seq1 = pF1KB8922.tfa, 807 bp
seq2 = pF1KB8922/gi568815581r_48492212.tfa (gi568815581r:48492212_48693682), 201471 bp

>pF1KB8922 807
>gi568815581r:48492212_48693682 (Chr17)

(complement)

1-562  (100001-100562)   99% ->
563-807  (101227-101471)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAGCTCGTACTTTGTAAACTCCTTCTCGGGGCGTTATCCAAATGGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAGCTCGTACTTTGTAAACTCCTTCTCGGGGCGTTATCCAAATGGCCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGACTATCAGTTGCTAAATTATGGCAGTGGCAGCTCTCTGAGCGGCTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGACTATCAGTTGCTAAATTATGGCAGTGGCAGCTCTCTGAGCGGCTCTT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ACAGGGATCCCGCTGCCATGCACACCGGCTCTTACGGCTACAATTACAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ACAGGGATCCCGCTGCCATGCACACCGGCTCTTACGGCTACAATTACAAT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GGGATGGACCTCAGCGTCAACCGCTCCTCGGCCTCCTCCAGCCACTTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GGGATGGACCTCAGCGTCAACCGCTCCTCGGCCTCCTCCAGCCACTTTGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GGCGGTGGGCGAGAGCTCGCGCGCCTTCCCCGCGCCCGCCCAGGAGCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GGCGGTGGGCGAGAGCTCGCGCGCCTTCCCCGCGCCCGCCCAGGAGCCCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GCTTCAGGCAAGCGGCTTCGAGCTGCTCCCTGTCCTCGCCCGAGTCCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GCTTCAGGCAAGCGGCTTCGAGCTGCTCCCTGTCCTCGCCCGAGTCCCTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CCCTGCACCAACGGCGACAGCCACGGCGCCAAGCCCTCTGCTTCGTCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CCCTGCACCAACGGCGACAGCCACGGCGCCAAGCCCTCTGCTTCGTCCCC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CTCCGACCAGGCGACCTCAGCCAGCTCCAGCGCCAATTTCACCGAAATAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CTCCGACCAGGCGACCTCAGCCAGCTCCAGCGCCAATTTCACCGAAATAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 ACGAGGCCAGCGCGTCCTCGGAGCCTGAGGAAGCGGCAAGCCAGCTAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 ACGAGGCCAGCGCGTCCTCGGAGCCTGAGGAAGCGGCAAGCCAGCTAAGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 AGCCCCAGCCTAGCTCGGGCGCAGCCAGAGCCCATGGCCACCTCCACAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 AGCCCCAGCCTAGCTCGGGCGCAGCCAGAGCCCATGGCCACCTCCACAGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CGCGCCCGAGGGGCAGACTCCGCAGATATTCCCCTGGATGAGGAAGCTTC
        |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
 100501 CGCGCCCGAGGGGCAGACTCCGCAAATATTCCCCTGGATGAGGAAGCTTC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 ACATCAGCCATG         ATATGACCGGGCCGGACGGGAAAAGGGCC
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 100551 ACATCAGCCATGGTA...CAGATATGACCGGGCCGGACGGGAAAAGGGCC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 CGGACCGCGTATACCCGCTACCAGACCCTGGAGCTGGAAAAGGAGTTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101256 CGGACCGCGTATACCCGCTACCAGACCCTGGAGCTGGAAAAGGAGTTCCA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 CTTCAACCGCTACCTGACCCGGCGACGGCGCATCGAGATCGCCCACGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101306 CTTCAACCGCTACCTGACCCGGCGACGGCGCATCGAGATCGCCCACGCAC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 TCTGCCTGTCCGAGCGCCAGATCAAGATCTGGTTCCAGAACCGGCGCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101356 TCTGCCTGTCCGAGCGCCAGATCAAGATCTGGTTCCAGAACCGGCGCATG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 AAGTGGAAGAAGGACAACAAATTGAAAAGTATGAGCCTGGCTACAGCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101406 AAGTGGAAGAAGGACAACAAATTGAAAAGTATGAGCCTGGCTACAGCTGG

    800     .    :    .
    792 CAGCGCCTTCCAGCCC
        ||||||||||||||||
 101456 CAGCGCCTTCCAGCCC