seq1 = pF1KB8923.tfa, 810 bp
seq2 = pF1KB8923/gi568815591r_27041838.tfa (gi568815591r:27041838_27243607), 201770 bp

>pF1KB8923 810
>gi568815591r:27041838_27243607 (Chr7)

(complement)

1-562  (100001-100562)   100% ->
563-810  (101523-101770)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAGCTCTTATTTTGTAAACTCATTTTGCGGTCGCTATCCAAATGGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAGCTCTTATTTTGTAAACTCATTTTGCGGTCGCTATCCAAATGGCCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGACTACCAGTTGCATAATTATGGAGATCATAGTTCCGTGAGCGAGCAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGACTACCAGTTGCATAATTATGGAGATCATAGTTCCGTGAGCGAGCAAT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCAGGGACTCGGCGAGCATGCACTCCGGCAGGTACGGCTACGGCTACAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TCAGGGACTCGGCGAGCATGCACTCCGGCAGGTACGGCTACGGCTACAAT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GGCATGGATCTCAGCGTCGGCCGCTCGGGCTCCGGCCACTTTGGCTCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GGCATGGATCTCAGCGTCGGCCGCTCGGGCTCCGGCCACTTTGGCTCCGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 AGAGCGCGCCCGCAGCTACGCTGCCAGCGCCAGCGCGGCGCCCGCCGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 AGAGCGCGCCCGCAGCTACGCTGCCAGCGCCAGCGCGGCGCCCGCCGAGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CCAGGTACAGCCAGCCGGCCACGTCCACGCACTCTCCTCAGCCCGATCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CCAGGTACAGCCAGCCGGCCACGTCCACGCACTCTCCTCAGCCCGATCCG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CTGCCCTGCTCCGCCGTGGCCCCCTCGCCCGGCAGCGACAGCCACCACGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CTGCCCTGCTCCGCCGTGGCCCCCTCGCCCGGCAGCGACAGCCACCACGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CGGGAAAAACTCCCTAAGCAACTCCAGCGGCGCCTCGGCCGACGCCGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CGGGAAAAACTCCCTAAGCAACTCCAGCGGCGCCTCGGCCGACGCCGGCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 GCACCCACATCAGCAGCAGAGAGGGGGTTGGCACGGCGTCCGGAGCCGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 GCACCCACATCAGCAGCAGAGAGGGGGTTGGCACGGCGTCCGGAGCCGAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GAGGACGCCCCTGCCAGCAGCGAGCAGGCGAGTGCGCAGAGCGAGCCGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GAGGACGCCCCTGCCAGCAGCGAGCAGGCGAGTGCGCAGAGCGAGCCGAG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CCCGGCGCCGCCCGCCCAACCCCAGATCTACCCCTGGATGCGCAAGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CCCGGCGCCGCCCGCCCAACCCCAGATCTACCCCTGGATGCGCAAGCTGC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 ACATAAGTCATG         ACAACATAGGCGGCCCGGAAGGCAAAAGG
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 100551 ACATAAGTCATGGTA...CAGACAACATAGGCGGCCCGGAAGGCAAAAGG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 GCCCGGACGGCCTACACGCGCTACCAGACCCTGGAGCTGGAGAAGGAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101552 GCCCGGACGGCCTACACGCGCTACCAGACCCTGGAGCTGGAGAAGGAGTT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 CCACTTCAACCGTTACCTGACCCGCAGAAGGAGGATTGAAATAGCACATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101602 CCACTTCAACCGTTACCTGACCCGCAGAAGGAGGATTGAAATAGCACATG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 CTCTTTGCCTCTCCGAGAGACAAATTAAAATCTGGTTCCAAAACCGGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101652 CTCTTTGCCTCTCCGAGAGACAAATTAAAATCTGGTTCCAAAACCGGAGA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 ATGAAGTGGAAAAAAGATAATAAGCTGAAAAGCATGAGCATGGCCGCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101702 ATGAAGTGGAAAAAAGATAATAAGCTGAAAAGCATGAGCATGGCCGCGGC

    800     .    :    .
    792 AGGAGGGGCCTTCCGTCCC
        |||||||||||||||||||
 101752 AGGAGGGGCCTTCCGTCCC