seq1 = pF1KB8990.tfa, 1173 bp
seq2 = pF1KB8990/gi568815584f_96137108.tfa (gi568815584f:96137108_96341501), 204394 bp

>pF1KB8990 1173
>gi568815584f:96137108_96341501 (Chr14)

1-74  (100001-100074)   100% ->
75-1173  (103296-104394)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTTCTCTCCCTGGAAGATATCAATGTTTCTGTCTGTTCGTGAGGACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTTCTCTCCCTGGAAGATATCAATGTTTCTGTCTGTTCGTGAGGACTC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGTGCCCACCACGGCCTCTTTCAG         CGCCGACATGCTCAATG
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 100051 CGTGCCCACCACGGCCTCTTTCAGGTG...CAGCGCCGACATGCTCAATG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TCACCTTGCAAGGGCCCACTCTTAACGGGACCTTTGCCCAGAGCAAATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103313 TCACCTTGCAAGGGCCCACTCTTAACGGGACCTTTGCCCAGAGCAAATGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CCCCAAGTGGAGTGGCTGGGCTGGCTCAACACCATCCAGCCCCCCTTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103363 CCCCAAGTGGAGTGGCTGGGCTGGCTCAACACCATCCAGCCCCCCTTCCT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CTGGGTGCTGTTCGTGCTGGCCACCCTAGAGAACATCTTTGTCCTCAGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103413 CTGGGTGCTGTTCGTGCTGGCCACCCTAGAGAACATCTTTGTCCTCAGCG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TCTTCTGCCTGCACAAGAGCAGCTGCACGGTGGCAGAGATCTACCTGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103463 TCTTCTGCCTGCACAAGAGCAGCTGCACGGTGGCAGAGATCTACCTGGGG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 AACCTGGCCGCAGCAGACCTGATCCTGGCCTGCGGGCTGCCCTTCTGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103513 AACCTGGCCGCAGCAGACCTGATCCTGGCCTGCGGGCTGCCCTTCTGGGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 CATCACCATCTCCAACAACTTCGACTGGCTCTTTGGGGAGACGCTCTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103563 CATCACCATCTCCAACAACTTCGACTGGCTCTTTGGGGAGACGCTCTGCC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 GCGTGGTGAATGCCATTATCTCCATGAACCTGTACAGCAGCATCTGTTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103613 GCGTGGTGAATGCCATTATCTCCATGAACCTGTACAGCAGCATCTGTTTC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 CTGATGCTGGTGAGCATCGACCGCTACCTGGCCCTGGTGAAAACCATGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103663 CTGATGCTGGTGAGCATCGACCGCTACCTGGCCCTGGTGAAAACCATGTC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 CATGGGCCGGATGCGCGGCGTGCGCTGGGCCAAGCTCTACAGCTTGGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103713 CATGGGCCGGATGCGCGGCGTGCGCTGGGCCAAGCTCTACAGCTTGGTGA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 TCTGGGGGTGTACGCTGCTCCTGAGCTCACCCATGCTGGTGTTCCGGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103763 TCTGGGGGTGTACGCTGCTCCTGAGCTCACCCATGCTGGTGTTCCGGACC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 ATGAAGGAGTACAGCGATGAGGGCCACAACGTCACCGCTTGTGTCATCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103813 ATGAAGGAGTACAGCGATGAGGGCCACAACGTCACCGCTTGTGTCATCAG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 CTACCCATCCCTCATCTGGGAAGTGTTCACCAACATGCTCCTGAATGTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103863 CTACCCATCCCTCATCTGGGAAGTGTTCACCAACATGCTCCTGAATGTCG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 TGGGCTTCCTGCTGCCCCTGAGTGTCATCACCTTCTGCACGATGCAGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103913 TGGGCTTCCTGCTGCCCCTGAGTGTCATCACCTTCTGCACGATGCAGATC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 ATGCAGGTGCTGCGGAACAACGAGATGCAGAAGTTCAAGGAGATCCAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103963 ATGCAGGTGCTGCGGAACAACGAGATGCAGAAGTTCAAGGAGATCCAGAC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    792 AGAGAGGAGGGCCACGGTGCTAGTCCTGGTTGTGCTGCTGCTATTCATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104013 AGAGAGGAGGGCCACGGTGCTAGTCCTGGTTGTGCTGCTGCTATTCATCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    842 TCTGCTGGCTGCCCTTCCAGATCAGCACCTTCCTGGATACGCTGCATCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104063 TCTGCTGGCTGCCCTTCCAGATCAGCACCTTCCTGGATACGCTGCATCGC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    892 CTCGGCATCCTCTCCAGCTGCCAGGACGAGCGCATCATCGATGTAATCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104113 CTCGGCATCCTCTCCAGCTGCCAGGACGAGCGCATCATCGATGTAATCAC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    942 ACAGATCGCCTCCTTCATGGCCTACAGCAACAGCTGCCTCAACCCACTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104163 ACAGATCGCCTCCTTCATGGCCTACAGCAACAGCTGCCTCAACCCACTGG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    992 TGTACGTGATCGTGGGCAAGCGCTTCCGAAAGAAGTCTTGGGAGGTGTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104213 TGTACGTGATCGTGGGCAAGCGCTTCCGAAAGAAGTCTTGGGAGGTGTAC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1042 CAGGGAGTGTGCCAGAAAGGGGGCTGCAGGTCAGAACCCATTCAGATGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104263 CAGGGAGTGTGCCAGAAAGGGGGCTGCAGGTCAGAACCCATTCAGATGGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1092 GAACTCCATGGGCACACTGCGGACCTCCATCTCCGTGGAACGCCAGATTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104313 GAACTCCATGGGCACACTGCGGACCTCCATCTCCGTGGAACGCCAGATTC

   1150     .    :    .    :    .    :
   1142 ACAAACTGCAGGACTGGGCAGGGAGCAGACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||
 104363 ACAAACTGCAGGACTGGGCAGGGAGCAGACAG