seq1 = pF1KB8970.tfa, 1077 bp
seq2 = pF1KB8970/gi568815584f_52167815.tfa (gi568815584f:52167815_52374961), 207147 bp

>pF1KB8970 1077
>gi568815584f:52167815_52374961 (Chr14)

1-846  (100001-100846)   100% ->
847-1077  (106917-107147)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAAGTCGCCGTTCTACCGCTGCCAGAACACCACCTCTGTGGAAAAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAAGTCGCCGTTCTACCGCTGCCAGAACACCACCTCTGTGGAAAAAGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CAACTCGGCGGTGATGGGCGGGGTGCTCTTCAGCACCGGCCTCCTGGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CAACTCGGCGGTGATGGGCGGGGTGCTCTTCAGCACCGGCCTCCTGGGCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ACCTGCTGGCCCTGGGGCTGCTGGCGCGCTCGGGGCTGGGGTGGTGCTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ACCTGCTGGCCCTGGGGCTGCTGGCGCGCTCGGGGCTGGGGTGGTGCTCG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CGGCGTCCACTGCGCCCGCTGCCCTCGGTCTTCTACATGCTGGTGTGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CGGCGTCCACTGCGCCCGCTGCCCTCGGTCTTCTACATGCTGGTGTGTGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CCTGACGGTCACCGACTTGCTGGGCAAGTGCCTCCTAAGCCCGGTGGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CCTGACGGTCACCGACTTGCTGGGCAAGTGCCTCCTAAGCCCGGTGGTGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TGGCTGCCTACGCTCAGAACCGGAGTCTGCGGGTGCTTGCGCCCGCATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TGGCTGCCTACGCTCAGAACCGGAGTCTGCGGGTGCTTGCGCCCGCATTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GACAACTCGTTGTGCCAAGCCTTCGCCTTCTTCATGTCCTTCTTTGGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GACAACTCGTTGTGCCAAGCCTTCGCCTTCTTCATGTCCTTCTTTGGGCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CTCCTCGACACTGCAACTCCTGGCCATGGCACTGGAGTGCTGGCTCTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CTCCTCGACACTGCAACTCCTGGCCATGGCACTGGAGTGCTGGCTCTCCC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TAGGGCACCCTTTCTTCTACCGACGGCACATCACCCTGCGCCTGGGCGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TAGGGCACCCTTTCTTCTACCGACGGCACATCACCCTGCGCCTGGGCGCA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 CTGGTGGCCCCGGTGGTGAGCGCCTTCTCCCTGGCTTTCTGCGCGCTACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 CTGGTGGCCCCGGTGGTGAGCGCCTTCTCCCTGGCTTTCTGCGCGCTACC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 TTTCATGGGCTTCGGGAAGTTCGTGCAGTACTGCCCCGGCACCTGGTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 TTTCATGGGCTTCGGGAAGTTCGTGCAGTACTGCCCCGGCACCTGGTGCT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TTATCCAGATGGTCCACGAGGAGGGCTCGCTGTCGGTGCTGGGGTACTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TTATCCAGATGGTCCACGAGGAGGGCTCGCTGTCGGTGCTGGGGTACTCT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GTGCTCTACTCCAGCCTCATGGCGCTGCTGGTCCTCGCCACCGTGCTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 GTGCTCTACTCCAGCCTCATGGCGCTGCTGGTCCTCGCCACCGTGCTGTG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CAACCTCGGCGCCATGCGCAACCTCTATGCGATGCACCGGCGGCTGCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CAACCTCGGCGCCATGCGCAACCTCTATGCGATGCACCGGCGGCTGCAGC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 GGCACCCGCGCTCCTGCACCAGGGACTGTGCCGAGCCGCGCGCGGACGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 GGCACCCGCGCTCCTGCACCAGGGACTGTGCCGAGCCGCGCGCGGACGGG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 AGGGAAGCGTCCCCTCAGCCCCTGGAGGAGCTGGATCACCTCCTGCTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 AGGGAAGCGTCCCCTCAGCCCCTGGAGGAGCTGGATCACCTCCTGCTGCT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 GGCGCTGATGACCGTGCTCTTCACTATGTGTTCTCTGCCCGTAATT    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 100801 GGCGCTGATGACCGTGCTCTTCACTATGTGTTCTCTGCCCGTAATTGTG.

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847      TATCGCGCTTACTATGGAGCATTTAAGGATGTCAAGGAGAAAAAC
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 ..CAGTATCGCGCTTACTATGGAGCATTTAAGGATGTCAAGGAGAAAAAC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    892 AGGACCTCTGAAGAAGCAGAAGACCTCCGAGCCTTGCGATTTCTATCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106962 AGGACCTCTGAAGAAGCAGAAGACCTCCGAGCCTTGCGATTTCTATCTGT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    942 GATTTCAATTGTGGACCCTTGGATTTTTATCATTTTCAGATCTCCAGTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107012 GATTTCAATTGTGGACCCTTGGATTTTTATCATTTTCAGATCTCCAGTAT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    992 TTCGGATATTTTTTCACAAGATTTTCATTAGACCTCTTAGGTACAGGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107062 TTCGGATATTTTTTCACAAGATTTTCATTAGACCTCTTAGGTACAGGAGC

   1050     .    :    .    :    .    :    .
   1042 CGGTGCAGCAATTCCACTAACATGGAATCCAGTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107112 CGGTGCAGCAATTCCACTAACATGGAATCCAGTCTG