seq1 = pF1KB8909.tfa, 732 bp
seq2 = pF1KB8909/gi568815589r_70287779.tfa (gi568815589r:70287779_70513363), 225585 bp

>pF1KB8909 732
>gi568815589r:70287779_70513363 (Chr9)

(complement)

1-505  (100001-100505)   100% ->
506-732  (125359-125585)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCCGCGGCCGCCTACATGGACTTCGTGGCTGCCCAGTGTCTGGTTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCCGCGGCCGCCTACATGGACTTCGTGGCTGCCCAGTGTCTGGTTTC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CATTTCGAACCGCGCTGCGGTGCCGGAGCATGGGGTCGCTCCGGACGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CATTTCGAACCGCGCTGCGGTGCCGGAGCATGGGGTCGCTCCGGACGCCG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGCGGCTGCGACTACCTGAGCGCGAGGTGACCAAGGAGCACGGTGACCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AGCGGCTGCGACTACCTGAGCGCGAGGTGACCAAGGAGCACGGTGACCCG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GGGGACACCTGGAAGGATTACTGCACACTGGTCACCATCGCCAAGAGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GGGGACACCTGGAAGGATTACTGCACACTGGTCACCATCGCCAAGAGCTT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GTTGGACCTGAACAAGTACCGACCCATCCAGACCCCCTCCGTGTGCAGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GTTGGACCTGAACAAGTACCGACCCATCCAGACCCCCTCCGTGTGCAGCG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 ACAGTCTGGAAAGTCCAGATGAGGATATGGGATCCGACAGCGACGTGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 ACAGTCTGGAAAGTCCAGATGAGGATATGGGATCCGACAGCGACGTGACC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 ACCGAATCTGGGTCGAGTCCTTCCCACAGCCCGGAGGAGAGACAGGATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 ACCGAATCTGGGTCGAGTCCTTCCCACAGCCCGGAGGAGAGACAGGATCC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 TGGCAGCGCGCCCAGCCCGCTCTCCCTCCTCCATCCTGGAGTGGCTGCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 TGGCAGCGCGCCCAGCCCGCTCTCCCTCCTCCATCCTGGAGTGGCTGCGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 AGGGGAAACACGCCTCCGAAAAGAGGCACAAGTGCCCCTACAGTGGCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 AGGGGAAACACGCCTCCGAAAAGAGGCACAAGTGCCCCTACAGTGGCTGT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GGGAAAGTCTATGGAAAATCCTCCCATCTCAAAGCCCATTACAGAGTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GGGAAAGTCTATGGAAAATCCTCCCATCTCAAAGCCCATTACAGAGTGCA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 TACAG         GTGAACGGCCCTTTCCCTGCACGTGGCCAGACTGCC
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 TACAGGTT...TAGGTGAACGGCCCTTTCCCTGCACGTGGCCAGACTGCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 TTAAAAAGTTCTCCCGCTCAGACGAGCTGACCCGCCACTACCGGACCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125395 TTAAAAAGTTCTCCCGCTCAGACGAGCTGACCCGCCACTACCGGACCCAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 ACTGGGGAAAAGCAGTTCCGCTGTCCGCTGTGTGAGAAGCGCTTCATGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125445 ACTGGGGAAAAGCAGTTCCGCTGTCCGCTGTGTGAGAAGCGCTTCATGAG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 GAGTGACCACCTCACAAAGCACGCCCGGCGGCACACCGAGTTCCACCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125495 GAGTGACCACCTCACAAAGCACGCCCGGCGGCACACCGAGTTCCACCCCA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :
    692 GCATGATCAAGCGATCGAAAAAGGCGCTGGCCAACGCTTTG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125545 GCATGATCAAGCGATCGAAAAAGGCGCTGGCCAACGCTTTG