seq1 = pF1KB8997.tfa, 1224 bp
seq2 = pF1KB8997/gi568815584r_53850035.tfa (gi568815584r:53850035_54052222), 202188 bp

>pF1KB8997 1224
>gi568815584r:53850035_54052222 (Chr14)

(complement)

1-370  (100001-100370)   100% ->
371-1224  (101335-102188)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGATTCCTGGTAACCGAATGCTGATGGTCGTTTTATTATGCCAAGTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGATTCCTGGTAACCGAATGCTGATGGTCGTTTTATTATGCCAAGTCCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCTAGGAGGCGCGAGCCATGCTAGTTTGATACCTGAGACGGGGAAGAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCTAGGAGGCGCGAGCCATGCTAGTTTGATACCTGAGACGGGGAAGAAAA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AAGTCGCCGAGATTCAGGGCCACGCGGGAGGACGCCGCTCAGGGCAGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AAGTCGCCGAGATTCAGGGCCACGCGGGAGGACGCCGCTCAGGGCAGAGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CATGAGCTCCTGCGGGACTTCGAGGCGACACTTCTGCAGATGTTTGGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CATGAGCTCCTGCGGGACTTCGAGGCGACACTTCTGCAGATGTTTGGGCT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GCGCCGCCGCCCGCAGCCTAGCAAGAGTGCCGTCATTCCGGACTACATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GCGCCGCCGCCCGCAGCCTAGCAAGAGTGCCGTCATTCCGGACTACATGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GGGATCTTTACCGGCTTCAGTCTGGGGAGGAGGAGGAAGAGCAGATCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GGGATCTTTACCGGCTTCAGTCTGGGGAGGAGGAGGAAGAGCAGATCCAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 AGCACTGGTCTTGAGTATCCTGAGCGCCCGGCCAGCCGGGCCAACACCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 AGCACTGGTCTTGAGTATCCTGAGCGCCCGGCCAGCCGGGCCAACACCGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GAGGAGCTTCCACCACGAAG         AACATCTGGAGAACATCCCAG
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 100351 GAGGAGCTTCCACCACGAAGGTC...TAGAACATCTGGAGAACATCCCAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 GGACCAGTGAAAACTCTGCTTTTCGTTTCCTCTTTAACCTCAGCAGCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101356 GGACCAGTGAAAACTCTGCTTTTCGTTTCCTCTTTAACCTCAGCAGCATC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 CCTGAGAACGAGGCGATCTCCTCTGCAGAGCTTCGGCTCTTCCGGGAGCA
        ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101406 CCTGAGAACGAGGTGATCTCCTCTGCAGAGCTTCGGCTCTTCCGGGAGCA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 GGTGGACCAGGGCCCTGATTGGGAAAGGGGCTTCCACCGTATAAACATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101456 GGTGGACCAGGGCCCTGATTGGGAAAGGGGCTTCCACCGTATAAACATTT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 ATGAGGTTATGAAGCCCCCAGCAGAAGTGGTGCCTGGGCACCTCATCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101506 ATGAGGTTATGAAGCCCCCAGCAGAAGTGGTGCCTGGGCACCTCATCACA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 CGACTACTGGACACGAGACTGGTCCACCACAATGTGACACGGTGGGAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101556 CGACTACTGGACACGAGACTGGTCCACCACAATGTGACACGGTGGGAAAC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 TTTTGATGTGAGCCCTGCGGTCCTTCGCTGGACCCGGGAGAAGCAGCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101606 TTTTGATGTGAGCCCTGCGGTCCTTCGCTGGACCCGGGAGAAGCAGCCAA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 ACTATGGGCTAGCCATTGAGGTGACTCACCTCCATCAGACTCGGACCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101656 ACTATGGGCTAGCCATTGAGGTGACTCACCTCCATCAGACTCGGACCCAC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 CAGGGCCAGCATGTCAGGATTAGCCGATCGTTACCTCAAGGGAGTGGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101706 CAGGGCCAGCATGTCAGGATTAGCCGATCGTTACCTCAAGGGAGTGGGAA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    792 TTGGGCCCAGCTCCGGCCCCTCCTGGTCACCTTTGGCCATGATGGCCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101756 TTGGGCCCAGCTCCGGCCCCTCCTGGTCACCTTTGGCCATGATGGCCGGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    842 GCCATGCCTTGACCCGACGCCGGAGGGCCAAGCGTAGCCCTAAGCATCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101806 GCCATGCCTTGACCCGACGCCGGAGGGCCAAGCGTAGCCCTAAGCATCAC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    892 TCACAGCGGGCCAGGAAGAAGAATAAGAACTGCCGGCGCCACTCGCTCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101856 TCACAGCGGGCCAGGAAGAAGAATAAGAACTGCCGGCGCCACTCGCTCTA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    942 TGTGGACTTCAGCGATGTGGGCTGGAATGACTGGATTGTGGCCCCACCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101906 TGTGGACTTCAGCGATGTGGGCTGGAATGACTGGATTGTGGCCCCACCAG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    992 GCTACCAGGCCTTCTACTGCCATGGGGACTGCCCCTTTCCACTGGCTGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101956 GCTACCAGGCCTTCTACTGCCATGGGGACTGCCCCTTTCCACTGGCTGAC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1042 CACCTCAACTCAACCAACCATGCCATTGTGCAGACCCTGGTCAATTCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102006 CACCTCAACTCAACCAACCATGCCATTGTGCAGACCCTGGTCAATTCTGT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1092 CAATTCCAGTATCCCCAAAGCCTGTTGTGTGCCCACTGAACTGAGTGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102056 CAATTCCAGTATCCCCAAAGCCTGTTGTGTGCCCACTGAACTGAGTGCCA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1142 TCTCCATGCTGTACCTGGATGAGTATGATAAGGTGGTACTGAAAAATTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102106 TCTCCATGCTGTACCTGGATGAGTATGATAAGGTGGTACTGAAAAATTAT

   1200     .    :    .    :    .    :
   1192 CAGGAGATGGTAGTAGAGGGATGTGGGTGCCGC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||
 102156 CAGGAGATGGTAGTAGAGGGATGTGGGTGCCGC