seq1 = pF1KB9016.tfa, 783 bp
seq2 = pF1KB9016/gi568815581r_75746737.tfa (gi568815581r:75746737_75955297), 208561 bp

>pF1KB9016 783
>gi568815581r:75746737_75955297 (Chr17)

(complement)

1-59  (100001-100059)   100% ->
60-168  (103622-103730)   100% ->
169-304  (105559-105694)   100% ->
305-397  (106636-106728)   100% ->
398-532  (107368-107502)   100% ->
533-655  (107689-107811)   100% ->
656-732  (108314-108390)   100% ->
733-783  (108511-108561)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGCTCAACAAGAATCACTCGGAGGGCGGCGGAGTGATCGTCAATAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGCTCAACAAGAATCACTCGGAGGGCGGCGGAGTGATCGTCAATAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CACCGAGAG         CATCCTAATGTCCTATGATCACGTGGAACTCA
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CACCGAGAGGTG...CAGCATCCTAATGTCCTATGATCACGTGGAACTCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CATTCAATGACATGAAGAACGTGCCAGAAGCCTTCAAAGGGACCAAGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103654 CATTCAATGACATGAAGAACGTGCCAGAAGCCTTCAAAGGGACCAAGAAA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GGCACTGTCTACCTTACCCCTTACCGG         GTCATCTTTCTGTC
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 103704 GGCACTGTCTACCTTACCCCTTACCGGGTG...CAGGTCATCTTTCTGTC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 CAAGGGCAAGGATGCCATGCAGTCCTTCATGATGCCATTTTATCTCATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105573 CAAGGGCAAGGATGCCATGCAGTCCTTCATGATGCCATTTTATCTCATGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 AAGACTGTGAGATCAAGCAGCCCGTATTTGGTGCAAACTACATCAAGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105623 AAGACTGTGAGATCAAGCAGCCCGTATTTGGTGCAAACTACATCAAGGGA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 ACAGTGAAGGCGGAAGCGGGAG         GTGGCTGGGAAGGCTCTGC
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 105673 ACAGTGAAGGCGGAAGCGGGAGGTA...CAGGTGGCTGGGAAGGCTCTGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 TTCCTACAAGTTGACTTTCACGGCAGGGGGCGCCATTGAGTTCGGACAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106655 TTCCTACAAGTTGACTTTCACGGCAGGGGGCGCCATTGAGTTCGGACAGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 GGATGCTCCAGGTGGCATCTCAAG         CCTCCAGAGGTGAAGTC
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 106705 GGATGCTCCAGGTGGCATCTCAAGGTA...TAGCCTCCAGAGGTGAAGTC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 CCCAGTGGAGCCTATGGCTACTCTTACATGCCCAGCGGGGCCTATGTCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107385 CCCAGTGGAGCCTATGGCTACTCTTACATGCCCAGCGGGGCCTATGTCTA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 TCCCCCGCCAGTCGCCAATGGAATGTACCCCTGCCCTCCTGGCTACCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107435 TCCCCCGCCAGTCGCCAATGGAATGTACCCCTGCCCTCCTGGCTACCCCT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 ATCCACCGCCCCCACCTG         AGTTCTATCCAGGACCCCCCATG
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 107485 ATCCACCGCCCCCACCTGGTG...CAGAGTTCTATCCAGGACCCCCCATG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 ATGGACGGGGCCATGGGATACGTGCAGCCCCCACCACCGCCCTACCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107712 ATGGACGGGGCCATGGGATACGTGCAGCCCCCACCACCGCCCTACCCTGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 GCCCATGGAACCTCCGGTCAGCGGCCCCGATGTCCCCTCCACTCCTGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107762 GCCCATGGAACCTCCGGTCAGCGGCCCCGATGTCCCCTCCACTCCTGCAG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656          CCGAAGCCAAGGCCGCAGAAGCAGCCGCCAGCGCCTATTAC
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107812 GTG...CAGCCGAAGCCAAGGCCGCAGAAGCAGCCGCCAGCGCCTATTAC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 AACCCAGGCAATCCTCACAACGTCTACATGCCCACG         AGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 108355 AACCCAGGCAATCCTCACAACGTCTACATGCCCACGGTG...TAGAGCCA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .
    738 GCCGCCGCCACCTCCCTACTACCCACCGGAAGATAAGAAGACCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108516 GCCGCCGCCACCTCCCTACTACCCACCGGAAGATAAGAAGACCCAG