seq1 = pF1KB8925.tfa, 819 bp
seq2 = pF1KB8925/gi568815578r_21411926.tfa (gi568815578r:21411926_21613669), 201744 bp

>pF1KB8925 819
>gi568815578r:21411926_21613669 (Chr20)

(complement)

1-259  (100001-100259)   100% ->
260-819  (101185-101744)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCGCTGACCAACACAAAGACGGGGTTTTCGGTCAAGGACATCTTAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCGCTGACCAACACAAAGACGGGGTTTTCGGTCAAGGACATCTTAGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCTGCCGGACACCAACGATGAGGAGGGCTCTGTGGCCGAAGGTCCGGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCTGCCGGACACCAACGATGAGGAGGGCTCTGTGGCCGAAGGTCCGGAGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AAGAGAACGAGGGGCCCGAGCCAGCCAAGAGGGCCGGGCCGCTGGGGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AAGAGAACGAGGGGCCCGAGCCAGCCAAGAGGGCCGGGCCGCTGGGGCAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GGCGCCCTGGACGCGGTGCAGAGCCTGCCCCTGAAGAACCCCTTCTACGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GGCGCCCTGGACGCGGTGCAGAGCCTGCCCCTGAAGAACCCCTTCTACGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CAGCAGCGACAACCCGTACACGCGCTGGCTGGCCAGCACCGAGGGCCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CAGCAGCGACAACCCGTACACGCGCTGGCTGGCCAGCACCGAGGGCCTTC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 AGTACTCCC         TGCACGGTCTGGCTGCCGGGGCGCCCCCTCAG
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 AGTACTCCCGTA...CAGTGCACGGTCTGGCTGCCGGGGCGCCCCCTCAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GACTCAAGCTCCAAGTCCCCGGAGCCCTCGGCCGACGAGTCACCGGACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101217 GACTCAAGCTCCAAGTCCCCGGAGCCCTCGGCCGACGAGTCACCGGACAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 TGACAAGGAGACCCCGGGCGGCGGGGGGGACGCCGGCAAGAAGCGAAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101267 TGACAAGGAGACCCCGGGCGGCGGGGGGGACGCCGGCAAGAAGCGAAAGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 GGCGAGTGCTTTTCTCCAAGGCGCAGACCTACGAGCTGGAGCGGCGCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101317 GGCGAGTGCTTTTCTCCAAGGCGCAGACCTACGAGCTGGAGCGGCGCTTT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 CGGCAGCAGCGGTACCTGTCGGCGCCCGAGCGCGAACACCTGGCCAGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101367 CGGCAGCAGCGGTACCTGTCGGCGCCCGAGCGCGAACACCTGGCCAGCCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 CATCCGCCTCACGCCCACGCAGGTCAAGATCTGGTTCCAGAACCACCGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101417 CATCCGCCTCACGCCCACGCAGGTCAAGATCTGGTTCCAGAACCACCGCT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 ACAAGATGAAGCGCGCCCGGGCCGAGAAAGGTATGGAGGTGACGCCCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101467 ACAAGATGAAGCGCGCCCGGGCCGAGAAAGGTATGGAGGTGACGCCCCTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 CCCTCGCCGCGCCGGGTGGCCGTGCCCGTCTTGGTCAGGGACGGCAAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101517 CCCTCGCCGCGCCGGGTGGCCGTGCCCGTCTTGGTCAGGGACGGCAAACC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 ATGTCACGCGCTCAAAGCCCAGGACCTGGCAGCCGCCACCTTCCAGGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101567 ATGTCACGCGCTCAAAGCCCAGGACCTGGCAGCCGCCACCTTCCAGGCGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 GCATTCCCTTTTCTGCCTACAGCGCGCAGTCGCTGCAGCACATGCAGTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101617 GCATTCCCTTTTCTGCCTACAGCGCGCAGTCGCTGCAGCACATGCAGTAC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 AACGCCCAGTACAGCTCGGCCAGCACCCCCCAGTACCCGACAGCACACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101667 AACGCCCAGTACAGCTCGGCCAGCACCCCCCAGTACCCGACAGCACACCC

    800     .    :    .    :    .
    792 CCTGGTCCAGGCCCAGCAGTGGACTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||
 101717 CCTGGTCCAGGCCCAGCAGTGGACTTGG