seq1 = pF1KB8920.tfa, 801 bp
seq2 = pF1KB8920/gi568815596r_25061084.tfa (gi568815596r:25061084_25264772), 203689 bp

>pF1KB8920 801
>gi568815596r:25061084_25264772 (Chr2)

(complement)

1-132  (100001-100132)   100% ->
133-801  (103021-103689)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCCGAGATCGTGCTGCAGCCGCTCGGGGGCCCTGTTGCTGGCCTTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCCGAGATCGTGCTGCAGCCGCTCGGGGGCCCTGTTGCTGGCCTTGCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCTTCAGGCCTCCATGGAAGTGCGTGGCTGGTGCCTGGAGAGCAGCCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCTTCAGGCCTCCATGGAAGTGCGTGGCTGGTGCCTGGAGAGCAGCCAGT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GTCAGGACCTCACCACGGAAAGCAACCTGCTG         GAGTGCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 100101 GTCAGGACCTCACCACGGAAAGCAACCTGCTGGTA...CAGGAGTGCATC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CGGGCCTGCAAGCCCGACCTCTCGGCCGAGACTCCCATGTTCCCGGGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103030 CGGGCCTGCAAGCCCGACCTCTCGGCCGAGACTCCCATGTTCCCGGGAAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TGGCGACGAGCAGCCTCTGACCGAGAACCCCCGGAAGTACGTCATGGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103080 TGGCGACGAGCAGCCTCTGACCGAGAACCCCCGGAAGTACGTCATGGGCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 ACTTCCGCTGGGACCGATTCGGCCGCCGCAACAGCAGCAGCAGCGGCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103130 ACTTCCGCTGGGACCGATTCGGCCGCCGCAACAGCAGCAGCAGCGGCAGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 AGCGGCGCAGGGCAGAAGCGCGAGGACGTCTCAGCGGGCGAAGACTGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103180 AGCGGCGCAGGGCAGAAGCGCGAGGACGTCTCAGCGGGCGAAGACTGCGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 CCCGCTGCCTGAGGGCGGCCCCGAGCCCCGCAGCGATGGTGCCAAGCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103230 CCCGCTGCCTGAGGGCGGCCCCGAGCCCCGCAGCGATGGTGCCAAGCCGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 GCCCGCGCGAGGGCAAGCGCTCCTACTCCATGGAGCACTTCCGCTGGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103280 GCCCGCGCGAGGGCAAGCGCTCCTACTCCATGGAGCACTTCCGCTGGGGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 AAGCCGGTGGGCAAGAAGCGGCGCCCAGTGAAGGTGTACCCTAACGGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103330 AAGCCGGTGGGCAAGAAGCGGCGCCCAGTGAAGGTGTACCCTAACGGCGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 CGAGGACGAGTCGGCCGAGGCCTTCCCCCTGGAGTTCAAGAGGGAGCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103380 CGAGGACGAGTCGGCCGAGGCCTTCCCCCTGGAGTTCAAGAGGGAGCTGA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 CTGGCCAGCGACTCCGGGAGGGAGATGGCCCCGACGGCCCTGCCGATGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103430 CTGGCCAGCGACTCCGGGAGGGAGATGGCCCCGACGGCCCTGCCGATGAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 GGCGCAGGGGCCCAGGCCGACCTGGAGCACAGCCTGCTGGTGGCGGCCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103480 GGCGCAGGGGCCCAGGCCGACCTGGAGCACAGCCTGCTGGTGGCGGCCGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 GAAGAAGGACGAGGGCCCCTACAGGATGGAGCACTTCCGCTGGGGCAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103530 GAAGAAGGACGAGGGCCCCTACAGGATGGAGCACTTCCGCTGGGGCAGCC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 CGCCCAAGGACAAGCGCTACGGCGGTTTCATGACCTCCGAGAAGAGCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103580 CGCCCAAGGACAAGCGCTACGGCGGTTTCATGACCTCCGAGAAGAGCCAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 ACGCCCCTGGTGACGCTGTTCAAAAACGCCATCATCAAGAACGCCTACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103630 ACGCCCCTGGTGACGCTGTTCAAAAACGCCATCATCAAGAACGCCTACAA

    800     .    :
    792 GAAGGGCGAG
        ||||||||||
 103680 GAAGGGCGAG