seq1 = pF1KB8965.tfa, 1062 bp
seq2 = pF1KB8965/gi568815582f_86410645.tfa (gi568815582f:86410645_86613082), 202438 bp

>pF1KB8965 1062
>gi568815582f:86410645_86613082 (Chr16)

1-904  (100001-100904)   100% ->
905-1062  (102281-102438)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGACCCCGCGTCGTCCGGCCCGTCCAAGGCCAAGAAGACCAACGCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGACCCCGCGTCGTCCGGCCCGTCCAAGGCCAAGAAGACCAACGCCGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CATCCGGCGCCCGGAGAAGCCGCCCTATTCCTACATCGCGCTCATCGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CATCCGGCGCCCGGAGAAGCCGCCCTATTCCTACATCGCGCTCATCGTCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGGCCATCCAGAGTTCACCCACCAAGCGCCTGACGCTGAGCGAGATCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TGGCCATCCAGAGTTCACCCACCAAGCGCCTGACGCTGAGCGAGATCTAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CAGTTCCTGCAGAGCCGCTTCCCCTTCTTCCGGGGCTCCTACCAGGGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CAGTTCCTGCAGAGCCGCTTCCCCTTCTTCCGGGGCTCCTACCAGGGCTG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GAAGAACTCCGTGCGCCACAACCTCTCGCTCAACGAGTGCTTCATCAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GAAGAACTCCGTGCGCCACAACCTCTCGCTCAACGAGTGCTTCATCAAGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TACCCAAGGGCCTTGGGCGGCCCGGCAAGGGCCACTACTGGACCATCGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TACCCAAGGGCCTTGGGCGGCCCGGCAAGGGCCACTACTGGACCATCGAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CCGGCCAGCGAGTTCATGTTCGAGGAGGGCTCCTTTCGGCGGCGGCCGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CCGGCCAGCGAGTTCATGTTCGAGGAGGGCTCCTTTCGGCGGCGGCCGCG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CGGCTTCCGAAGGAAATGCCAGGCGCTCAAGCCCATGTACAGCATGATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CGGCTTCCGAAGGAAATGCCAGGCGCTCAAGCCCATGTACAGCATGATGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 ACGGGCTCGGCTTCAACCACCTCCCGGACACCTACGGCTTCCAGGGCTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 ACGGGCTCGGCTTCAACCACCTCCCGGACACCTACGGCTTCCAGGGCTCG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GCCGGCGGCCTCTCGTGCCCGCCCAACAGCCTGGCGCTGGAGGGCGGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GCCGGCGGCCTCTCGTGCCCGCCCAACAGCCTGGCGCTGGAGGGCGGCCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GGGCATGATGAACGGCCACTTGCCGGGCAACGTGGACGGCATGGCCCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GGGCATGATGAACGGCCACTTGCCGGGCAACGTGGACGGCATGGCCCTGC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 CCAGCCACTCGGTGCCCCACCTGCCTTCCAACGGCGGCCACTCGTACATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 CCAGCCACTCGGTGCCCCACCTGCCTTCCAACGGCGGCCACTCGTACATG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GGCGGCTGCGGCGGCGCGGCGGCCGGCGAGTACCCGCACCACGACAGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 GGCGGCTGCGGCGGCGCGGCGGCCGGCGAGTACCCGCACCACGACAGCTC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 GGTGCCCGCCTCCCCGCTGCTGCCCACCGGCGCCGGTGGGGTCATGGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 GGTGCCCGCCTCCCCGCTGCTGCCCACCGGCGCCGGTGGGGTCATGGAGC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 CGCACGCCGTCTACTCGGGCTCGGCGGCGGCCTGGCCGCCCTCGGCGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 CGCACGCCGTCTACTCGGGCTCGGCGGCGGCCTGGCCGCCCTCGGCGTCC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 GCGGCGCTCAACAGCGGCGCCTCTTATATCAAGCAGCAGCCCCTGTCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 GCGGCGCTCAACAGCGGCGCCTCTTATATCAAGCAGCAGCCCCTGTCCCC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 CTGTAACCCCGCGGCCAACCCCCTGTCCGGCAGCCTCTCCACGCACTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 CTGTAACCCCGCGGCCAACCCCCTGTCCGGCAGCCTCTCCACGCACTCCC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 TGGAGCAGCCGTATCTGCACCAGAACAGCCACAACGCCCCAGCCGAGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 TGGAGCAGCCGTATCTGCACCAGAACAGCCACAACGCCCCAGCCGAGCTG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 CAAG         GCATCCCGCGGTATCACTCGCAGTCGCCCAGCATGTG
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 CAAGGTG...CAGGCATCCCGCGGTATCACTCGCAGTCGCCCAGCATGTG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    942 TGACCGAAAGGAGTTTGTCTTCTCTTTCAACGCCATGGCGTCCTCTTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102318 TGACCGAAAGGAGTTTGTCTTCTCTTTCAACGCCATGGCGTCCTCTTCCA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    992 TGCACTCGGCCGGCGGGGGCTCCTACTACCACCAGCAGGTCACCTACCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102368 TGCACTCGGCCGGCGGGGGCTCCTACTACCACCAGCAGGTCACCTACCAA

   1050     .    :    .    :
   1042 GACATCAAGCCTTGCGTGATG
        |||||||||||||||||||||
 102418 GACATCAAGCCTTGCGTGATG