seq1 = pF1KB8912.tfa, 753 bp
seq2 = pF1KB8912/gi568815581r_48476725.tfa (gi568815581r:48476725_48678319), 201595 bp

>pF1KB8912 753
>gi568815581r:48476725_48678319 (Chr17)

(complement)

1-457  (100001-100457)   100% ->
458-753  (101300-101595)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCTATGAGTTCTTTTTTGATCAACTCAAACTATGTCGACCCCAAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCTATGAGTTCTTTTTTGATCAACTCAAACTATGTCGACCCCAAGTT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCCTCCATGCGAGGAATATTCACAGAGCGATTACCTACCCAGCGACCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCCTCCATGCGAGGAATATTCACAGAGCGATTACCTACCCAGCGACCACT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CGCCCGGGTACTACGCCGGCGGCCAGAGGCGAGAGAGCAGCTTCCAGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CGCCCGGGTACTACGCCGGCGGCCAGAGGCGAGAGAGCAGCTTCCAGCCG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GAGGCGGGCTTCGGGCGGCGCGCGGCGTGCACCGTGCAGCGCTACGCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GAGGCGGGCTTCGGGCGGCGCGCGGCGTGCACCGTGCAGCGCTACGCGGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CTGCCGGGACCCTGGGCCCCCGCCGCCTCCGCCACCACCCCCGCCGCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CTGCCGGGACCCTGGGCCCCCGCCGCCTCCGCCACCACCCCCGCCGCCCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CGCCACCGCCCGGTCTGTCCCCTCGGGCTCCTGCGCCGCCACCCGCCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CGCCACCGCCCGGTCTGTCCCCTCGGGCTCCTGCGCCGCCACCCGCCGGG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GCCCTCCTCCCGGAGCCCGGCCAGCGCTGCGAGGCGGTCAGCAGCAGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GCCCTCCTCCCGGAGCCCGGCCAGCGCTGCGAGGCGGTCAGCAGCAGCCC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CCCGCCGCCTCCCTGCGCCCAGAACCCCCTGCACCCCAGCCCGTCCCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CCCGCCGCCTCCCTGCGCCCAGAACCCCCTGCACCCCAGCCCGTCCCACT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 CCGCGTGCAAAGAGCCCGTCGTCTACCCCTGGATGCGCAAAGTTCACGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 CCGCGTGCAAAGAGCCCGTCGTCTACCCCTGGATGCGCAAAGTTCACGTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 AGCACGG         TAAACCCCAATTACGCCGGCGGGGAGCCCAAGCG
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 AGCACGGGTG...CAGTAAACCCCAATTACGCCGGCGGGGAGCCCAAGCG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 CTCTCGGACCGCCTACACGCGCCAGCAGGTCTTGGAGCTGGAGAAGGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101334 CTCTCGGACCGCCTACACGCGCCAGCAGGTCTTGGAGCTGGAGAAGGAAT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 TTCACTACAACCGCTACCTGACACGGCGCCGGAGGGTGGAGATCGCCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101384 TTCACTACAACCGCTACCTGACACGGCGCCGGAGGGTGGAGATCGCCCAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 GCGCTCTGCCTCTCCGAGCGCCAGATCAAGATCTGGTTCCAGAACCGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101434 GCGCTCTGCCTCTCCGAGCGCCAGATCAAGATCTGGTTCCAGAACCGGCG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 CATGAAGTGGAAAAAAGACCACAAGTTGCCCAACACCAAGATCCGCTCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101484 CATGAAGTGGAAAAAAGACCACAAGTTGCCCAACACCAAGATCCGCTCGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 GTGGTGCGGCAGGCTCAGCCGGAGGGCCCCCTGGCCGGCCCAATGGAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101534 GTGGTGCGGCAGGCTCAGCCGGAGGGCCCCCTGGCCGGCCCAATGGAGGC

    750     .    :
    742 CCCCGCGCGCTC
        ||||||||||||
 101584 CCCCGCGCGCTC