seq1 = pF1KB8977.tfa, 1119 bp
seq2 = pF1KB8977/gi568815586r_54192377.tfa (gi568815586r:54192377_54395248), 202872 bp

>pF1KB8977 1119
>gi568815586r:54192377_54395248 (Chr12)

(complement)

1-114  (100001-100114)   100% ->
115-1119  (101868-102872)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCCCCGTGTCCTCCCCAGCAGAGCAGGAACAGGGTGATACAGCTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCCCCGTGTCCTCCCCAGCAGAGCAGGAACAGGGTGATACAGCTGTC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CACTTCAGAGCTAGGAGAGATGGAACTGACTTGGCAGGAGATCATGTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CACTTCAGAGCTAGGAGAGATGGAACTGACTTGGCAGGAGATCATGTCCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCACCGAGCTGCAG         GGTCTGAATGCTCCAAGTGAGCCATCA
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 100101 TCACCGAGCTGCAGGTG...CAGGGTCTGAATGCTCCAAGTGAGCCATCA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TTTGAGCCCCAAGCCCCAGCTCCATACCTTGGACCTCCACCACCCACAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101895 TTTGAGCCCCAAGCCCCAGCTCCATACCTTGGACCTCCACCACCCACAAC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TTACTGCCCCTGCTCAATCCACCCAGATTCTGGCTTCCCACTTCCTCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101945 TTACTGCCCCTGCTCAATCCACCCAGATTCTGGCTTCCCACTTCCTCCAC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CACCTTATGAGCTCCCAGCATCCACATCCCATGTCCCAGATCCCCCATAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101995 CACCTTATGAGCTCCCAGCATCCACATCCCATGTCCCAGATCCCCCATAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 TCCTATGGCAACATGGCCATACCAGTCTCCAAGCCACTGAGCCTCTCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102045 TCCTATGGCAACATGGCCATACCAGTCTCCAAGCCACTGAGCCTCTCAGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 CCTGCTCAGTGAGCCGCTCCAAGACCCCTTAGCCCTCCTGGACATTGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102095 CCTGCTCAGTGAGCCGCTCCAAGACCCCTTAGCCCTCCTGGACATTGGGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 TGCCAGCAGGGCCACCTAAGCCCCAAGAAGACCCAGAATCCGACTCAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102145 TGCCAGCAGGGCCACCTAAGCCCCAAGAAGACCCAGAATCCGACTCAGGA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 TTATCCCTCAACTATAGCGATGCTGAATCTCTTGAGCTGGAGGGGACAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102195 TTATCCCTCAACTATAGCGATGCTGAATCTCTTGAGCTGGAGGGGACAGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 GGCTGGTCGGCGGCGCAGCGAATATGTAGAGATGTACCCAGTGGAGTACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102245 GGCTGGTCGGCGGCGCAGCGAATATGTAGAGATGTACCCAGTGGAGTACC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 CCTACTCACTCATGCCCAACTCCTTGGCCCACTCCAACTATACCTTGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102295 CCTACTCACTCATGCCCAACTCCTTGGCCCACTCCAACTATACCTTGCCA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 GCTGCTGAGACCCCCTTGGCCTTAGAGCCCTCCTCAGGCCCTGTGCGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102345 GCTGCTGAGACCCCCTTGGCCTTAGAGCCCTCCTCAGGCCCTGTGCGGGC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 TAAGCCCACTGCACGGGGGGAGGCAGGGAGTCGGGATGAACGTCGGGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102395 TAAGCCCACTGCACGGGGGGAGGCAGGGAGTCGGGATGAACGTCGGGCCT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 TGGCCATGAAGATTCCTTTTCCTACGGACAAGATTGTCAACTTGCCGGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102445 TGGCCATGAAGATTCCTTTTCCTACGGACAAGATTGTCAACTTGCCGGTA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 GATGACTTTAATGAGCTATTGGCAAGGTACCCGCTGACAGAGAGCCAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102495 GATGACTTTAATGAGCTATTGGCAAGGTACCCGCTGACAGAGAGCCAGCT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    792 AGCGCTAGTCCGGGACATCCGACGACGGGGCAAAAACAAGGTGGCAGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102545 AGCGCTAGTCCGGGACATCCGACGACGGGGCAAAAACAAGGTGGCAGCCC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    842 AGAACTGCCGCAAGAGGAAGCTGGAAACCATTGTGCAGCTGGAGCGGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102595 AGAACTGCCGCAAGAGGAAGCTGGAAACCATTGTGCAGCTGGAGCGGGAG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    892 CTGGAGCGGCTGACCAATGAACGGGAGCGGCTTCTCAGGGCCCGCGGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102645 CTGGAGCGGCTGACCAATGAACGGGAGCGGCTTCTCAGGGCCCGCGGGGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    942 GGCAGACCGGACCCTGGAGGTCATGCGCCAACAGCTGACAGAGCTGTACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102695 GGCAGACCGGACCCTGGAGGTCATGCGCCAACAGCTGACAGAGCTGTACC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    992 GTGACATTTTCCAGCACCTTCGGGATGAATCAGGCAACAGCTACTCTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102745 GTGACATTTTCCAGCACCTTCGGGATGAATCAGGCAACAGCTACTCTCCT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1042 GAAGAGTACGCGCTGCAACAGGCTGCCGATGGGACCATCTTCCTTGTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102795 GAAGAGTACGCGCTGCAACAGGCTGCCGATGGGACCATCTTCCTTGTGCC

   1100     .    :    .    :    .
   1092 CCGGGGGACCAAGATGGAGGCCACAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||
 102845 CCGGGGGACCAAGATGGAGGCCACAGAC