seq1 = pF1KB8913.tfa, 759 bp
seq2 = pF1KB8913/gi568815578r_46586756.tfa (gi568815578r:46586756_46789414), 202659 bp

>pF1KB8913 759
>gi568815578r:46586756_46789414 (Chr20)

(complement)

1-283  (100001-100283)   100% ->
284-759  (102184-102659)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGGCGGCCAGAGCTACTACGCCGGCCGATGGCGAGGAGCCCGCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGGCGGCCAGAGCTACTACGCCGGCCGATGGCGAGGAGCCCGCCCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGAGGCTGAGGCTCTGGCCGCAGCCCGGGAGCGGAGCAGCCGCTTCTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGAGGCTGAGGCTCTGGCCGCAGCCCGGGAGCGGAGCAGCCGCTTCTTGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCGGCCTGGAGCTGGTGAAGCAGGGTGCCGAGGCGCGCGTGTTCCGTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GCGGCCTGGAGCTGGTGAAGCAGGGTGCCGAGGCGCGCGTGTTCCGTGGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CGCTTCCAGGGCCGCGCGGCGGTGATCAAGCACCGCTTCCCCAAGGGCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CGCTTCCAGGGCCGCGCGGCGGTGATCAAGCACCGCTTCCCCAAGGGCTA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CCGGCACCCGGCGCTGGAGGCGCGGCTTGGCAGACGGCGGACGGTGCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CCGGCACCCGGCGCTGGAGGCGCGGCTTGGCAGACGGCGGACGGTGCAGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 AGGCCCGGGCGCTCCTCCGCTGTCGCCGCGCTG         GAATATCT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 100251 AGGCCCGGGCGCTCCTCCGCTGTCGCCGCGCTGGTA...CAGGAATATCT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GCCCCAGTTGTCTTTTTTGTGGACTATGCTTCCAACTGCTTATATATGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102192 GCCCCAGTTGTCTTTTTTGTGGACTATGCTTCCAACTGCTTATATATGGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 AGAAATTGAAGGCTCAGTGACTGTTCGAGATTATATTCAGTCCACTATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102242 AGAAATTGAAGGCTCAGTGACTGTTCGAGATTATATTCAGTCCACTATGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 AGACTGAAAAAACTCCCCAGGGTCTCTCCAACTTAGCCAAGACAATTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102292 AGACTGAAAAAACTCCCCAGGGTCTCTCCAACTTAGCCAAGACAATTGGG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 CAGGTTTTGGCTCGAATGCACGATGAAGACCTCATTCATGGTGATCTCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102342 CAGGTTTTGGCTCGAATGCACGATGAAGACCTCATTCATGGTGATCTCAC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 CACCTCCAACATGCTCCTGAAACCCCCCCTGGAACAGCTGAACATTGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102392 CACCTCCAACATGCTCCTGAAACCCCCCCTGGAACAGCTGAACATTGTGC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 TCATAGACTTTGGGCTGAGTTTCATTTCAGCACTTCCAGAGGATAAGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102442 TCATAGACTTTGGGCTGAGTTTCATTTCAGCACTTCCAGAGGATAAGGGA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 GTAGACCTCTATGTCCTGGAGAAGGCCTTCCTCAGTACCCATCCCAACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102492 GTAGACCTCTATGTCCTGGAGAAGGCCTTCCTCAGTACCCATCCCAACAC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 TGAAACTGTGTTTGAAGCCTTTCTGAAGAGCTACTCCACCTCCTCCAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102542 TGAAACTGTGTTTGAAGCCTTTCTGAAGAGCTACTCCACCTCCTCCAAAA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 AGGCCAGGCCAGTGCTAAAAAAATTAGATGAAGTGCGCCTGAGAGGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102592 AGGCCAGGCCAGTGCTAAAAAAATTAGATGAAGTGCGCCTGAGAGGAAGA

    750     .    :    .
    742 AAGAGGTCCATGGTTGGG
        ||||||||||||||||||
 102642 AAGAGGTCCATGGTTGGG