seq1 = pF1KB8980.tfa, 1128 bp
seq2 = pF1KB8980/gi568815591r_27000729.tfa (gi568815591r:27000729_27202500), 201772 bp

>pF1KB8980 1128
>gi568815591r:27000729_27202500 (Chr7)

(complement)

1-391  (100001-100391)   100% ->
392-1128  (101036-101772)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAATTACGAATTTGAGCGAGAGATTGGTTTTATCAATAGCCAGCCGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAATTACGAATTTGAGCGAGAGATTGGTTTTATCAATAGCCAGCCGTC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCTCGCTGAGTGCCTGACATCTTTTCCCCCTGTCGCTGATACATTTCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCTCGCTGAGTGCCTGACATCTTTTCCCCCTGTCGCTGATACATTTCAAA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GTTCATCAATCAAGACCTCGACGCTTTCACACTCGACACTGATTCCTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GTTCATCAATCAAGACCTCGACGCTTTCACACTCGACACTGATTCCTCCT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CCTTTTGAGCAGACCATTCCCAGCCTGAACCCCGGCAGTCACCCTCGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CCTTTTGAGCAGACCATTCCCAGCCTGAACCCCGGCAGTCACCCTCGCCA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CGGCGCTGGCGGCCGCCCCAAGCCGAGCCCCGCGGGCAGCCGCGGCAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CGGCGCTGGCGGCCGCCCCAAGCCGAGCCCCGCGGGCAGCCGCGGCAGCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CGGTGCCCGCCGGCGCCCTGCAGCCGCCCGAGTACCCCTGGATGAAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CGGTGCCCGCCGGCGCCCTGCAGCCGCCCGAGTACCCCTGGATGAAGGAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 AAGAAGGCGGCCAAGAAAACCGCACTTCTGCCGGCCGCCGCCGCCGCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 AAGAAGGCGGCCAAGAAAACCGCACTTCTGCCGGCCGCCGCCGCCGCCGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CACCGCCGCAGCCACCGGCCCTGCTTGCCTCAGCCACAAAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 100351 CACCGCCGCAGCCACCGGCCCTGCTTGCCTCAGCCACAAAGGTC...CAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 AATCCCTGGAAATCGCCGATGGCAGCGGCGGGGGATCGCGGCGCCTGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101036 AATCCCTGGAAATCGCCGATGGCAGCGGCGGGGGATCGCGGCGCCTGAGA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 ACTGCTTACACCAACACACAGCTTCTAGAGCTGGAAAAAGAATTTCATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101086 ACTGCTTACACCAACACACAGCTTCTAGAGCTGGAAAAAGAATTTCATTT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 CAACAAGTACCTTTGCAGACCCCGAAGGGTGGAGATTGCAGCGCTGCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101136 CAACAAGTACCTTTGCAGACCCCGAAGGGTGGAGATTGCAGCGCTGCTGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 ATTTGACTGAGAGACAAGTGAAAGTGTGGTTTCAGAACCGGAGGATGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101186 ATTTGACTGAGAGACAAGTGAAAGTGTGGTTTCAGAACCGGAGGATGAAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 CACAAGAGGCAGACCCAGTGCAAGGAAAACCAAAACAGCGAAGGGAAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101236 CACAAGAGGCAGACCCAGTGCAAGGAAAACCAAAACAGCGAAGGGAAATG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 TAAAAGCCTTGAGGACTCCGAGAAAGTAGAGGAGGACGAGGAAGAGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101286 TAAAAGCCTTGAGGACTCCGAGAAAGTAGAGGAGGACGAGGAAGAGAAGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 CGCTCTTTGAGCAAGCCCTTAGCGTCTCTGGGGCCCTTCTGGAGAGGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101336 CGCTCTTTGAGCAAGCCCTTAGCGTCTCTGGGGCCCTTCTGGAGAGGGAA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 GGCTACACTTTTCAGCAAAATGCCCTCTCTCAGCAGCAGGCTCCCAATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101386 GGCTACACTTTTCAGCAAAATGCCCTCTCTCAGCAGCAGGCTCCCAATGG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    792 ACACAATGGCGACTCCCAAAGTTTCCCAGTCTCGCCTTTAACCAGCAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101436 ACACAATGGCGACTCCCAAAGTTTCCCAGTCTCGCCTTTAACCAGCAATG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    842 AGAAAAATCTGAAACATTTTCAGCACCAGTCACCCACTGTTCCCAACTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101486 AGAAAAATCTGAAACATTTTCAGCACCAGTCACCCACTGTTCCCAACTGC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    892 TTGTCAACAATGGGCCAGAACTGTGGAGCTGGCCTAAACAATGACAGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101536 TTGTCAACAATGGGCCAGAACTGTGGAGCTGGCCTAAACAATGACAGTCC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    942 TGAGGCCCTTGAGGTCCCCTCTTTGCAGGACTTTAGCGTTTTCTCCACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101586 TGAGGCCCTTGAGGTCCCCTCTTTGCAGGACTTTAGCGTTTTCTCCACAG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    992 ATTCCTGCCTGCAGCTTTCAGATGCAGTTTCACCCAGTTTGCCAGGTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101636 ATTCCTGCCTGCAGCTTTCAGATGCAGTTTCACCCAGTTTGCCAGGTTCC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1042 CTCGACAGTCCCGTAGATATTTCAGCTGACAGCTTAGACTTTTTTACAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101686 CTCGACAGTCCCGTAGATATTTCAGCTGACAGCTTAGACTTTTTTACAGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .
   1092 CACACTCACCACAATCGACTTGCAGCATCTGAATTAC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101736 CACACTCACCACAATCGACTTGCAGCATCTGAATTAC