seq1 = pF1KB9127.tfa, 2457 bp
seq2 = pF1KB9127/gi568815589f_66818319.tfa (gi568815589f:66818319_67020743), 202425 bp

>pF1KB9127 2457
>gi568815589f:66818319_67020743 (Chr9)

1-2457  (99982-102425)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGATGAATTTAGAAAAAAACTTTGATAAAACCACTTTATTTAACCACAT
        |||||||||||||||||||-||||||||||| ||||||||||||||||||
  99982 ATGATGAATTTAGAAAAAA CTTTGATAAAATCACTTTATTTAACCACAT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GAGAACTGACAAAAGGGGGAAATGCTCTGATCTTAATGAATATGGGACAT
        ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100031 GAGAACTGACACAAGGGGGAAATGCTCTGATCTTAATGAATATGGGACAT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CCTGTGACAAAACCACCGCTGTTGAATACAATAAAGTTCACATGGCTATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100081 CCTGTGACAAAACCACCGCTGTTGAATACAATAAAGTTCACATGGCTATG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 ACACACTATGAGTGTAATGAAAGGGGGATTAATTTCAGTAGGAAGTCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100131 ACACACTATGAGTGTAATGAAAGGGGGATTAATTTCAGTAGGAAGTCACC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CCTCACTCAATCTCAGAGAACTATTACAGGATGGAGTGCTTTTGAAAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100181 CCTCACTCAATCTCAGAGAACTATTACAGGATGGAGTGCTTTTGAAAGCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 ATAAATGTGAAGAAAATTTTAGCCAGAGCTCAGCCCATATAGTACATCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100231 ATAAATGTGAAGAAAATTTTAGCCAGAGCTCAGCCCATATAGTACATCAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 AAAACACAAGCTGGAGATAAATTTGGTGAACATAATGAATGTACAGATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100281 AAAACACAAGCTGGAGATAAATTTGGTGAACATAATGAATGTACAGATGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CCTCTACCAGAAATTAGACTTTACAGCACATCAGAGAATTCACACAGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||--
 100331 CCTCTACCAGAAATTAGACTTTACAGCACATCAGAGAATTCACACAGA  

