seq1 = pF1KB9177.tfa, 3414 bp
seq2 = pF1KB9177/gi568815597f_43201072.tfa (gi568815597f:43201072_43422719), 221648 bp

>pF1KB9177 3414
>gi568815597f:43201072_43422719 (Chr1)

1-58  (100001-100058)   100% ->
59-373  (103780-104094)   100% ->
374-484  (104162-104272)   100% ->
485-640  (105769-105924)   100% ->
641-772  (106071-106202)   100% ->
773-913  (106361-106501)   100% ->
914-1042  (106725-106853)   100% ->
1043-1188  (107915-108060)   100% ->
1189-1333  (108317-108461)   100% ->
1334-1492  (110600-110758)   100% ->
1493-1630  (110923-111060)   100% ->
1631-1927  (111234-111530)   100% ->
1928-2218  (112064-112354)   100% ->
2219-2409  (112707-112897)   99% ->
2410-2620  (116128-116338)   100% ->
2621-2731  (116493-116603)   100% ->
2732-2922  (116811-117001)   100% ->
2923-3036  (118164-118277)   100% ->
3037-3107  (118388-118458)   100% ->
3108-3148  (120198-120238)   100% ->
3149-3245  (120325-120421)   100% ->
3246-3345  (120545-120644)   100% ->
3346-3414  (121580-121648)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGTCTGGCGGGTGCCCCCTTTCTTGCTCCCCATCCTCTTCTTGGCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGTCTGGCGGGTGCCCCCTTTCTTGCTCCCCATCCTCTTCTTGGCTTC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TCATGTGG         GCGCGGCGGTGGACCTGACGCTGCTGGCCAACC
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TCATGTGGGTA...CAGGCGCGGCGGTGGACCTGACGCTGCTGGCCAACC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TGCGGCTCACGGACCCCCAGCGCTTCTTCCTGACTTGCGTGTCTGGGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103813 TGCGGCTCACGGACCCCCAGCGCTTCTTCCTGACTTGCGTGTCTGGGGAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GCCGGGGCGGGGAGGGGCTCGGACGCCTGGGGCCCGCCCCTGCTGCTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103863 GCCGGGGCGGGGAGGGGCTCGGACGCCTGGGGCCCGCCCCTGCTGCTGGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GAAGGACGACCGTATCGTGCGCACCCCGCCCGGGCCACCCCTGCGCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103913 GAAGGACGACCGTATCGTGCGCACCCCGCCCGGGCCACCCCTGCGCCTGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CGCGCAACGGTTCGCACCAGGTCACGCTTCGCGGCTTCTCCAAGCCCTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103963 CGCGCAACGGTTCGCACCAGGTCACGCTTCGCGGCTTCTCCAAGCCCTCG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GACCTCGTGGGCGTCTTCTCCTGCGTGGGCGGTGCTGGGGCGCGGCGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104013 GACCTCGTGGGCGTCTTCTCCTGCGTGGGCGGTGCTGGGGCGCGGCGCAC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 GCGCGTCATCTACGTGCACAACAGCCCTGGAG         CCCACCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 104063 GCGCGTCATCTACGTGCACAACAGCCCTGGAGGTG...CAGCCCACCTGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 TTCCAGACAAGGTCACACACACTGTGAACAAAGGTGACACCGCTGTACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104171 TTCCAGACAAGGTCACACACACTGTGAACAAAGGTGACACCGCTGTACTT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 TCTGCACGTGTGCACAAGGAGAAGCAGACAGACGTGATCTGGAAGAGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104221 TCTGCACGTGTGCACAAGGAGAAGCAGACAGACGTGATCTGGAAGAGCAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 CG         GATCCTACTTCTACACCCTGGACTGGCATGAAGCCCAGG
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104271 CGGTA...CAGGATCCTACTTCTACACCCTGGACTGGCATGAAGCCCAGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 ATGGGCGGTTCCTGCTGCAGCTCCCAAATGTGCAGCCACCATCGAGCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105808 ATGGGCGGTTCCTGCTGCAGCTCCCAAATGTGCAGCCACCATCGAGCGGC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 ATCTACAGTGCCACTTACCTGGAAGCCAGCCCCCTGGGCAGCGCCTTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105858 ATCTACAGTGCCACTTACCTGGAAGCCAGCCCCCTGGGCAGCGCCTTCTT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 TCGGCTCATCGTGCGGG         GTTGTGGGGCTGGGCGCTGGGGGC
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 105908 TCGGCTCATCGTGCGGGGTC...CAGGTTGTGGGGCTGGGCGCTGGGGGC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 CAGGCTGTACCAAGGAGTGCCCAGGTTGCCTACATGGAGGTGTCTGCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106095 CAGGCTGTACCAAGGAGTGCCCAGGTTGCCTACATGGAGGTGTCTGCCAC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 GACCATGACGGCGAATGTGTATGCCCCCCTGGCTTCACTGGCACCCGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106145 GACCATGACGGCGAATGTGTATGCCCCCCTGGCTTCACTGGCACCCGCTG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 TGAACAGG         CCTGCAGAGAGGGCCGTTTTGGGCAGAGCTGCC
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 106195 TGAACAGGGTA...TAGCCTGCAGAGAGGGCCGTTTTGGGCAGAGCTGCC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 AGGAGCAGTGCCCAGGCATATCAGGCTGCCGGGGCCTCACCTTCTGCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106394 AGGAGCAGTGCCCAGGCATATCAGGCTGCCGGGGCCTCACCTTCTGCCTC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 CCAGACCCCTATGGCTGCTCTTGTGGATCTGGCTGGAGAGGAAGCCAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106444 CCAGACCCCTATGGCTGCTCTTGTGGATCTGGCTGGAGAGGAAGCCAGTG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 CCAAGAAG         CTTGTGCCCCTGGTCATTTTGGGGCTGATTGCC
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 106494 CCAAGAAGGTA...CAGCTTGTGCCCCTGGTCATTTTGGGGCTGATTGCC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 GACTCCAGTGCCAGTGTCAGAATGGTGGCACTTGTGACCGGTTCAGTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106758 GACTCCAGTGCCAGTGTCAGAATGGTGGCACTTGTGACCGGTTCAGTGGT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 TGTGTCTGCCCCTCTGGGTGGCATGGAGTGCACTGTGAGAAGTCAG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 106808 TGTGTCTGCCCCTCTGGGTGGCATGGAGTGCACTGTGAGAAGTCAGGTA.

