seq1 = pF1KB9123.tfa, 1515 bp
seq2 = pF1KB9123/gi568815591r_123589044.tfa (gi568815591r:123589044_123848734), 259691 bp

>pF1KB9123 1515
>gi568815591r:123589044_123848734 (Chr7)

(complement)

1-117  (100001-100117)   100% ->
118-252  (139512-139646)   100% ->
253-339  (141909-141995)   100% ->
340-436  (142362-142458)   100% ->
437-460  (144078-144101)   100% ->
461-629  (151988-152156)   100% ->
630-672  (152870-152912)   100% ->
673-826  (153867-154020)   100% ->
827-1347  (155868-156388)   100% ->
1348-1456  (159585-159693)   100% ->
1457-1515  (164155-164213)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAGCTCCGTCCAGCAGCAGCCGCCGCCGCCGCGGAGGGTCACCAACGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAGCTCCGTCCAGCAGCAGCCGCCGCCGCCGCGGAGGGTCACCAACGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGGGTCCCTGTTGCTCACCCCGCAGGAGAACGAGTCCCTCTTCACTTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGGGTCCCTGTTGCTCACCCCGCAGGAGAACGAGTCCCTCTTCACTTTCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCGGCAAGAAATGTGTG         ACTATGTCTTCAGCAGTGGTGCAG
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 100101 TCGGCAAGAAATGTGTGGTC...CAGACTATGTCTTCAGCAGTGGTGCAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TTATATGCAGCAGATCGGAACTGTATGTGGTCAAAGAAGTGCAGTGGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139536 TTATATGCAGCAGATCGGAACTGTATGTGGTCAAAGAAGTGCAGTGGTGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TGCTTGTCTTGTTAAGGACAATCCACAGAGATCTTATTTTTTAAGAATAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139586 TGCTTGTCTTGTTAAGGACAATCCACAGAGATCTTATTTTTTAAGAATAT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TTGACATTAAG         GATGGGAAACTATTGTGGGAACAAGAGCTA
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 139636 TTGACATTAAGGTG...TAGGATGGGAAACTATTGTGGGAACAAGAGCTA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 TACAATAACTTTGTATATAATAGTCCTAGAGGATATTTTCATACCTTTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141939 TACAATAACTTTGTATATAATAGTCCTAGAGGATATTTTCATACCTTTGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TGGAGAT         ACTTGTCAAGTTGCTCTTAATTTTGCCAATGAAG
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141989 TGGAGATGTA...CAGACTTGTCAAGTTGCTCTTAATTTTGCCAATGAAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 AAGAAGCAAAAAAATTTCGAAAAGCAGTTACAGACCTTTTGGGCCGTCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142396 AAGAAGCAAAAAAATTTCGAAAAGCAGTTACAGACCTTTTGGGCCGTCGA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 CAAAGGAAATCTG         AGAAAAGACGAGATCCCCCAAATG    
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||>>>.
 142446 CAAAGGAAATCTGGTA...CAGAGAAAAGACGAGATCCCCCAAATGGTA.

