seq1 = pF1KB9140.tfa, 1128 bp
seq2 = pF1KB9140/gi568815597r_217510320.tfa (gi568815597r:217510320_217730971), 220652 bp

>pF1KB9140 1128
>gi568815597r:217510320_217730971 (Chr1)

(complement)

1-56  (100001-100056)   100% ->
57-773  (110473-111189)   100% ->
774-835  (116770-116831)   100% ->
836-1018  (119901-120083)   100% ->
1019-1098  (120572-120651)   100% ->
1099-1128  (120780-120809)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTTCGGGGCCGCCGGGCGCCAACCGATCGGAGCTCCAGCAGCCGGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTTCGGGGCCGCCGGGCGCCAACCGATCGGAGCTCCAGCAGCCGGGAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CAGCTG         GCATTTCAGTAGAACCATGGAGGAGCTGGTTCATG
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CAGCTGGTG...AAGGCATTTCAGTAGAACCATGGAGGAGCTGGTTCATG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 ACCTTGTCTCAGCATTGGAAGAGAGCTCAGAGCAAGCTCGAGGTGGATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110508 ACCTTGTCTCAGCATTGGAAGAGAGCTCAGAGCAAGCTCGAGGTGGATTT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GCTGAAACAGGAGACCATTCTCGAAGTATATCTTGCCCTCTGAAACGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110558 GCTGAAACAGGAGACCATTCTCGAAGTATATCTTGCCCTCTGAAACGCCA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GGCAAGGAAAAGGAGAGGGAGAAAACGGAGGTCGTATAATGTGCATCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110608 GGCAAGGAAAAGGAGAGGGAGAAAACGGAGGTCGTATAATGTGCATCACC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CGTGGGAGACTGGTCACTGCTTAAGTGAAGGCTCTGATTCTAGTTTAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110658 CGTGGGAGACTGGTCACTGCTTAAGTGAAGGCTCTGATTCTAGTTTAGAA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GAACCAAGCAAGGACTATAGAGAGAATCACAATAATAATAAAAAAGATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110708 GAACCAAGCAAGGACTATAGAGAGAATCACAATAATAATAAAAAAGATCA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 CAGTGACTCTGATGACCAAATGTTAGTAGCAAAGCGCAGGCCGTCATCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110758 CAGTGACTCTGATGACCAAATGTTAGTAGCAAAGCGCAGGCCGTCATCAA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 ACTTAAATAATAATGTTCGAGGGAAAAGACCTCTATGGCATGAGTCTGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110808 ACTTAAATAATAATGTTCGAGGGAAAAGACCTCTATGGCATGAGTCTGAT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 TTTGCTGTGGACAATGTTGGGAATAGAACTCTGCGCAGGAGGAGAAAGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110858 TTTGCTGTGGACAATGTTGGGAATAGAACTCTGCGCAGGAGGAGAAAGGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 AAAACGCATGGCAGTAGATCTCCCACAGGACATCTCTAACAAACGGACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110908 AAAACGCATGGCAGTAGATCTCCCACAGGACATCTCTAACAAACGGACAA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 TGACCCAGCCACCTGAGGGTTGTAGAGATCAGGACATGGACAGTGATAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110958 TGACCCAGCCACCTGAGGGTTGTAGAGATCAGGACATGGACAGTGATAGA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 GCCTACCAGTATCAAGAATTTACCAAGAACAAAGTCAAAAAAAGAAAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111008 GCCTACCAGTATCAAGAATTTACCAAGAACAAAGTCAAAAAAAGAAAGTT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 GAAAATAATCAGACAAGGACCAAAAATCCAAGATGAAGGAGTAGTTTTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111058 GAAAATAATCAGACAAGGACCAAAAATCCAAGATGAAGGAGTAGTTTTAG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 AAAGTGAGGAAACGAACCAGACCAATAAGGACAAAATGGAATGTGAAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111108 AAAGTGAGGAAACGAACCAGACCAATAAGGACAAAATGGAATGTGAAGAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 CAAAAAGTCTCAGATGAGCTCATGAGTGAAAG         TGATTCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 111158 CAAAAAGTCTCAGATGAGCTCATGAGTGAAAGGTG...CAGTGATTCCAG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    783 CAGTCTCAGCAGCACTGATGCTGGATTGTTTACCAATGATGAGGGAAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116779 CAGTCTCAGCAGCACTGATGCTGGATTGTTTACCAATGATGAGGGAAGAC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    833 AAG         GTGATGATGAACAGAGTGACTGGTTCTACGAAAAGGAA
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116829 AAGGTA...CAGGTGATGATGAACAGAGTGACTGGTTCTACGAAAAGGAA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    874 TCAGGTGGAGCATGTGGTATCACTGGAGTTGTGCCCTGGTGGGAAAAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119939 TCAGGTGGAGCATGTGGTATCACTGGAGTTGTGCCCTGGTGGGAAAAGGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    924 AGATCCTACTGAGCTAGACAAAAATGTACCAGATCCTGTCTTTGAAAGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119989 AGATCCTACTGAGCTAGACAAAAATGTACCAGATCCTGTCTTTGAAAGTA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    974 TCTTAACTGGTTCTTTTCCCCTTATGTCACACCCAAGCAGAAGAG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 120039 TCTTAACTGGTTCTTTTCCCCTTATGTCACACCCAAGCAGAAGAGGTC..

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1019     GTTTCCAAGCTAGACTCAGTCGCCTTCATGGAATGTCTTCAAAGAA
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120089 .CAGGTTTCCAAGCTAGACTCAGTCGCCTTCATGGAATGTCTTCAAAGAA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1065 TATTAAAAAATCTGGAGGGACTCCAACTTCAATG         GCTACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 120618 TATTAAAAAATCTGGAGGGACTCCAACTTCAATGGTA...TAGGCTACAA

   1150     .    :    .    :
   1106 ACTGGACCAGTGAGATTCCCCTA
        |||||||||||||||||||||||
 120787 ACTGGACCAGTGAGATTCCCCTA