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1043      ACCGGATCCCCCAGATCCTCAACATGGCCTCAGAACTGGAGTTCA
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106858 ..CAGACCGGATCCCCCAGATCCTCAACATGGCCTCAGAACTGGAGTTCA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1088 ACTTAGAGACGATGCCCCGGATCAACTGTGCAGCTGCAGGGAACCCCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107960 ACTTAGAGACGATGCCCCGGATCAACTGTGCAGCTGCAGGGAACCCCTTC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1138 CCCGTGCGGGGCAGCATAGAGCTACGCAAGCCAGACGGCACTGTGCTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108010 CCCGTGCGGGGCAGCATAGAGCTACGCAAGCCAGACGGCACTGTGCTCCT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1188 G         TCCACCAAGGCCATTGTGGAGCCAGAGAAGACCACAGCTG
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108060 GGTC...TAGTCCACCAAGGCCATTGTGGAGCCAGAGAAGACCACAGCTG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1229 AGTTCGAGGTGCCCCGCTTGGTTCTTGCGGACAGTGGGTTCTGGGAGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108357 AGTTCGAGGTGCCCCGCTTGGTTCTTGCGGACAGTGGGTTCTGGGAGTGC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1279 CGTGTGTCCACATCTGGCGGCCAAGACAGCCGGCGCTTCAAGGTCAATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108407 CGTGTGTCCACATCTGGCGGCCAAGACAGCCGGCGCTTCAAGGTCAATGT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1329 GAAAG         TGCCCCCCGTGCCCCTGGCTGCACCTCGGCTCCTGA
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108457 GAAAGGTC...CAGTGCCCCCCGTGCCCCTGGCTGCACCTCGGCTCCTGA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1370 CCAAGCAGAGCCGCCAGCTTGTGGTCTCCCCGCTGGTCTCGTTCTCTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110636 CCAAGCAGAGCCGCCAGCTTGTGGTCTCCCCGCTGGTCTCGTTCTCTGGG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1420 GATGGACCCATCTCCACTGTCCGCCTGCACTACCGGCCCCAGGACAGTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110686 GATGGACCCATCTCCACTGTCCGCCTGCACTACCGGCCCCAGGACAGTAC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1470 CATGGACTGGTCGACCATTGTGG         TGGACCCCAGTGAGAACG
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 110736 CATGGACTGGTCGACCATTGTGGGTG...CAGTGGACCCCAGTGAGAACG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1511 TGACGTTAATGAACCTGAGGCCAAAGACAGGATACAGTGTTCGTGTGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110941 TGACGTTAATGAACCTGAGGCCAAAGACAGGATACAGTGTTCGTGTGCAG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1561 CTGAGCCGGCCAGGGGAAGGAGGAGAGGGGGCCTGGGGGCCTCCCACCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110991 CTGAGCCGGCCAGGGGAAGGAGGAGAGGGGGCCTGGGGGCCTCCCACCCT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1611 CATGACCACAGACTGTCCTG         AGCCTTTGTTGCAGCCGTGGT
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 111041 CATGACCACAGACTGTCCTGGTG...CAGAGCCTTTGTTGCAGCCGTGGT

