seq1 = pF1KB8947.tfa, 942 bp
seq2 = pF1KB8947/gi568815579r_2632754.tfa (gi568815579r:2632754_2837257), 204504 bp

>pF1KB8947 942
>gi568815579r:2632754_2837257 (Chr19)

(complement)

1-210  (100001-100210)   100% ->
211-942  (103773-104504)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGTGAAATTGCTAGTGGCCAAAATCCTGTGCATGGTGGGCGTGTTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGTGAAATTGCTAGTGGCCAAAATCCTGTGCATGGTGGGCGTGTTCTT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTTCATGCTGCTCGGCTCCCTGCTCCCCGTGAAGATCATCGAGACAGATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CTTCATGCTGCTCGGCTCCCTGCTCCCCGTGAAGATCATCGAGACAGATT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TTGAGAAGGCCCATCGCTCGAAAAAGATCCTCTCTCTCTGCAACACCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TTGAGAAGGCCCATCGCTCGAAAAAGATCCTCTCTCTCTGCAACACCTTT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GGAGGAGGGGTGTTTCTGGCCACGTGCTTCAACGCTCTGCTGCCCGCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GGAGGAGGGGTGTTTCTGGCCACGTGCTTCAACGCTCTGCTGCCCGCTGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GAGGGAAAAG         CTCCAGAAGGTCCTGAGCCTCGGCCACATCA
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GAGGGAAAAGGTA...CAGCTCCAGAAGGTCCTGAGCCTCGGCCACATCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 GCACCGACTACCCGCTGGCCGAAACCATCCTCCTGCTGGGCTTCTTCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103804 GCACCGACTACCCGCTGGCCGAAACCATCCTCCTGCTGGGCTTCTTCATG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 ACCGTCTTCCTGGAGCAGCTGATCCTGACCTTCCGCAAGGAGAAGCCGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103854 ACCGTCTTCCTGGAGCAGCTGATCCTGACCTTCCGCAAGGAGAAGCCGTC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 CTTCATCGACCTGGAGACCTTCAACGCCGGATCGGACGTGGGCAGCGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103904 CTTCATCGACCTGGAGACCTTCAACGCCGGATCGGACGTGGGCAGCGACT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 CGGAGTATGAGAGCCCCTTCATGGGGGGCGCGCGGGGCCACGCGCTGTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103954 CGGAGTATGAGAGCCCCTTCATGGGGGGCGCGCGGGGCCACGCGCTGTAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 GTGGAGCCCCACGGCCACGGCCCCAGCCTGAGCGTGCAGGGCCTCTCGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104004 GTGGAGCCCCACGGCCACGGCCCCAGCCTGAGCGTGCAGGGCCTCTCGCG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 CGCCAGCCCCGTGCGCCTGCTCAGCCTGGCCTTCGCGCTGTCGGCCCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104054 CGCCAGCCCCGTGCGCCTGCTCAGCCTGGCCTTCGCGCTGTCGGCCCACT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 CGGTCTTTGAGGGCCTGGCCCTGGGCCTGCAGGAGGAGGGGGAGAAAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104104 CGGTCTTTGAGGGCCTGGCCCTGGGCCTGCAGGAGGAGGGGGAGAAAGTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 GTGAGCCTGTTCGTGGGGGTGGCCGTCCACGAGACACTGGTGGCCGTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104154 GTGAGCCTGTTCGTGGGGGTGGCCGTCCACGAGACACTGGTGGCCGTGGC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 CCTGGGCATCAGCATGGCCCGGAGTGCCATGCCCCTGCGGGACGCGGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104204 CCTGGGCATCAGCATGGCCCGGAGTGCCATGCCCCTGCGGGACGCGGCCA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 AGCTGGCGGTCACCGTGAGCGCCATGATCCCCCTGGGCATCGGCCTGGGC
        |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
 104254 AGCTGGCGGTCACCGTAAGCGCCATGATCCCCCTGGGCATCGGCCTGGGC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 CTGGGCATTGAGAGCGCCCAGGGCGTGCCGGGCAGCGTGGCGTCCGTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104304 CTGGGCATTGAGAGCGCCCAGGGCGTGCCGGGCAGCGTGGCGTCCGTGCT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    792 GCTGCAGGGCCTGGCGGGCGGCACCTTCCTCTTCATCACCTTCCTGGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104354 GCTGCAGGGCCTGGCGGGCGGCACCTTCCTCTTCATCACCTTCCTGGAGA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    842 TCCTGGCCAAGGAGCTGGAGGAGAAGAGTGACCGTCTGCTCAAGGTCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104404 TCCTGGCCAAGGAGCTGGAGGAGAAGAGTGACCGTCTGCTCAAGGTCCTC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    892 TTCCTGGTGCTGGGCTACACCGTCCTGGCCGGGATGGTCTTCCTCAAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104454 TTCCTGGTGCTGGGCTACACCGTCCTGGCCGGGATGGTCTTCCTCAAGTG

    950 
    942 G
        |
 104504 G