGATTTGATGTGGAGA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    512 CCAAAGTGTGCCCTGTCCTCATAGAGCTGACAGCCCCAGATAGCAATGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126110 CCAAAGTGTGCCCTGTCCTCATAGAGCTGACAGCCCCAGATAGCAATGAT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    562 GATGTGAAAACAGAAGCTGTGGCT         GTTCGCCAAGCAGCTTT
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 126160 GATGTGAAAACAGAAGCTGTGGCTGTA...TAGGTTCGCCAAGCAGCTTT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    603 TCAGTCTCTGGGACCTTTCATATCTACTTTTGCTAATCCATCTAGCTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137098 TCAGTCTCTGGGACCTTTCATATCTACTTTTGCTAATCCATCTAGCTCAG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    653 GCCAGTATTTTAAAGAAGAAAGCAAAAGTTCAGAAGAGATGTCAGTAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137148 GCCAGTATTTTAAAGAAGAAAGCAAAAGTTCAGAAGAGATGTCAGTAGAA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    703 AACAAAAATAG         GACCAGAGATCAAGAAGCCCCAGAGGATGT
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 137198 AACAAAAATAGGTA...AAGGACCAGAGATCAAGAAGCCCCAGAGGATGT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    744 ACAAGTCAGGCCAGAGGATACTCCTTCAGATCTCAGTGTTAGTAATTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143619 ACAAGTCAGGCCAGAGGATACTCCTTCAGATCTCAGTGTTAGTAATTCCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    794 GTGTCATACTGGAAAACACGATGGAAGACCATGCTGCTGAGGCATCCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143669 GTGTCATACTGGAAAACACGATGGAAGACCATGCTGCTGAGGCATCCGGG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    844 AAGCCTCTAGGTGAAATTAGTGTTCCACTGGACAGCTCTTTACTTTGTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143719 AAGCCTCTAGGTGAAATTAGTGTTCCACTGGACAGCTCTTTACTTTGTAC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    894 TTTGTCCTCAGAATCTCACCAGGAAGCAGCTAGTAATGAGAATGATAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143769 TTTGTCCTCAGAATCTCACCAGGAAGCAGCTAGTAATGAGAATGATAAAA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    944 AACCTGGTAACTACAAATCTATGTTACGACCAGAGGTTGGCACCACTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143819 AACCTGGTAACTACAAATCTATGTTACGACCAGAGGTTGGCACCACTTCA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    994 CAAGATTCAGCTCTCTTAGATCAGGAATTGTATAACTCCTTCCATTTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143869 CAAGATTCAGCTCTCTTAGATCAGGAATTGTATAACTCCTTCCATTTCTG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1044 GAGGACTCCTCTTCCTGAAATAGATCTAGACATAGAGCTTGAACAGAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143919 GAGGACTCCTCTTCCTGAAATAGATCTAGACATAGAGCTTGAACAGAACT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1094 CTGGGGGAAAACCCAGCCCAGAGGGACCAGAGGAAGAATCTGAGGGCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143969 CTGGGGGAAAACCCAGCCCAGAGGGACCAGAGGAAGAATCTGAGGGCCCT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1144 GTGCCCAGTTCTCCAAACATCACCATGGCCACCAGAAAGGAACTGGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144019 GTGCCCAGTTCTCCAAACATCACCATGGCCACCAGAAAGGAACTGGAAGA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1194 AATGATAGAAAATCTAGAGCCCCACATTGATGATCCAGATGTTAAAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 144069 AATGATAGAAAATCTAGAGCCCCACATTGATGATCCAGATGTTAAAGGTA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1241       CACAAGTGGAAGTGCTGTCCGCTGCACTACGTGCTTCCAGCCTG
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144119 ...TAGCACAAGTGGAAGTGCTGTCCGCTGCACTACGTGCTTCCAGCCTG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1285 GATGCACATGAAGAGACCATCAGTATAGAAAAGAGAAGTGATTTGCAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150766 GATGCACATGAAGAGACCATCAGTATAGAAAAGAGAAGTGATTTGCAAGA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1335 TGAACTGGATATAAATGAGCTACCAAATTGTAAAATAAATCAAGAAGATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150816 TGAACTGGATATAAATGAGCTACCAAATTGTAAAATAAATCAAGAAGATT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1385 CTGTGCCTTTAATCAGCGATGCTGTTGAG         AATATGGACTCC
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 150866 CTGTGCCTTTAATCAGCGATGCTGTTGAGGTA...CAGAATATGGACTCC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1426 ACTCTTCACTATATTCACAGCGATTCAGACTTGAGCAACAATAGCAGTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 152209 ACTCTTCACTATATTCACAGCGATTCAGACTTGAGCAACAATAGCAGTTT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1476 TAGCCCTGATGAGGAAAGGAGAACTAAAGTACAA         GATGTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 152259 TAGCCCTGATGAGGAAAGGAGAACTAAAGTACAAGTA...TAGGATGTTG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1517 TACCTCAGGCGTTGTTAGATCAGTATTTATCTATGACTGACCCTTCTCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 154675 TACCTCAGGCGTTGTTAGATCAGTATTTATCTATGACTGACCCTTCTCGT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1567 GCACAGACGGTTGACACTGAAATTGCTAAGCACTGTGCATATAGCCTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 154725 GCACAGACGGTTGACACTGAAATTGCTAAGCACTGTGCATATAGCCTCCC