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1652 TGGAGGGCTGGCATGTGGAAGGCACTGACCGGCTGCGAGTGAGCTGGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111255 TGGAGGGCTGGCATGTGGAAGGCACTGACCGGCTGCGAGTGAGCTGGTCC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1702 TTGCCCTTGGTGCCCGGGCCACTGGTGGGCGACGGTTTCCTGCTGCGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111305 TTGCCCTTGGTGCCCGGGCCACTGGTGGGCGACGGTTTCCTGCTGCGCCT

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1752 GTGGGACGGGACACGGGGGCAGGAGCGGCGGGAGAACGTCTCATCCCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111355 GTGGGACGGGACACGGGGGCAGGAGCGGCGGGAGAACGTCTCATCCCCCC

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1802 AGGCCCGCACTGCCCTCCTGACGGGACTCACGCCTGGCACCCACTACCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111405 AGGCCCGCACTGCCCTCCTGACGGGACTCACGCCTGGCACCCACTACCAG

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1852 CTGGATGTGCAGCTCTACCACTGCACCCTCCTGGGCCCGGCCTCGCCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111455 CTGGATGTGCAGCTCTACCACTGCACCCTCCTGGGCCCGGCCTCGCCCCC

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1902 TGCACACGTGCTTCTGCCCCCCAGTG         GGCCTCCAGCCCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 111505 TGCACACGTGCTTCTGCCCCCCAGTGGTA...CAGGGCCTCCAGCCCCCC

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1943 GACACCTCCACGCCCAGGCCCTCTCAGACTCCGAGATCCAGCTGACATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112079 GACACCTCCACGCCCAGGCCCTCTCAGACTCCGAGATCCAGCTGACATGG

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1993 AAGCACCCGGAGGCTCTGCCTGGGCCAATATCCAAGTACGTTGTGGAGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112129 AAGCACCCGGAGGCTCTGCCTGGGCCAATATCCAAGTACGTTGTGGAGGT

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2043 GCAGGTGGCTGGGGGTGCAGGAGACCCACTGTGGATAGACGTGGACAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112179 GCAGGTGGCTGGGGGTGCAGGAGACCCACTGTGGATAGACGTGGACAGGC

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2093 CTGAGGAGACAAGCACCATCATCCGTGGCCTCAACGCCAGCACGCGCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112229 CTGAGGAGACAAGCACCATCATCCGTGGCCTCAACGCCAGCACGCGCTAC

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2143 CTCTTCCGCATGCGGGCCAGCATTCAGGGGCTCGGGGACTGGAGCAACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112279 CTCTTCCGCATGCGGGCCAGCATTCAGGGGCTCGGGGACTGGAGCAACAC

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2193 AGTAGAAGAGTCCACCCTGGGCAACG         GGCTGCAGGCTGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 112329 AGTAGAAGAGTCCACCCTGGGCAACGGTG...CAGGGCTGCAGGCTGAGG

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2234 GCCCAGTCCAAGAGAGCCGGGCAGCTGAAGAGGGCCTGGATCAGCAGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112722 GCCCAGTCCAAGAGAGCCGGGCAGCTGAAGAGGGCCTGGATCAGCAGCTG

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2284 ATCCTGGCGGTGGTGGGCTCCGTGTCTGCCACCTGCCTCACCATCCTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112772 ATCCTGGCGGTGGTGGGCTCCGTGTCTGCCACCTGCCTCACCATCCTGGC

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2334 CGCCCTTTTAACCCTGGTGTGCATCCGCAGAAGCTGCCTGCATCGGAGAC
         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112822 TGCCCTTTTAACCCTGGTGTGCATCCGCAGAAGCTGCCTGCATCGGAGAC

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2384 GCACCTTCACCTACCAGTCAGGCTCG         GGCGAGGAGACCATC
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 112872 GCACCTTCACCTACCAGTCAGGCTCGGTC...AAGGGCGAGGAGACCATC

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2425 CTGCAGTTCAGCTCAGGGACCTTGACACTTACCCGGCGGCCAAAACTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116143 CTGCAGTTCAGCTCAGGGACCTTGACACTTACCCGGCGGCCAAAACTGCA

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2475 GCCCGAGCCCCTGAGCTACCCAGTGCTAGAGTGGGAGGACATCACCTTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116193 GCCCGAGCCCCTGAGCTACCCAGTGCTAGAGTGGGAGGACATCACCTTTG

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2525 AGGACCTCATCGGGGAGGGGAACTTCGGCCAGGTCATCCGGGCCATGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116243 AGGACCTCATCGGGGAGGGGAACTTCGGCCAGGTCATCCGGGCCATGATC

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2575 AAGAAGGACGGGCTGAAGATGAACGCAGCCATCAAAATGCTGAAAG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 116293 AAGAAGGACGGGCTGAAGATGAACGCAGCCATCAAAATGCTGAAAGGTC.