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    461      GTCCTAATCTACCCATGGCTACAGTTGATATAAAAAATCCAGAAA
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144106 ..CAGGTCCTAATCTACCCATGGCTACAGTTGATATAAAAAATCCAGAAA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 TCACAACAAATAGATTTTATGGTCCACAAGTCAACAACATCTCCCATACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 152033 TCACAACAAATAGATTTTATGGTCCACAAGTCAACAACATCTCCCATACC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 AAAGAAAAGAAGAAGGGAAAAGCTAAAAAGAAGAGATTAACCAAGGCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 152083 AAAGAAAAGAAGAAGGGAAAAGCTAAAAAGAAGAGATTAACCAAGGCAGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 TATAGGAACACCAAGCAATTTCCA         GCACATTGGACATGTTG
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 152133 TATAGGAACACCAAGCAATTTCCAGTA...CAGGCACATTGGACATGTTG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 GTTGGGATCCAAATACAGGCTTTGAT         CTGAATAATTTGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 152887 GTTGGGATCCAAATACAGGCTTTGATGTA...TAGCTGAATAATTTGGAT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    688 CCAGAATTGAAGAATCTTTTCGATATGTGTGGAATCTCAGAGGCACAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 153882 CCAGAATTGAAGAATCTTTTCGATATGTGTGGAATCTCAGAGGCACAACT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    738 TAAAGACAGAGAAACATCAAAAGTTATATATGACTTTATTGAAAAAACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 153932 TAAAGACAGAGAAACATCAAAAGTTATATATGACTTTATTGAAAAAACAG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    788 GAGGTGTTGAAGCTGTTAAAAATGAACTGCGGAGGCAAG         CA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 153982 GAGGTGTTGAAGCTGTTAAAAATGAACTGCGGAGGCAAGGTA...CAGCA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    829 CCACCACCTCCACCACCATCAAGGGGAGGGCCACCTCCTCCTCCTCCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 155870 CCACCACCTCCACCACCATCAAGGGGAGGGCCACCTCCTCCTCCTCCCCC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    879 TCCACACAACTCAGGTCCTCCTCCTCCTCCTGCTAGGGGAAGAGGCGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 155920 TCCACACAACTCAGGTCCTCCTCCTCCTCCTGCTAGGGGAAGAGGCGCTC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    929 CTCCCCCACCACCTTCAAGAGCTCCCACAGCTGCACCTCCACCACCGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 155970 CTCCCCCACCACCTTCAAGAGCTCCCACAGCTGCACCTCCACCACCGCCT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    979 CCTTCCAGGCCAAGTGTAGCAGTCCCTCCACCACCGCCAAATAGGATGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 156020 CCTTCCAGGCCAAGTGTAGCAGTCCCTCCACCACCGCCAAATAGGATGTA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1029 CCCTCCTCCACCTCCAGCCCTTCCCTCCTCAGCACCTTCAGGGCCTCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 156070 CCCTCCTCCACCTCCAGCCCTTCCCTCCTCAGCACCTTCAGGGCCTCCAC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1079 CACCACCTCCATCTGTGTTGGGGGTAGGGCCAGTGGCACCACCCCCACCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 156120 CACCACCTCCATCTGTGTTGGGGGTAGGGCCAGTGGCACCACCCCCACCG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1129 CCTCCACCTCCACCTCCTCCTGGGCCACCGCCCCCGCCTGGCCTGCCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 156170 CCTCCACCTCCACCTCCTCCTGGGCCACCGCCCCCGCCTGGCCTGCCTTC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1179 TGATGGGGACCATCAGGTTCCAACTACTGCAGGAAACAAAGCAGCTCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 156220 TGATGGGGACCATCAGGTTCCAACTACTGCAGGAAACAAAGCAGCTCTTT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1229 TAGATCAAATTAGAGAGGGTGCTCAGCTAAAAAAAGTGGAGCAGAACAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 156270 TAGATCAAATTAGAGAGGGTGCTCAGCTAAAAAAAGTGGAGCAGAACAGT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1279 CGGCCAGTGTCCTGCTCTGGACGAGATGCACTGTTAGACCAGATACGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 156320 CGGCCAGTGTCCTGCTCTGGACGAGATGCACTGTTAGACCAGATACGACA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1329 GGGTATCCAACTAAAATCT         GTGGCTGATGGCCAAGAGTCTA
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 156370 GGGTATCCAACTAAAATCTGTA...AAGGTGGCTGATGGCCAAGAGTCTA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1370 CACCACCAACACCTGCACCCACTTCAGGAATTGTGGGTGCATTAATGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 159607 CACCACCAACACCTGCACCCACTTCAGGAATTGTGGGTGCATTAATGGAA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1420 GTGATGCAGAAAAGGAGCAAAGCCATTCATTCTTCAG         ATGA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 159657 GTGATGCAGAAAAGGAGCAAAGCCATTCATTCTTCAGGTA...TAGATGA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1461 AGATGAAGATGAAGATGATGAAGAAGATTTTGAGGATGATGATGAGTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 164159 AGATGAAGATGAAGATGATGAAGAAGATTTTGAGGATGATGATGAGTGGG

   1600     .
   1511 AAGAC
        |||||
 164209 AAGAC