seq1 = pF1KB8927.tfa, 819 bp
seq2 = pF1KB8927/gi568815588f_123048379.tfa (gi568815588f:123048379_123250120), 201742 bp

>pF1KB8927 819
>gi568815588f:123048379_123250120 (Chr10)

1-268  (100001-100268)   100% ->
269-819  (101192-101742)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGCAGCAAAGAAGATGCGGGCAAGGGGTGTCCGGCGGCCGGTGGCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGCAGCAAAGAAGATGCGGGCAAGGGGTGTCCGGCGGCCGGTGGCGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTCCAGCTTCACCATCCAGTCCATCCTGGGCGGGGGCCCCTCGGAGGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CTCCAGCTTCACCATCCAGTCCATCCTGGGCGGGGGCCCCTCGGAGGCAC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CGCGGGAGCCCGTCGGCTGGCCAGCCAGGAAGCGCAGCCTGTCCGTGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CGCGGGAGCCCGTCGGCTGGCCAGCCAGGAAGCGCAGCCTGTCCGTGTCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TCGGAGGAGGAGGAGCCGGACGACGGCTGGAAGGCGCCCGCCTGCTTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TCGGAGGAGGAGGAGCCGGACGACGGCTGGAAGGCGCCCGCCTGCTTCTG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CCCAGACCAGCACGGCCCTAAGGAGCAGGGCCCCAAGCACCATCCCCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CCCAGACCAGCACGGCCCTAAGGAGCAGGGCCCCAAGCACCATCCCCCCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TCCCTTTTCCTTGCCTGG         GTACCCCCAAGGGCAGCGGAGGC
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 100251 TCCCTTTTCCTTGCCTGGGTA...CAGGTACCCCCAAGGGCAGCGGAGGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 TCGGGCCCGGGCGGCTTGGAGCGCACGCCTTTCCTCTCTCCTTCGCACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101215 TCGGGCCCGGGCGGCTTGGAGCGCACGCCTTTCCTCTCTCCTTCGCACTC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 GGACTTTAAAGAAGAGAAAGAGAGGCTCCTGCCCGCGGGCTCGCCCTCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101265 GGACTTTAAAGAAGAGAAAGAGAGGCTCCTGCCCGCGGGCTCGCCCTCGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 CGGGGTCCGAGCGGCCGCGGGACGGCGGCGCTGAGCGGCAGGCCGGCGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101315 CGGGGTCCGAGCGGCCGCGGGACGGCGGCGCTGAGCGGCAGGCCGGCGCG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 GCCAAGAAGAAGACGCGCACCGTCTTTTCGCGCAGCCAGGTGTACCAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101365 GCCAAGAAGAAGACGCGCACCGTCTTTTCGCGCAGCCAGGTGTACCAGCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 CGAGTCCACCTTCGACATGAAGCGCTACCTGAGCAGCTCGGAGCGCGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101415 CGAGTCCACCTTCGACATGAAGCGCTACCTGAGCAGCTCGGAGCGCGCCT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 GCCTCGCCTCCAGCCTGCAGCTCACGGAGACCCAGGTAAAGACTTGGTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101465 GCCTCGCCTCCAGCCTGCAGCTCACGGAGACCCAGGTAAAGACTTGGTTC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 CAGAACCGCCGCAACAAGTGGAAGCGGCAGCTCTCGGCTGAGCTGGAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101515 CAGAACCGCCGCAACAAGTGGAAGCGGCAGCTCTCGGCTGAGCTGGAGGC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 GGCCAACATGGCGCACGCGTCGGCGCAGACTCTGGTGAGCATGCCGCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101565 GGCCAACATGGCGCACGCGTCGGCGCAGACTCTGGTGAGCATGCCGCTGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 TGTTCCGGGACAGTTCGCTGCTGCGCGTGCCGGTGCCGCGCTCGCTCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101615 TGTTCCGGGACAGTTCGCTGCTGCGCGTGCCGGTGCCGCGCTCGCTCGCC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 TTTCCCGCGCCGCTCTACTACCCGGGAAGCAACCTCTCGGCCTTACCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101665 TTTCCCGCGCCGCTCTACTACCCGGGAAGCAACCTCTCGGCCTTACCTCT

    800     .    :    .    :    .
    792 CTACAACCTATACAACAAGCTCGACTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||
 101715 CTACAACCTATACAACAAGCTCGACTAC