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2621      AGTATGCCTCTGAAAATGACCATCGTGACTTTGCGGGAGAACTGG
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116343 ..CAGAGTATGCCTCTGAAAATGACCATCGTGACTTTGCGGGAGAACTGG

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2666 AAGTTCTGTGCAAATTGGGGCATCACCCCAACATCATCAACCTCCTGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116538 AAGTTCTGTGCAAATTGGGGCATCACCCCAACATCATCAACCTCCTGGGG

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2716 GCCTGTAAGAACCGAG         GTTACTTGTATATCGCTATTGAATA
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 116588 GCCTGTAAGAACCGAGGTG...CAGGTTACTTGTATATCGCTATTGAATA

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2757 TGCCCCCTACGGGAACCTGCTAGATTTTCTGCGGAAAAGCCGGGTCCTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116836 TGCCCCCTACGGGAACCTGCTAGATTTTCTGCGGAAAAGCCGGGTCCTAG

   2950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2807 AGACTGACCCAGCTTTTGCTCGAGAGCATGGGACAGCCTCTACCCTTAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116886 AGACTGACCCAGCTTTTGCTCGAGAGCATGGGACAGCCTCTACCCTTAGC

   3000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2857 TCCCGGCAGCTGCTGCGTTTCGCCAGTGATGCGGCCAATGGCATGCAGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116936 TCCCGGCAGCTGCTGCGTTTCGCCAGTGATGCGGCCAATGGCATGCAGTA

   3050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2907 CCTGAGTGAGAAGCAG         TTCATCCACAGGGACCTGGCTGCCC
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 116986 CCTGAGTGAGAAGCAGGTG...CAGTTCATCCACAGGGACCTGGCTGCCC

   3100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2948 GGAATGTGCTGGTCGGAGAGAACCTAGCCTCCAAGATTGCAGACTTCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118189 GGAATGTGCTGGTCGGAGAGAACCTAGCCTCCAAGATTGCAGACTTCGGC

   3150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2998 CTTTCTCGGGGAGAGGAGGTTTATGTGAAGAAGACGATG         GG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 118239 CTTTCTCGGGGAGAGGAGGTTTATGTGAAGAAGACGATGGTG...TAGGG

   3200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3039 GCGTCTCCCTGTGCGCTGGATGGCCATTGAGTCCCTGAACTACAGTGTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118390 GCGTCTCCCTGTGCGCTGGATGGCCATTGAGTCCCTGAACTACAGTGTCT

   3250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3089 ATACCACCAAGAGTGATGT         CTGGTCCTTTGGAGTCCTTCTT
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 118440 ATACCACCAAGAGTGATGTGTG...CAGCTGGTCCTTTGGAGTCCTTCTT

   3300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3130 TGGGAGATAGTGAGCCTTG         GAGGTACACCCTACTGTGGCAT
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 120220 TGGGAGATAGTGAGCCTTGGTG...CAGGAGGTACACCCTACTGTGGCAT

   3350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3171 GACCTGTGCCGAGCTCTATGAAAAGCTGCCCCAGGGCTACCGCATGGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120347 GACCTGTGCCGAGCTCTATGAAAAGCTGCCCCAGGGCTACCGCATGGAGC

   3400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3221 AGCCTCGAAACTGTGACGATGAAGT         GTACGAGCTGATGCGT
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 120397 AGCCTCGAAACTGTGACGATGAAGTGTG...CAGGTACGAGCTGATGCGT

   3450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3262 CAGTGCTGGCGGGACCGTCCCTATGAGCGACCCCCCTTTGCCCAGATTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120561 CAGTGCTGGCGGGACCGTCCCTATGAGCGACCCCCCTTTGCCCAGATTGC

   3500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3312 GCTACAGCTAGGCCGCATGCTGGAAGCCAGGAAG         GCCTATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 120611 GCTACAGCTAGGCCGCATGCTGGAAGCCAGGAAGGTG...CAGGCCTATG

   3550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3353 TGAACATGTCGCTGTTTGAGAACTTCACTTACGCGGGCATTGATGCCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121587 TGAACATGTCGCTGTTTGAGAACTTCACTTACGCGGGCATTGATGCCACA

   3600     .    :
   3403 GCTGAGGAGGCC
        ||||||||||||
 121637 GCTGAGGAGGCC