seq1 = pF1KB8985.tfa, 1161 bp
seq2 = pF1KB8985/gi568815590r_22590476.tfa (gi568815590r:22590476_22792944), 202469 bp

>pF1KB8985 1161
>gi568815590r:22590476_22792944 (Chr8)

(complement)

1-154  (100001-100154)   100% ->
155-1161  (101463-102469)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGACCGGCAAACTCGCCGAGAAGCTGCCGGTGACCATGAGCAGTTTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGACCGGCAAACTCGCCGAGAAGCTGCCGGTGACCATGAGCAGTTTGCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AAACCAACTGCCTGACAATCTGTACCCCGAGGAGATCCCCAGCGCGCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 AAACCAACTGCCTGACAATCTGTACCCCGAGGAGATCCCCAGCGCGCTCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ACCTCTTCTCCGGCAGCAGCGACTCGGTAGTCCATTACAATCAGATGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ACCTCTTCTCCGGCAGCAGCGACTCGGTAGTCCATTACAATCAGATGGCT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 ACAG         AGAATGTAATGGACATCGGTCTGACCAACGAGAAGCC
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 ACAGGTA...CAGAGAATGTAATGGACATCGGTCTGACCAACGAGAAGCC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CAACCCGGAACTCTCTTACTCCGGCTCCTTCCAGCCAGCCCCCGGCAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101500 CAACCCGGAACTCTCTTACTCCGGCTCCTTCCAGCCAGCCCCCGGCAACA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 AGACCGTGACCTACTTGGGAAAGTTCGCCTTCGACTCCCCTTCCAACTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101550 AGACCGTGACCTACTTGGGAAAGTTCGCCTTCGACTCCCCTTCCAACTGG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 TGCCAGGACAACATCATTAGCCTCATGAGCGCCGGCATCTTGGGGGTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101600 TGCCAGGACAACATCATTAGCCTCATGAGCGCCGGCATCTTGGGGGTGCC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 CCCGGCTTCAGGGGCGCTCAGCACGCAGACGTCCACGGCCAGCATGGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101650 CCCGGCTTCAGGGGCGCTCAGCACGCAGACGTCCACGGCCAGCATGGTGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 AGCCACCGCAGGGTGACGTGGAGGCCATGTATCCCGCGCTACCCCCCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101700 AGCCACCGCAGGGTGACGTGGAGGCCATGTATCCCGCGCTACCCCCCTAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 TCCAACTGCGGCGACCTCTACTCAGAGCCCGTGTCTTTCCACGACCCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101750 TCCAACTGCGGCGACCTCTACTCAGAGCCCGTGTCTTTCCACGACCCCCA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 GGGCAATCCCGGGCTCGCCTATTCCCCCCAGGATTACCAATCGGCCAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101800 GGGCAATCCCGGGCTCGCCTATTCCCCCCAGGATTACCAATCGGCCAAGC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 CGGCGTTGGACAGCAATCTCTTCCCCATGATTCCTGACTACAACCTCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101850 CGGCGTTGGACAGCAATCTCTTCCCCATGATTCCTGACTACAACCTCTAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 CACCACCCCAACGACATGGGCTCCATTCCGGAGCACAAGCCCTTCCAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101900 CACCACCCCAACGACATGGGCTCCATTCCGGAGCACAAGCCCTTCCAGGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 CATGGACCCCATCCGGGTCAACCCGCCCCCTATTACCCCTCTGGAGACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101950 CATGGACCCCATCCGGGTCAACCCGCCCCCTATTACCCCTCTGGAGACCA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 TCAAGGCATTCAAAGACAAGCAGATCCACCCGGGCTTTGGCAGCCTGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102000 TCAAGGCATTCAAAGACAAGCAGATCCACCCGGGCTTTGGCAGCCTGCCC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 CAGCCGCCGCTCACCCTCAAGCCCATCCGGCCCCGCAAGTACCCCAACCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102050 CAGCCGCCGCTCACCCTCAAGCCCATCCGGCCCCGCAAGTACCCCAACCG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    792 GCCTAGCAAGACACCGCTCCACGAACGGCCCCACGCGTGCCCGGCCGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102100 GCCTAGCAAGACACCGCTCCACGAACGGCCCCACGCGTGCCCGGCCGAGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    842 GCTGCGACCGCCGTTTCAGCCGTTCGGACGAGCTGACCCGGCACCTGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102150 GCTGCGACCGCCGTTTCAGCCGTTCGGACGAGCTGACCCGGCACCTGCGC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    892 ATCCACACGGGCCACAAGCCCTTCCAGTGCCGGATCTGCATGCGGAGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102200 ATCCACACGGGCCACAAGCCCTTCCAGTGCCGGATCTGCATGCGGAGCTT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    942 CAGCCGCAGCGACCACCTCACCACTCACATCCGCACTCATACGGGCGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102250 CAGCCGCAGCGACCACCTCACCACTCACATCCGCACTCATACGGGCGAGA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    992 AGCCCTTTGCCTGCGAGTTCTGCGGGCGCAAGTTTGCGCGCAGCGACGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102300 AGCCCTTTGCCTGCGAGTTCTGCGGGCGCAAGTTTGCGCGCAGCGACGAG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1042 CGCAAGCGCCACGCCAAGATCCACCTCAAGCAAAAGGAGAAGAAGGCGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102350 CGCAAGCGCCACGCCAAGATCCACCTCAAGCAAAAGGAGAAGAAGGCGGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1092 GAAGGGCGGTGCACCCTCTGCATCCTCGGCGCCCCCCGTGTCGCTGGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102400 GAAGGGCGGTGCACCCTCTGCATCCTCGGCGCCCCCCGTGTCGCTGGCCC

   1150     .    :    .    :
   1142 CCGTGGTCACCACCTGCGCC
        ||||||||||||||||||||
 102450 CCGTGGTCACCACCTGCGCC