seq1 = pF1KB8930.tfa, 843 bp
seq2 = pF1KB8930/gi568815588r_101127273.tfa (gi568815588r:101127273_101328815), 201543 bp

>pF1KB8930 843
>gi568815588r:101127273_101328815 (Chr10)

(complement)

1-325  (100001-100325)   100% ->
326-843  (101026-101543)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGACTTCCAAGGAGGACGGCAAGGCGGCGCCGGGGGAGGAGCGGCGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGACTTCCAAGGAGGACGGCAAGGCGGCGCCGGGGGAGGAGCGGCGGCG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CAGCCCGCTGGACCACCTGCCTCCGCCTGCCAACTCCAACAAGCCACTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CAGCCCGCTGGACCACCTGCCTCCGCCTGCCAACTCCAACAAGCCACTGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CGCCGTTCAGCATCGAGGACATCCTCAACAAGCCGTCTGTGCGGAGAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CGCCGTTCAGCATCGAGGACATCCTCAACAAGCCGTCTGTGCGGAGAAGT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TACTCGCTGTGCGGGGCGGCGCACCTGCTGGCCGCCGCGGACAAGCACGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TACTCGCTGTGCGGGGCGGCGCACCTGCTGGCCGCCGCGGACAAGCACGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GCAGGGCGGCTTGCCCCTGGCGGGCCGCGCGCTGCTCTCGCAGACCTCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GCAGGGCGGCTTGCCCCTGGCGGGCCGCGCGCTGCTCTCGCAGACCTCGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CGCTGTGCGCGCTGGAGGAGCTCGCCAGCAAGACGTTTAAGGGGCTGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CGCTGTGCGCGCTGGAGGAGCTCGCCAGCAAGACGTTTAAGGGGCTGGAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GTCAGCGTTCTGCAGGCAGCCGAAG         GCCGCGACGGTATGAC
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 100301 GTCAGCGTTCTGCAGGCAGCCGAAGGTA...CAGGCCGCGACGGTATGAC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 CATCTTTGGGCAGCGGCAGACCCCTAAGAAGCGGCGAAAGTCGCGCACGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101042 CATCTTTGGGCAGCGGCAGACCCCTAAGAAGCGGCGAAAGTCGCGCACGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 CCTTCACCAACCACCAGATCTATGAATTGGAAAAGCGCTTTCTATACCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101092 CCTTCACCAACCACCAGATCTATGAATTGGAAAAGCGCTTTCTATACCAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 AAGTACCTGTCCCCCGCCGATCGCGACCAAATCGCGCAGCAGCTGGGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101142 AAGTACCTGTCCCCCGCCGATCGCGACCAAATCGCGCAGCAGCTGGGCCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 CACCAACGCGCAAGTCATCACCTGGTTCCAGAATCGGCGCGCTAAGCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101192 CACCAACGCGCAAGTCATCACCTGGTTCCAGAATCGGCGCGCTAAGCTCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 AGCGGGACCTGGAGGAGATGAAGGCCGACGTAGAGTCCGCCAAGAAACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101242 AGCGGGACCTGGAGGAGATGAAGGCCGACGTAGAGTCCGCCAAGAAACTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 GGCCCCAGCGGGCAGATGGACATCGTGGCGCTGGCCGAACTCGAGCAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101292 GGCCCCAGCGGGCAGATGGACATCGTGGCGCTGGCCGAACTCGAGCAGAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 CTCGGAGGCCACAGCCGGCGGTGGCGGCGGCTGCGGCAGGGCCAAGTCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101342 CTCGGAGGCCACAGCCGGCGGTGGCGGCGGCTGCGGCAGGGCCAAGTCGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 GGCCCGGCTCTCCGGTCCTCCCCCCAGGCGCCCCGAAGGCCCCGGGCGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101392 GGCCCGGCTCTCCGGTCCTCCCCCCAGGCGCCCCGAAGGCCCCGGGCGCT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 GGCGCCCTGCAGCTCTCGCCTGCCTCTCCGCTCACGGACCAGCCGGCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101442 GGCGCCCTGCAGCTCTCGCCTGCCTCTCCGCTCACGGACCAGCCGGCCAG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    792 CAGCCAGGACTGCTCGGAGGACGAGGAAGACGAAGAGATCGACGTGGACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101492 CAGCCAGGACTGCTCGGAGGACGAGGAAGACGAAGAGATCGACGTGGACG

    850 
    842 AT
        ||
 101542 AT