seq1 = pF1KB8934.tfa, 852 bp
seq2 = pF1KB8934/gi568815581r_48626793.tfa (gi568815581r:48626793_48828593), 201801 bp

>pF1KB8934 852
>gi568815581r:48626793_48828593 (Chr17)

(complement)

1-601  (100001-100601)   100% ->
602-852  (101551-101801)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAGCCCGGCAATTATGCCACCTTGGATGGAGCCAAGGATATCGAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAGCCCGGCAATTATGCCACCTTGGATGGAGCCAAGGATATCGAAGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTTGCTGGGAGCGGGAGGGGGGCGGAATCTGGTCGCCCACTCCCCTCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CTTGCTGGGAGCGGGAGGGGGGCGGAATCTGGTCGCCCACTCCCCTCTGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CCAGCCACCCAGCGGCGCCTACGCTGATGCCTGCTGTCAACTATGCCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CCAGCCACCCAGCGGCGCCTACGCTGATGCCTGCTGTCAACTATGCCCCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TTGGATCTGCCAGGCTCGGCGGAGCCGCCAAAGCAATGCCACCCATGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TTGGATCTGCCAGGCTCGGCGGAGCCGCCAAAGCAATGCCACCCATGCCC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TGGGGTGCCCCAGGGGACGTCCCCAGCTCCCGTGCCTTATGGTTACTTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 TGGGGTGCCCCAGGGGACGTCCCCAGCTCCCGTGCCTTATGGTTACTTTG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GAGGCGGGTACTACTCCTGCCGAGTGTCCCGGAGCTCGCTGAAACCCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GAGGCGGGTACTACTCCTGCCGAGTGTCCCGGAGCTCGCTGAAACCCTGT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GCCCAGGCAGCCACCCTGGCCGCGTACCCCGCGGAGACTCCCACGGCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GCCCAGGCAGCCACCCTGGCCGCGTACCCCGCGGAGACTCCCACGGCCGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GGAAGAGTACCCCAGCCGCCCCACTGAGTTTGCCTTCTATCCGGGATATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GGAAGAGTACCCCAGCCGCCCCACTGAGTTTGCCTTCTATCCGGGATATC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 CGGGAACCTACCAGCCTATGGCCAGTTACCTGGACGTGTCTGTGGTGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 CGGGAACCTACCAGCCTATGGCCAGTTACCTGGACGTGTCTGTGGTGCAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 ACTCTGGGTGCTCCTGGAGAACCGCGACATGACTCCCTGTTGCCTGTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 ACTCTGGGTGCTCCTGGAGAACCGCGACATGACTCCCTGTTGCCTGTGGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CAGTTACCAGTCTTGGGCTCTCGCTGGTGGCTGGAACAGCCAGATGTGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CAGTTACCAGTCTTGGGCTCTCGCTGGTGGCTGGAACAGCCAGATGTGTT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 GCCAGGGAGAACAGAACCCACCAGGTCCCTTTTGGAAGGCAGCATTTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 GCCAGGGAGAACAGAACCCACCAGGTCCCTTTTGGAAGGCAGCATTTGCA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 G         ACTCCAGCGGGCAGCACCCTCCTGACGCCTGCGCCTTTCG
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 GGTA...CAGACTCCAGCGGGCAGCACCCTCCTGACGCCTGCGCCTTTCG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 TCGCGGCCGCAAGAAACGCATTCCGTACAGCAAGGGGCAGTTGCGGGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101591 TCGCGGCCGCAAGAAACGCATTCCGTACAGCAAGGGGCAGTTGCGGGAGC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 TGGAGCGGGAGTATGCGGCTAACAAGTTCATCACCAAGGACAAGAGGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101641 TGGAGCGGGAGTATGCGGCTAACAAGTTCATCACCAAGGACAAGAGGCGC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 AAGATCTCGGCAGCCACCAGCCTCTCGGAGCGCCAGATTACCATCTGGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101691 AAGATCTCGGCAGCCACCAGCCTCTCGGAGCGCCAGATTACCATCTGGTT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    792 TCAGAACCGCCGGGTCAAAGAGAAGAAGGTTCTCGCCAAGGTGAAGAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101741 TCAGAACCGCCGGGTCAAAGAGAAGAAGGTTCTCGCCAAGGTGAAGAACA

    850     .    :
    842 GCGCTACCCCT
        |||||||||||
 101791 GCGCTACCCCT