seq1 = pF1KB8979.tfa, 1122 bp
seq2 = pF1KB8979/gi568815593r_76517585.tfa (gi568815593r:76517585_76723230), 205646 bp

>pF1KB8979 1122
>gi568815593r:76517585_76723230 (Chr5)

(complement)

1-64  (100001-100064)   100% ->
65-1122  (104589-105646)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAAAGCCCTCATCTTTGCAGCTGCTGGCCTCCTGCTTCTGTTGCCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAAAGCCCTCATCTTTGCAGCTGCTGGCCTCCTGCTTCTGTTGCCCAC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TTTTTGTCAGAGTG         GCATGGAAAATGATACAAACAACTTGG
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 100051 TTTTTGTCAGAGTGGTA...CAGGCATGGAAAATGATACAAACAACTTGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CAAAGCCAACCTTACCCATTAAGACCTTTCGTGGAGCTCCCCCAAATTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104616 CAAAGCCAACCTTACCCATTAAGACCTTTCGTGGAGCTCCCCCAAATTCT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TTTGAAGAGTTCCCCTTTTCTGCCTTGGAAGGCTGGACAGGAGCCACGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104666 TTTGAAGAGTTCCCCTTTTCTGCCTTGGAAGGCTGGACAGGAGCCACGAT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TACTGTAAAAATTAAGTGCCCTGAAGAAAGTGCTTCACATCTCCATGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104716 TACTGTAAAAATTAAGTGCCCTGAAGAAAGTGCTTCACATCTCCATGTGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 AAAATGCTACCATGGGGTACCTGACCAGCTCCTTAAGTACTAAACTGATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104766 AAAATGCTACCATGGGGTACCTGACCAGCTCCTTAAGTACTAAACTGATA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 CCTGCCATCTACCTCCTGGTGTTTGTAGTTGGTGTCCCGGCCAATGCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104816 CCTGCCATCTACCTCCTGGTGTTTGTAGTTGGTGTCCCGGCCAATGCTGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 GACCCTGTGGATGCTTTTCTTCAGGACCAGATCCATCTGTACCACTGTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104866 GACCCTGTGGATGCTTTTCTTCAGGACCAGATCCATCTGTACCACTGTAT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 TCTACACCAACCTGGCCATTGCAGATTTTCTTTTTTGTGTTACATTGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104916 TCTACACCAACCTGGCCATTGCAGATTTTCTTTTTTGTGTTACATTGCCC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 TTTAAGATAGCTTATCATCTCAATGGGAACAACTGGGTATTTGGAGAGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104966 TTTAAGATAGCTTATCATCTCAATGGGAACAACTGGGTATTTGGAGAGGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 CCTGTGCCGGGCCACCACAGTCATCTTCTATGGCAACATGTACTGCTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105016 CCTGTGCCGGGCCACCACAGTCATCTTCTATGGCAACATGTACTGCTCCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 TTCTGCTCCTTGCCTGCATCAGCATCAACCGCTACCTGGCCATCGTCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105066 TTCTGCTCCTTGCCTGCATCAGCATCAACCGCTACCTGGCCATCGTCCAT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 CCTTTCACCTACCGGGGCCTGCCCAAGCACACCTATGCCTTGGTAACATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105116 CCTTTCACCTACCGGGGCCTGCCCAAGCACACCTATGCCTTGGTAACATG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 TGGACTGGTGTGGGCAACAGTTTTCTTATATATGCTGCCATTTTTCATAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105166 TGGACTGGTGTGGGCAACAGTTTTCTTATATATGCTGCCATTTTTCATAC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 TGAAGCAGGAATATTATCTTGTTCAGCCAGACATCACCACCTGCCATGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105216 TGAAGCAGGAATATTATCTTGTTCAGCCAGACATCACCACCTGCCATGAT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 GTTCACAACACTTGCGAGTCCTCATCTCCCTTCCAACTCTATTACTTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105266 GTTCACAACACTTGCGAGTCCTCATCTCCCTTCCAACTCTATTACTTCAT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    792 CTCCTTGGCATTCTTTGGATTCTTAATTCCATTTGTGCTTATCATCTACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105316 CTCCTTGGCATTCTTTGGATTCTTAATTCCATTTGTGCTTATCATCTACT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    842 GCTATGCAGCCATCATCCGGACACTTAATGCATACGATCATAGATGGTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105366 GCTATGCAGCCATCATCCGGACACTTAATGCATACGATCATAGATGGTTG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    892 TGGTATGTTAAGGCGAGTCTCCTCATCCTTGTGATTTTTACCATTTGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105416 TGGTATGTTAAGGCGAGTCTCCTCATCCTTGTGATTTTTACCATTTGCTT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    942 TGCTCCAAGCAATATTATTCTTATTATTCACCATGCTAACTACTACTACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105466 TGCTCCAAGCAATATTATTCTTATTATTCACCATGCTAACTACTACTACA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    992 ACAACACTGATGGCTTATATTTTATATATCTCATAGCTTTGTGCCTGGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105516 ACAACACTGATGGCTTATATTTTATATATCTCATAGCTTTGTGCCTGGGT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1042 AGTCTTAATAGTTGCTTAGATCCATTCCTTTATTTTCTCATGTCAAAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105566 AGTCTTAATAGTTGCTTAGATCCATTCCTTTATTTTCTCATGTCAAAAAC

   1100     .    :    .    :    .    :
   1092 CAGAAATCACTCCACTGCTTACCTTACAAAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||
 105616 CAGAAATCACTCCACTGCTTACCTTACAAAA