seq1 = pF1KB8963.tfa, 1050 bp
seq2 = pF1KB8963/gi568815594r_186433692.tfa (gi568815594r:186433692_186655365), 221674 bp

>pF1KB8963 1050
>gi568815594r:186433692_186655365 (Chr4)

(complement)

1-184  (100001-100184)   100% ->
185-1050  (120809-121674)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCAGGGCAACGGCAGCGCGCTGCCCAACGCCTCCCAGCCCGTGCTCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCAGGGCAACGGCAGCGCGCTGCCCAACGCCTCCCAGCCCGTGCTCCG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGGGGACGGCGCGCGGCCCTCGTGGCTGGCGTCCGCCCTGGCCTGCGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CGGGGACGGCGCGCGGCCCTCGTGGCTGGCGTCCGCCCTGGCCTGCGTCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCATCTTCACCATCGTGGTGGACATCCTGGGCAACCTCCTGGTCATCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TCATCTTCACCATCGTGGTGGACATCCTGGGCAACCTCCTGGTCATCCTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TCGGTGTATCGGAACAAGAAGCTCAGGAACGCAG         GAAACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 100151 TCGGTGTATCGGAACAAGAAGCTCAGGAACGCAGGTA...CAGGAAACAT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CTTTGTGGTGAGCTTAGCGGTGGCAGACCTGGTGGTGGCCATTTATCCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120816 CTTTGTGGTGAGCTTAGCGGTGGCAGACCTGGTGGTGGCCATTTATCCGT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 ACCCGTTGGTGCTGATGTCGATATTTAACAACGGGTGGAACCTGGGCTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120866 ACCCGTTGGTGCTGATGTCGATATTTAACAACGGGTGGAACCTGGGCTAT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 CTGCACTGCCAAGTCAGTGGGTTCCTGATGGGCCTGAGCGTCATCGGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120916 CTGCACTGCCAAGTCAGTGGGTTCCTGATGGGCCTGAGCGTCATCGGCTC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 CATATTCAACATCACCGGCATCGCCATCAACCGCTACTGCTACATCTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120966 CATATTCAACATCACCGGCATCGCCATCAACCGCTACTGCTACATCTGCC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 ACAGTCTCAAGTACGACAAACTGTACAGCAGCAAGAACTCCCTCTGCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121016 ACAGTCTCAAGTACGACAAACTGTACAGCAGCAAGAACTCCCTCTGCTAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 GTGCTCCTCATATGGCTCCTGACGCTGGCGGCCGTCCTGCCCAACCTCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121066 GTGCTCCTCATATGGCTCCTGACGCTGGCGGCCGTCCTGCCCAACCTCCG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 TGCAGAGACTCTCCAGTACGACCCGAGGATCTACTCGTGCACCTTCGCCC
        ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121116 TGCAGGGACTCTCCAGTACGACCCGAGGATCTACTCGTGCACCTTCGCCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 AGTCCGTCAGCTCCGCCTACACCATCGCCGTGGTGGTTTTCCACTTCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121166 AGTCCGTCAGCTCCGCCTACACCATCGCCGTGGTGGTTTTCCACTTCCTC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 GTCCCCATGATCATAGTCATCTTCTGTTACCTGAGAATATGGATCCTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121216 GTCCCCATGATCATAGTCATCTTCTGTTACCTGAGAATATGGATCCTGGT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 TCTCCAGGTCAGACAGAGGGTGAAACCTGACCGCAAACCCAAACTGAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121266 TCTCCAGGTCAGACAGAGGGTGAAACCTGACCGCAAACCCAAACTGAAAC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 CACAGGACTTCAGGAATTTTGTCACCATGTTTGTGGTTTTTGTCCTTTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121316 CACAGGACTTCAGGAATTTTGTCACCATGTTTGTGGTTTTTGTCCTTTTT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 GCCATTTGCTGGGCTCCTCTGAACTTCATTGGCCTGGCCGTGGCCTCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121366 GCCATTTGCTGGGCTCCTCTGAACTTCATTGGCCTGGCCGTGGCCTCTGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    792 CCCCGCCAGCATGGTGCCTAGGATCCCAGAGTGGCTGTTTGTGGCCAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121416 CCCCGCCAGCATGGTGCCTAGGATCCCAGAGTGGCTGTTTGTGGCCAGTT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    842 ACTACATGGCGTATTTCAACAGCTGCCTCAATGCCATTATATACGGGCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121466 ACTACATGGCGTATTTCAACAGCTGCCTCAATGCCATTATATACGGGCTA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    892 CTGAACCAAAATTTCAGGAAGGAATACAGGAGAATTATAGTCTCGCTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121516 CTGAACCAAAATTTCAGGAAGGAATACAGGAGAATTATAGTCTCGCTCTG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    942 TACAGCCAGGGTGTTCTTTGTGGACAGCTCTAACGACGTGGCCGATAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121566 TACAGCCAGGGTGTTCTTTGTGGACAGCTCTAACGACGTGGCCGATAGGG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    992 TTAAATGGAAACCGTCTCCACTGATGACCAACAATAATGTAGTAAAGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121616 TTAAATGGAAACCGTCTCCACTGATGACCAACAATAATGTAGTAAAGGTG

   1050     .
   1042 GACTCCGTT
        |||||||||
 121666 GACTCCGTT