seq1 = pF1KB8911.tfa, 750 bp
seq2 = pF1KB8911/gi568815581r_48522903.tfa (gi568815581r:48522903_48726269), 203367 bp

>pF1KB8911 750
>gi568815581r:48522903_48726269 (Chr17)

(complement)

1-517  (100001-100517)   100% ->
518-750  (103135-103367)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCCATTTCTGGGACGCTTAGCAGCTATTATGTCGACTCGATCATAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCCATTTCTGGGACGCTTAGCAGCTATTATGTCGACTCGATCATAAG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TCACGAGAGTGAGGACGCGCCTCCAGCCAAGTTTCCTTCTGGCCAGTACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TCACGAGAGTGAGGACGCGCCTCCAGCCAAGTTTCCTTCTGGCCAGTACG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CGAGCTCGCGGCAGCCGGGCCACGCGGAGCACCTGGAGTTCCCCTCGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CGAGCTCGCGGCAGCCGGGCCACGCGGAGCACCTGGAGTTCCCCTCGTGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 AGCTTCCAGCCCAAAGCGCCGGTGTTCGGCGCCTCCTGGGCGCCGCTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 AGCTTCCAGCCCAAAGCGCCGGTGTTCGGCGCCTCCTGGGCGCCGCTGAG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CCCGCACGCGTCCGGGAGCCTGCCGTCCGTCTACCACCCTTACATCCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CCCGCACGCGTCCGGGAGCCTGCCGTCCGTCTACCACCCTTACATCCAGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CCCAGGGCGTCCCGCCGGCCGAGAGCAGGTACCTCCGCACCTGGCTGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CCCAGGGCGTCCCGCCGGCCGAGAGCAGGTACCTCCGCACCTGGCTGGAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CCGGCGCCGCGCGGCGAAGCGGCCCCGGGGCAGGGCCAGGCGGCGGTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CCGGCGCCGCGCGGCGAAGCGGCCCCGGGGCAGGGCCAGGCGGCGGTGAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GGCGGAGCCGCTGCTGGGCGCGCCTGGGGAGCTGCTCAAACAGGGCACGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GGCGGAGCCGCTGCTGGGCGCGCCTGGGGAGCTGCTCAAACAGGGCACGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 CCGAGTACAGTTTGGAAACTTCGGCGGGCAGGGAGGCCGTGCTGTCTAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 CCGAGTACAGTTTGGAAACTTCGGCGGGCAGGGAGGCCGTGCTGTCTAAT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 CAAAGACCCGGCTACGGGGACAATAAAATTTGCGAAGGAAGCGAGGACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 CAAAGACCCGGCTACGGGGACAATAAAATTTGCGAAGGAAGCGAGGACAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 AGAGAGGCCGGATCAAA         CCAACCCCTCCGCCAACTGGCTGC
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 100501 AGAGAGGCCGGATCAAAGTA...CAGCCAACCCCTCCGCCAACTGGCTGC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 ACGCTCGCTCTTCCCGGAAAAAGCGCTGTCCCTACACCAAATACCAGACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103159 ACGCTCGCTCTTCCCGGAAAAAGCGCTGTCCCTACACCAAATACCAGACG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 CTGGAGCTAGAGAAGGAGTTTCTGTTCAATATGTACCTCACCAGGGACCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103209 CTGGAGCTAGAGAAGGAGTTTCTGTTCAATATGTACCTCACCAGGGACCG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 TAGGCACGAAGTGGCCAGACTCCTCAATCTGAGTGAGAGACAAGTCAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103259 TAGGCACGAAGTGGCCAGACTCCTCAATCTGAGTGAGAGACAAGTCAAAA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 TCTGGTTTCAGAACCGGCGGATGAAAATGAAGAAAATGAATAAGGAGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103309 TCTGGTTTCAGAACCGGCGGATGAAAATGAAGAAAATGAATAAGGAGCAG

    750     .
    742 GGCAAAGAG
        |||||||||
 103359 GGCAAAGAG