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TTACAGCACATCAGAAATTCTACCTTTCTGATGAACATGGGAAATGCAGA
        ----||---||---||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100379     AG   AT   AAATTCTACCTTTCTGATGAACATGGGAAATGCAGA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 AAATCCTTTTACTGGAAAGCACACCTCATTCAGCATGAGAGGCCCCACTC
        |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
 100419 AAATCCTTTTACCGGAAAGCACACCTCATTCAGCATCAGAGGCCCCACTC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 AGGAGAGAAAACTTACCAATATGAGGAATGTGCAAAATCCTTTTGTTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100469 AGGAGAGAAAACTTACCAATATGAGGAATGTGCAAAATCCTTTTGTTCAA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 GTTCACATCCTATTCAGCATCCTGGAACTTATGTGGGATTCAAACTTTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100519 GTTCACATCCTATTCAGCATCCTGGAACTTATGTGGGATTCAAACTTTAT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GAATGTAATGAATGTGGGAAAGCTTTCTGTCAGAATTCAAACCTCAGTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100569 GAATGTAATGAATGTGGGAAAGCTTTCTGTCAGAATTCAAACCTCAGTAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 ACATCTGAGAATTCACACAAAAGAGAAACCTTGTGATAACAATGGCTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100619 ACATCTGAGAATTCACACAAAAGAGAAACCTTGTGATAACAATGGCTGTG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 GGAGATCTTACAAGTCACCCCTCATAGGACACCAGAAAACAGATGCAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100669 GGAGATCTTACAAGTCACCCCTCATAGGACACCAGAAAACAGATGCAGAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 ATGGAACTCTGTGGTGGCAGTGAATATGGGAAGACATCACATCTCAAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100719 ATGGAACTCTGTGGTGGCAGTGAATATGGGAAGACATCACATCTCAAAGG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 ACATCAGAGAATTCTCATGGGGGAGAAACCCTATGAATGTATTGAATGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100769 ACATCAGAGAATTCTCATGGGGGAGAAACCCTATGAATGTATTGAATGTG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 GGAAAACTTTCTCCAAGACATCACATCTCAGAGCACATCAGAGAATTCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100819 GGAAAACTTTCTCCAAGACATCACATCTCAGAGCACATCAGAGAATTCAC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 ACAGGTGAAAAACCCTATGAATGTGTTGAATGTGAGAAAACTTTCTCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100869 ACAGGTGAAAAACCCTATGAATGTGTTGAATGTGAGAAAACTTTCTCTCA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 CAAGACACACCTCAGTGTACATCAGAGAGTTCACACAGGGGAGAAACCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100919 CAAGACACACCTCAGTGTACATCAGAGAGTTCACACAGGGGAGAAACCCT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 ATGAATGTAATGACTGTGGGAAATCTTTTACCTATAACTCAGCCCTGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100969 ATGAATGTAATGACTGTGGGAAATCTTTTACCTATAACTCAGCCCTGAGA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 GCACATCAAAGAATTCACACAGGTGAGAAGCCCTATGAATGCAGTGACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101019 GCACATCAAAGAATTCACACAGGTGAGAAGCCCTATGAATGCAGTGACTG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 TGAGAAAACTTTTGCCCATAATTCAGCCCTCAGAGCACATCATAGAATTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101069 TGAGAAAACTTTTGCCCATAATTCAGCCCTCAGAGCACATCATAGAATTC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1151 ACACGGGGGAGAAACCTTATGAATGTAATGAATGTGGAAGGTCTTTTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101119 ACACGGGGGAGAAACCTTATGAATGTAATGAATGTGGAAGGTCTTTTGCC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1201 CATATTTCTGTTCTCAAGGCACATCAAAGAATTCACACAAGGGAGAAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
 101169 CATATTTCTGTTCTCAAGGCACATCAAAGAATTCACACAGGGGAGAAACC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1251 CTATGAATGTAATGAATGTGGGAGATCTTTCACCTACAATTCAGCCCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101219 CTATGAATGTAATGAATGTGGGAGATCTTTCACCTACAATTCAGCCCTGA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1301 GAGCACATCAGAGAATTCACACAGGTAGAAAACCCTATGAATGTAGTGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101269 GAGCACATCAGAGAATTCACACAGGTAGAAAACCCTATGAATGTAGTGAC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1351 TGTGAGAAAACTTTTGCCCATAATTCAGCCCTCAAAATACATCAGAGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101319 TGTGAGAAAACTTTTGCCCATAATTCAGCCCTCAAAATACATCAGAGAAT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1401 TCACACGGGGGAGAAACCCTATAAATGTAATGAATGTGAGAAAACATTTG
        |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
 101369 TCACACGGGGGAGAAACCCTATGAATGTAATGAATGTGAGAAAACATTTG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1451 CCCATAATTCAGCCCTTAGAGCACATCAGAATATCCACACAGGGGAGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101419 CCCATAATTCAGCCCTTAGAGCACATCAGAATATCCACACAGGGGAGAAA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1501 CTCTATGAATGTAGTGAATGTGGAAAAACTTTTTTCCAGAAGACACGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101469 CTCTATGAATGTAGTGAATGTGGAAAAACTTTTTTCCAGAAGACACGCCT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1551 CAGTACACATCGGAGAATTCACACAGGGGAGAAACCCTATGAATGTAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101519 CAGTACACATCGGAGAATTCACACAGGGGAGAAACCCTATGAATGTAGCA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1601 AGTGTGGGAAAACTTTCTCCCAGAAATCATACCTCAGTGGACATGAGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101569 AGTGTGGGAAAACTTTCTCCCAGAAATCATACCTCAGTGGACATGAGAGA

