seq1 = pF1KB8992.tfa, 603 bp
seq2 = pF1KB8992/gi568815596r_234396011.tfa (gi568815596r:234396011_234596586), 200576 bp

>pF1KB8992 603
>gi568815596r:234396011_234596586 (Chr2)

(complement)

1-575  (100001-100575)   100% ->
576-603  (100751-100778)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGCAACATCTCCTCTAACATCTCGGCCTTCCAGTCCCTGCATATCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGCAACATCTCCTCTAACATCTCGGCCTTCCAGTCCCTGCATATCGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CATGTTGGGCTTGGACTCGGCCGGCAAGACCACGGTGCTCTACCGGCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CATGTTGGGCTTGGACTCGGCCGGCAAGACCACGGTGCTCTACCGGCTCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGTTCAACGAGTTCGTGAACACGGTGCCCACCATCGGCTTCAACACCGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AGTTCAACGAGTTCGTGAACACGGTGCCCACCATCGGCTTCAACACCGAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 AAGATCAAGCTGAGCAACGGCACGGCCAAGGGCATCAGCTGCCACTTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 AAGATCAAGCTGAGCAACGGCACGGCCAAGGGCATCAGCTGCCACTTCTG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GGACGTGGGCGGCCAGGAGAAGCTGCGGCCGCTGTGGAAGTCCTACAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GGACGTGGGCGGCCAGGAGAAGCTGCGGCCGCTGTGGAAGTCCTACAGCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GCTGCACGGACGGCATCATCTACGTGGTGGACTCGGTGGACGTGGACCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GCTGCACGGACGGCATCATCTACGTGGTGGACTCGGTGGACGTGGACCGG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CTGGAGGAGGCCAAGACGGAGCTGCACAAGGTGACCAAGTTCGCCGAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CTGGAGGAGGCCAAGACGGAGCTGCACAAGGTGACCAAGTTCGCCGAGAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CCAGGGCACGCCGCTGCTGGTCATCGCCAACAAGCAGGACCTGCCCAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CCAGGGCACGCCGCTGCTGGTCATCGCCAACAAGCAGGACCTGCCCAAGT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 CGCTGCCGGTGGCAGAGATTGAGAAGCAGCTGGCGCTGCACGAGCTTATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 CGCTGCCGGTGGCAGAGATTGAGAAGCAGCTGGCGCTGCACGAGCTTATC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 CCGGCCACCACCTATCACGTCCAGCCGGCGTGCGCCATCATCGGCGAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 CCGGCCACCACCTATCACGTCCAGCCGGCGTGCGCCATCATCGGCGAGGG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CCTCACCGAGGGCATGGACAAGCTCTATGAGATGATCCTGAAACGCAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CCTCACCGAGGGCATGGACAAGCTCTATGAGATGATCCTGAAACGCAGGA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 AGTCCCTCAAGCAGAAGAAGAAGCG         GACTGGTGACTTAAGG
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 100551 AGTCCCTCAAGCAGAAGAAGAAGCGGTA...CAGGACTGGTGACTTAAGG

    600     .    :
    592 AGCTGCGAAGTC
        ||||||||||||
 100767 AGCTGCGAAGTC