seq1 = pF1KB8988.tfa, 1164 bp
seq2 = pF1KB8988/gi568815590r_10625741.tfa (gi568815590r:10625741_10830433), 204693 bp

>pF1KB8988 1164
>gi568815590r:10625741_10830433 (Chr8)

(complement)

1-238  (100001-100238)   100% ->
239-1164  (103768-104693)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCTTCGCTGCTGGGAGCCTACCCTTGGCCCGAGGGTCTCGAGTGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCTTCGCTGCTGGGAGCCTACCCTTGGCCCGAGGGTCTCGAGTGCCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGCCCTGGACGCCGAGCTGTCGGATGGACAATCGCCGCCGGCCGTCCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGCCCTGGACGCCGAGCTGTCGGATGGACAATCGCCGCCGGCCGTCCCCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GGCCCCCGGGGGACAAGGGCTCCGAGAGCCGTATCCGGCGGCCCATGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GGCCCCCGGGGGACAAGGGCTCCGAGAGCCGTATCCGGCGGCCCATGAAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GCCTTCATGGTTTGGGCCAAGGACGAGAGGAAACGGCTGGCAGTGCAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GCCTTCATGGTTTGGGCCAAGGACGAGAGGAAACGGCTGGCAGTGCAGAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CCCGGACCTGCACAACGCCGAGCTCAGCAAGATGCTGG         GAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 100201 CCCGGACCTGCACAACGCCGAGCTCAGCAAGATGCTGGGTG...CAGGAA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 AGTCGTGGAAGGCGCTGACGCTGTCCCAGAAGAGGCCGTACGTGGACGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103771 AGTCGTGGAAGGCGCTGACGCTGTCCCAGAAGAGGCCGTACGTGGACGAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GCGGAGCGGCTGCGCCTGCAGCACATGCAGGACTACCCCAACTACAAGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103821 GCGGAGCGGCTGCGCCTGCAGCACATGCAGGACTACCCCAACTACAAGTA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 CCGGCCGCGCAGGAAGAAGCAGGCCAAGCGGCTGTGCAAGCGCGTGGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103871 CCGGCCGCGCAGGAAGAAGCAGGCCAAGCGGCTGTGCAAGCGCGTGGACC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 CGGGCTTCCTTCTGAGCTCCCTCTCCCGGGACCAGAACGCCCTGCCGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103921 CGGGCTTCCTTCTGAGCTCCCTCTCCCGGGACCAGAACGCCCTGCCGGAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 AAGAGAAGCGGCAGCCGGGGGGCGCTGGGGGAGAAGGAGGACAGGGGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103971 AAGAGAAGCGGCAGCCGGGGGGCGCTGGGGGAGAAGGAGGACAGGGGTGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 GTACTCCCCCGGCACTGCCCTGCCCAGCCTCCGGGGCTGCTACCACGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104021 GTACTCCCCCGGCACTGCCCTGCCCAGCCTCCGGGGCTGCTACCACGAGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 GGCCGGCTGGTGGTGGCGGCGGCGGCACCCCGAGCAGTGTGGACACGTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104071 GGCCGGCTGGTGGTGGCGGCGGCGGCACCCCGAGCAGTGTGGACACGTAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 CCGTACGGGCTGCCCACACCTCCTGAAATGTCTCCCCTGGACGTGCTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104121 CCGTACGGGCTGCCCACACCTCCTGAAATGTCTCCCCTGGACGTGCTGGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 GCCGGAGCAGACCTTCTTCTCCTCCCCCTGCCAGGAGGAGCATGGCCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104171 GCCGGAGCAGACCTTCTTCTCCTCCCCCTGCCAGGAGGAGCATGGCCATC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 CCCGCCGCATCCCCCACCTGCCAGGGCACCCGTACTCACCGGAGTACGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104221 CCCGCCGCATCCCCCACCTGCCAGGGCACCCGTACTCACCGGAGTACGCC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 CCAAGCCCTCTCCACTGTAGCCACCCCCTGGGCTCCCTGGCCCTTGGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104271 CCAAGCCCTCTCCACTGTAGCCACCCCCTGGGCTCCCTGGCCCTTGGCCA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    792 GTCCCCCGGCGTCTCCATGATGTCCCCTGTACCCGGCTGTCCCCCATCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104321 GTCCCCCGGCGTCTCCATGATGTCCCCTGTACCCGGCTGTCCCCCATCTC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    842 CTGCCTATTACTCCCCGGCCACCTACCACCCACTCCACTCCAACCTCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104371 CTGCCTATTACTCCCCGGCCACCTACCACCCACTCCACTCCAACCTCCAA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    892 GCCCACCTGGGCCAGCTTTCCCCGCCTCCTGAGCACCCTGGCTTCGACGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104421 GCCCACCTGGGCCAGCTTTCCCCGCCTCCTGAGCACCCTGGCTTCGACGC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    942 CCTGGATCAACTGAGCCAGGTGGAACTCCTGGGGGACATGGATCGCAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104471 CCTGGATCAACTGAGCCAGGTGGAACTCCTGGGGGACATGGATCGCAATG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    992 AATTCGACCAGTATTTGAACACTCCTGGCCACCCAGACTCCGCCACAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104521 AATTCGACCAGTATTTGAACACTCCTGGCCACCCAGACTCCGCCACAGGG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1042 GCCATGGCCCTCAGTGGGCATGTTCCGGTCTCCCAGGTGACACCAACGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104571 GCCATGGCCCTCAGTGGGCATGTTCCGGTCTCCCAGGTGACACCAACGGG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1092 TCCCACAGAGACCAGCCTCATCTCCGTCCTGGCTGATGCCACGGCCACGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104621 TCCCACAGAGACCAGCCTCATCTCCGTCCTGGCTGATGCCACGGCCACGT

   1150     .    :    .    :
   1142 ACTACAACAGCTACAGTGTGTCA
        |||||||||||||||||||||||
 104671 ACTACAACAGCTACAGTGTGTCA