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1651 ATTCACACAGGGGAAAAACCGTATGAATGTAACGTATGTGGGAAAACTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101619 ATTCACACAGGGGAAAAACCGTATGAATGTAACGTATGTGGGAAAACTTT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1701 TGTCTATAAGGCAGCCCTCATAGTGCATCAAAGAATTCACACAGGGGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101669 TGTCTATAAGGCAGCCCTCATAGTGCATCAAAGAATTCACACAGGGGAGA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1751 AACCCTATGAATGTAACGAATGTGGGAAAACTTTCTCCCAAAGAACACAC
        ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
 101719 AACCCTATGAATGTAACCAATGTGGGAAAACTTTCTCCCAAAGAACACAC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1801 CTCTGTGCACATCAGAGAATTCATACTGGGGAAAAACCCTATGAGTGTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101769 CTCTGTGCACATCAGAGAATTCATACTGGGGAAAAACCCTATGAGTGTAA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1851 TGAATGTGGGAAAACGTTTGCTGATAATTCAGCCCTCAGGGCACATCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101819 TGAATGTGGGAAAACGTTTGCTGATAATTCAGCCCTCAGGGCACATCACA

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1901 GAATTCACACAGGGGAGAAACCCTATGAATGTAATGACTGTGGGAAGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101869 GAATTCACACAGGGGAGAAACCCTATGAATGTAATGACTGTGGGAAGACT

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1951 TTCTCCAAGACATCACATCTCAGAGCACATCTTAGAACTCGCTCAGGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101919 TTCTCCAAGACATCACATCTCAGAGCACATCTTAGAACTCGCTCAGGGGA

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2001 GAAGCCCTATGAATGCAGTGAATGTGGGAAAACCTTCTCTGAGAAGTCAT
        ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101969 GAAACCCTATGAATGCAGTGAATGTGGGAAAACCTTCTCTGAGAAGTCAT

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2051 ATGTTAGTGCACATCAGAGAGTTCATACGGGGGAGAAACCCTATGAATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
 102019 ATGTTAGTGCACATCAGAGAGTTCATACGGGGGAGAAACCCTACGAATGT

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2101 AATGTATGTGGGAAGCCATTTGCCCATAATTCAACCCTCAGAGTACATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102069 AATGTATGTGGGAAGCCATTTGCCCATAATTCAACCCTCAGAGTACATCA

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2151 AAGAATTCACACAGGGGAGAAATCCTATGAATGTAATGATTGTGGGAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102119 AAGAATTCACACAGGGGAGAAATCCTATGAATGTAATGATTGTGGGAAAA

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2201 CGTTCTCCCAGAAATCACACCTTAGTGCACACCAGAGAATTCACACAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102169 CGTTCTCCCAGAAATCACACCTTAGTGCACACCAGAGAATTCACACAGGG

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2251 GAGAAACCCTATGAGTGTAATGAATGCGGGAAAGCTTTTGCCCAAAATTC
        ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
 102219 GAGAAACCCTATGAGTGTAATGAATGCGGAAAAGCTTTTGCCCAAAATTC

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2301 AACTCTCAGAGTACACCAGAGAATTCACACAGGGGAGAAACCCTATGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102269 AACTCTCAGAGTACACCAGAGAATTCACACAGGGGAGAAACCCTATGAAT

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2351 GTGATGAATGTGGGAAAACTTTTGTCCGTAAGGCAGCTCTTAGGGTACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102319 GTGATGAATGTGGGAAAACTTTTGTCCGTAAGGCAGCTCTTAGGGTACAT

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2401 CACACCAGAATGCATACCAGAGAGAAAACCCTAGCATGTAATGGATTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102369 CACACCAGAATGCATACCAGAGAGAAAACCCTAGCATGTAATGGATTTGG

   2450     .
   2451 GAAGTCC
        |||||||
 102419 GAAGTCC