seq1 = pF1KB8939.tfa, 873 bp
seq2 = pF1KB8939/gi568815596r_44906173.tfa (gi568815596r:44906173_45109110), 202938 bp

>pF1KB8939 873
>gi568815596r:44906173_45109110 (Chr2)

(complement)

1-560  (100001-100560)   100% ->
561-873  (102626-102938)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCCATGCTGCCCACCTTCGGCTTCACGCAGGAGCAAGTGGCGTGCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCCATGCTGCCCACCTTCGGCTTCACGCAGGAGCAAGTGGCGTGCGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GTGCGAGGTGCTGCAGCAGGGCGGCAACATCGAGCGGCTGGGCCGCTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GTGCGAGGTGCTGCAGCAGGGCGGCAACATCGAGCGGCTGGGCCGCTTCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGTGGTCGCTGCCCGCCTGCGAGCACCTTCACAAGAATGAAAGCGTGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TGTGGTCGCTGCCCGCCTGCGAGCACCTTCACAAGAATGAAAGCGTGCTC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 AAGGCCAAGGCCGTGGTGGCCTTCCACCGCGGCAACTTCCGCGAGCTCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 AAGGCCAAGGCCGTGGTGGCCTTCCACCGCGGCAACTTCCGCGAGCTCTA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CAAGATCCTGGAGAGCCACCAGTTCTCGCCGCACAACCACGCCAAGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CAAGATCCTGGAGAGCCACCAGTTCTCGCCGCACAACCACGCCAAGCTGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 AGCAGCTGTGGCTCAAGGCACACTACATCGAGGCGGAGAAGCTGCGCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 AGCAGCTGTGGCTCAAGGCACACTACATCGAGGCGGAGAAGCTGCGCGGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CGACCCCTGGGCGCCGTGGGCAAATACCGCGTGCGCCGCAAATTCCCGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CGACCCCTGGGCGCCGTGGGCAAATACCGCGTGCGCCGCAAATTCCCGCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GCCGCGCTCCATCTGGGACGGCGAGGAGACCAGCTACTGCTTCAAGGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GCCGCGCTCCATCTGGGACGGCGAGGAGACCAGCTACTGCTTCAAGGAAA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 AGAGTCGCAGCGTGCTGCGCGAGTGGTACGCGCACAACCCCTACCCTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 AGAGTCGCAGCGTGCTGCGCGAGTGGTACGCGCACAACCCCTACCCTTCA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 CCCCGCGAGAAGCGTGAGCTGGCGGAGGCCACGGGCCTCACCACCACACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 CCCCGCGAGAAGCGTGAGCTGGCGGAGGCCACGGGCCTCACCACCACACA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GGTCAGCAACTGGTTCAAGAACCGGCGGCAGCGCGACCGGGCGGCCGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GGTCAGCAACTGGTTCAAGAACCGGCGGCAGCGCGACCGGGCGGCCGAGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 CCAAGGAAAG         GGAGAACAACGAGAACTCCAATTCTAACAGC
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 CCAAGGAAAGGTA...CAGGGAGAACAACGAGAACTCCAATTCTAACAGC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 CACAACCCGCTGAATGGCAGCGGCAAGTCGGTGTTAGGCAGCTCGGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102657 CACAACCCGCTGAATGGCAGCGGCAAGTCGGTGTTAGGCAGCTCGGAGGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 TGAGAAGACTCCATCGGGGACGCCAGACCACTCATCATCCAGCCCCGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102707 TGAGAAGACTCCATCGGGGACGCCAGACCACTCATCATCCAGCCCCGCAC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 TGCTCCTCAGCCCGCCGCCCCCTGGGCTGCCGTCCCTGCACAGCCTGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102757 TGCTCCTCAGCCCGCCGCCCCCTGGGCTGCCGTCCCTGCACAGCCTGGGC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 CACCCTCCGGGCCCCAGCGCAGTGCCAGTGCCGGTGCCAGGCGGAGGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102807 CACCCTCCGGGCCCCAGCGCAGTGCCAGTGCCGGTGCCAGGCGGAGGTGG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    792 AGCGGACCCACTGCAACACCACCATGGCCTGCAGGACTCCATCCTCAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102857 AGCGGACCCACTGCAACACCACCATGGCCTGCAGGACTCCATCCTCAACC

    850     .    :    .    :    .    :
    842 CCATGTCAGCCAACCTCGTGGACCTGGGCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||
 102907 CCATGTCAGCCAACCTCGTGGACCTGGGCTCC