seq1 = pF1KB8933.tfa, 852 bp
seq2 = pF1KB8933/gi568815584r_60546286.tfa (gi568815584r:60546286_60749189), 202904 bp

>pF1KB8933 852
>gi568815584r:60546286_60749189 (Chr14)

(complement)

1-560  (100001-100560)   99% ->
561-852  (102613-102904)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCGATGCTGCCGTCGTTTGGCTTTACGCAGGAGCAAGTGGCGTGCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCGATGCTGCCGTCGTTTGGCTTTACGCAGGAGCAAGTGGCGTGCGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GTGCGAGGTTCTGCAGCAAGGCGGAAACCTGGAGCGCCTGGGCAGGTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GTGCGAGGTTCTGCAGCAAGGCGGAAACCTGGAGCGCCTGGGCAGGTTCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGTGGTCACTGCCCGCCTGCGACCACCTGCACAAGAACGAGAGCGTACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TGTGGTCACTGCCCGCCTGCGACCACCTGCACAAGAACGAGAGCGTACTC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 AAGGCCAAGGCGGTGGTCGCCTTCCACCGCGGCAACTTCCGTGAGCTCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 AAGGCCAAGGCGGTGGTCGCCTTCCACCGCGGCAACTTCCGTGAGCTCTA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CAAGATCCTGGAGAGCCACCAGTTCTCGCCTCACAACCACCCCAAACTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CAAGATCCTGGAGAGCCACCAGTTCTCGCCTCACAACCACCCCAAACTGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 AGCAACTGTGGCTGAAGGCGCATTACGTGGAGGCCGAGAAGCTGTGCGGC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
 100251 AGCAACTGTGGCTGAAGGCGCATTACGTGGAGGCCGAGAAGCTGCGCGGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CGACCCCTGGGCGCCGTGGGCAAATATCGGGTGCGCCGAAAATTTCCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CGACCCCTGGGCGCCGTGGGCAAATATCGGGTGCGCCGAAAATTTCCACT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GCCGCGCACCATCTGGGACGGCGAGGAGACCAGCTACTGCTTCAAGGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GCCGCGCACCATCTGGGACGGCGAGGAGACCAGCTACTGCTTCAAGGAGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 AGTCGAGGGGTGTCCTGCGGGAGTGGTACGCGCACAATCCCTACCCATCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 AGTCGAGGGGTGTCCTGCGGGAGTGGTACGCGCACAATCCCTACCCATCG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 CCGCGTGAGAAGCGGGAGCTGGCCGAGGCCACCGGCCTCACCACCACCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 CCGCGTGAGAAGCGGGAGCTGGCCGAGGCCACCGGCCTCACCACCACCCA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GGTCAGCAACTGGTTTAAGAACCGGAGGCAAAGAGACCGGGCCGCGGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GGTCAGCAACTGGTTTAAGAACCGGAGGCAAAGAGACCGGGCCGCGGAGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 CCAAGGAAAG         GGAGAACACCGAAAACAATAACTCCTCCTCC
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 CCAAGGAAAGGTA...TAGGGAGAACACCGAAAACAATAACTCCTCCTCC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 AACAAGCAGAACCAACTCTCTCCTCTGGAAGGGGGCAAGCCGCTCATGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102644 AACAAGCAGAACCAACTCTCTCCTCTGGAAGGGGGCAAGCCGCTCATGTC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 CAGCTCAGAAGAGGAATTCTCACCTCCCCAAAGTCCAGACCAGAACTCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102694 CAGCTCAGAAGAGGAATTCTCACCTCCCCAAAGTCCAGACCAGAACTCGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 TCCTTCTGCTGCAGGGCAATATGGGCCACGCCAGGAGCTCAAACTATTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102744 TCCTTCTGCTGCAGGGCAATATGGGCCACGCCAGGAGCTCAAACTATTCT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 CTCCCGGGCTTAACAGCCTCGCAGCCCAGTCACGGCCTGCAGACCCACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102794 CTCCCGGGCTTAACAGCCTCGCAGCCCAGTCACGGCCTGCAGACCCACCA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    792 GCATCAGCTCCAAGACTCTCTGCTCGGCCCCCTCACCTCCAGTCTGGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102844 GCATCAGCTCCAAGACTCTCTGCTCGGCCCCCTCACCTCCAGTCTGGTGG

    850     .    :
    842 ACTTGGGGTCC
        |||||||||||
 102894 ACTTGGGGTCC