seq1 = pF1KB8958.tfa, 1005 bp
seq2 = pF1KB8958/gi568815591r_26994443.tfa (gi568815591r:26994443_27195912), 201470 bp

>pF1KB8958 1005
>gi568815591r:26994443_27195912 (Chr7)

(complement)

1-652  (100001-100652)   99% ->
653-1005  (101118-101470)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGACAATGCAAGAATGAACTCCTTCCTGGAATACCCCATACTTAGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGACAATGCAAGAATGAACTCCTTCCTGGAATACCCCATACTTAGCAG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGGCGACTCGGGGACCTGCTCAGCCCGAGCCTACCCCTCGGACCATAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TGGCGACTCGGGGACCTGCTCAGCCCGAGCCTACCCCTCGGACCATAGGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TTACAACTTTCCAGTCGTGCGCGGTCAGCGCCAACAGTTGCGGCGGCGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TTACAACTTTCCAGTCGTGCGCGGTCAGCGCCAACAGTTGCGGCGGCGAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GACCGCTTCCTAGTGGGCAGGGGGGTGCAGATCGGTTCGCCCCACCACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GACCGCTTCCTAGTGGGCAGGGGGGTGCAGATCGGTTCGCCCCACCACCA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CCACCACCACCACCATCACCACCCCCAGCCGGCTACCTACCAGACTTCCG
        ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CCACCACCACCACCATCGCCACCCCCAGCCGGCTACCTACCAGACTTCCG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GGAACCTGGGGGTGTCCTACTCCCACTCAAGTTGTGGTCCAAGCTATGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GGAACCTGGGGGTGTCCTACTCCCACTCAAGTTGTGGTCCAAGCTATGGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 TCACAGAACTTCAGTGCGCCTTACAGCCCCTACGCGTTAAATCAGGAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 TCACAGAACTTCAGTGCGCCTTACAGCCCCTACGCGTTAAATCAGGAAGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 AGACGTAAGTGGTGGGTACCCCCAGTGCGCTCCCGCTGTTTACTCTGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 AGACGTAAGTGGTGGGTACCCCCAGTGCGCTCCCGCTGTTTACTCTGGAA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 ATCTCTCATCTCCCATGGTCCAGCATCACCACCACCACCAGGGTTATGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 ATCTCTCATCTCCCATGGTCCAGCATCACCACCACCACCAGGGTTATGCT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GGGGGCGCGGTGGGCTCGCCTCAATACATTCACCACTCATATGGACAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GGGGGCGCGGTGGGCTCGCCTCAATACATTCACCACTCATATGGACAGGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GCACCAGAGCCTGGCCCTGGCTACGTATAATAACTCCTTGTCCCCTCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GCACCAGAGCCTGGCCCTGGCTACGTATAATAACTCCTTGTCCCCTCTCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 ACGCCAGCCACCAAGAAGCCTGTCGCTCCCCCGCATCGGAGACATCTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 ACGCCAGCCACCAAGAAGCCTGTCGCTCCCCCGCATCGGAGACATCTTCT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 CCAGCGCAGACTTTTGACTGGATGAAAGTCAAAAGAAACCCTCCCAAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 CCAGCGCAGACTTTTGACTGGATGAAAGTCAAAAGAAACCCTCCCAAAAC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 AG         GGAAAGTTGGAGAGTACGGCTACCTGGGTCAACCCAACG
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 AGGTC...CAGGGAAAGTTGGAGAGTACGGCTACCTGGGTCAACCCAACG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 CGGTGCGCACCAACTTCACTACCAAGCAGCTCACGGAACTGGAGAAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101157 CGGTGCGCACCAACTTCACTACCAAGCAGCTCACGGAACTGGAGAAGGAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 TTCCACTTCAACAAGTACCTGACGCGCGCCCGCAGGGTGGAGATCGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101207 TTCCACTTCAACAAGTACCTGACGCGCGCCCGCAGGGTGGAGATCGCTGC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    792 ATCCCTGCAGCTCAACGAGACCCAAGTGAAGATCTGGTTCCAGAACCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101257 ATCCCTGCAGCTCAACGAGACCCAAGTGAAGATCTGGTTCCAGAACCGCC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    842 GAATGAAGCAAAAGAAACGTGAGAAGGAGGGTCTCTTGCCCATCTCTCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101307 GAATGAAGCAAAAGAAACGTGAGAAGGAGGGTCTCTTGCCCATCTCTCCG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    892 GCCACCCCGCCAGGAAACGACGAGAAGGCCGAGGAATCCTCAGAGAAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101357 GCCACCCCGCCAGGAAACGACGAGAAGGCCGAGGAATCCTCAGAGAAGTC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    942 CAGCTCTTCGCCCTGCGTTCCTTCCCCGGGGTCTTCTACCTCAGACACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101407 CAGCTCTTCGCCCTGCGTTCCTTCCCCGGGGTCTTCTACCTCAGACACTC

   1000     .    :
    992 TGACTACCTCCCAC
        ||||||||||||||
 101457 TGACTACCTCCCAC