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1617 TGGTGTGGCCTTGACACTCGGAAGACAGAATTGGCACTGCCTGAGAGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 154775 TGGTGTGGCCTTGACACTCGGAAGACAGAATTGGCACTGCCTGAGAGAGA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1667 CGTATGAGACTCTGGCCTCAGACATGCAG         TGGAAAGTTCGA
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 154825 CGTATGAGACTCTGGCCTCAGACATGCAGGTG...CAGTGGAAAGTTCGA

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1708 CGAACTCTAGCATTCTCCATCCACGAGCTTGCAGTTATTCTTGGAGATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 156902 CGAACTCTAGCATTCTCCATCCACGAGCTTGCAGTTATTCTTGGAGATCA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1758 ATTGACAGCTGCAGATCTGGTTCCAATTTTTAATGGATTTTTAAAAGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 156952 ATTGACAGCTGCAGATCTGGTTCCAATTTTTAATGGATTTTTAAAAGACC

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1808 TCGATGAAGTCAGGATAGGTGTTCTTAAACACTTGCATGATTTTCTGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 157002 TCGATGAAGTCAGGATAGGTGTTCTTAAACACTTGCATGATTTTCTGAAG

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1858          CTTCTTCATATTGACAAAAGAAGAGAATATCTTTATCAACT
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 157052 GTA...TAGCTTCTTCATATTGACAAAAGAAGAGAATATCTTTATCAACT

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1899 TCAGGAGTTTTTGGTGACAGATAATAGTAGAAATTGGCGGTTTCGAGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 160891 TCAGGAGTTTTTGGTGACAGATAATAGTAGAAATTGGCGGTTTCGAGCTG

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1949 AACTGGCTGA         ACAGCTGATTTTACTTCTAGAGTTATATAGT
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 160941 AACTGGCTGAGTA...TAGACAGCTGATTTTACTTCTAGAGTTATATAGT

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1990 CCCAGAGATGTTTATGACTATTTACGTCCCATTGCTCTGAATCTGTGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 163905 CCCAGAGATGTTTATGACTATTTACGTCCCATTGCTCTGAATCTGTGTGC

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2040 AGACAAAGTTTCTTCTGTTCGTTGGATTTCCTACAAGTTG         G
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 163955 AGACAAAGTTTCTTCTGTTCGTTGGATTTCCTACAAGTTGGTA...CAGG

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2081 TCAGCGAGATGGTGAAGAAGCTGCACGCGGCAACACCACCAACGTTCGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 164087 TCAGCGAGATGGTGAAGAAGCTGCACGCGGCAACACCACCAACGTTCGGA

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2131 GTGGACCTCATCAATGAGCTTGTGGAGAACTTTGGCAGATGTCCCAAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 164137 GTGGACCTCATCAATGAGCTTGTGGAGAACTTTGGCAGATGTCCCAAGTG

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2181 GTCTGGTCGGCAAGCCTTTGTCTTTGTCTGCCAG         ACTGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 164187 GTCTGGTCGGCAAGCCTTTGTCTTTGTCTGCCAGGTA...CAGACTGTCA

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2222 TTGAGGATGACTGCCTTCCCATGGACCAGTTTGCTGTGCATCTCATGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 164941 TTGAGGATGACTGCCTTCCCATGGACCAGTTTGCTGTGCATCTCATGCCG

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2272 CATCTGCTAACCTTAGCAAATGACAGGGTTCCTAACGTGCGAGTGCTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 164991 CATCTGCTAACCTTAGCAAATGACAGGGTTCCTAACGTGCGAGTGCTGCT

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2322 TGCAAAGACATTAAGACAAACTCTACTAGAAAAAG         ACTATT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 165041 TGCAAAGACATTAAGACAAACTCTACTAGAAAAAGGTA...CAGACTATT

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2363 TCTTGGCCTCTGCCAGCTGCCACCAGGAGGCTGTGGAGCAGACCATCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 166326 TCTTGGCCTCTGCCAGCTGCCACCAGGAGGCTGTGGAGCAGACCATCATG

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2413 GCTCTTCAGATGGACCGTGACAGCGATGTCAAGTATTTTGCAAGCATCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 166376 GCTCTTCAGATGGACCGTGACAGCGATGTCAAGTATTTTGCAAGCATCCA

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2463 CCCTGCCAGTACCAAAATCTCCGAAGATGCCATGAGCACAGCGTCCTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 166426 CCCTGCCAGTACCAAAATCTCCGAAGATGCCATGAGCACAGCGTCCTCAA

   2650     .
   2513 CCTAC
        |||||
 166476 CCTAC