seq1 = pF1KB8894.tfa, 651 bp
seq2 = pF1KB8894/gi568815594r_173427280.tfa (gi568815594r:173427280_173629289), 202010 bp

>pF1KB8894 651
>gi568815594r:173427280_173629289 (Chr4)

(complement)

1-555  (100001-100555)   100% ->
556-651  (101915-102010)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAGTCTGGTAGGTGGTTTTCCCCACCACCCGGTGGTGCACCACGAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAGTCTGGTAGGTGGTTTTCCCCACCACCCGGTGGTGCACCACGAGGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTACCCGTTTGCCGCCGCCGCCGCCGCAGCTGCCGCCGCCGCCGCCAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CTACCCGTTTGCCGCCGCCGCCGCCGCAGCTGCCGCCGCCGCCGCCAGCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCTGCAGCCATGAGGAGAACCCCTACTTCCATGGCTGGCTCATCGGCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GCTGCAGCCATGAGGAGAACCCCTACTTCCATGGCTGGCTCATCGGCCAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CCCGAGATGTCGCCCCCCGACTACAGCATGGCCCTGTCCTACAGCCCCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CCCGAGATGTCGCCCCCCGACTACAGCATGGCCCTGTCCTACAGCCCCGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GTATGCCAGCGGCGCCGCCGGCCTGGACCACTCCCATTACGGGGGGGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GTATGCCAGCGGCGCCGCCGGCCTGGACCACTCCCATTACGGGGGGGTGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CGCCGGGCGCCGGGCCCCCGGGCCTGGGGGGGCCGCGCCCGGTGAAGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CGCCGGGCGCCGGGCCCCCGGGCCTGGGGGGGCCGCGCCCGGTGAAGCGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CGAGGCACCGCCAACCGCAAGGAGCGGCGCAGGACTCAGAGCATCAACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CGAGGCACCGCCAACCGCAAGGAGCGGCGCAGGACTCAGAGCATCAACAG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CGCCTTCGCCGAACTGCGCGAGTGCATCCCCAACGTACCCGCCGACACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CGCCTTCGCCGAACTGCGCGAGTGCATCCCCAACGTACCCGCCGACACCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 AACTCTCCAAAATCAAGACCCTGCGCCTGGCCACCAGCTACATCGCCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 AACTCTCCAAAATCAAGACCCTGCGCCTGGCCACCAGCTACATCGCCTAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 CTCATGGACCTGCTGGCCAAGGACGACCAGAATGGCGAGGCGGAGGCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 CTCATGGACCTGCTGGCCAAGGACGACCAGAATGGCGAGGCGGAGGCCTT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CAAGGCAGAGATCAAGAAGACCGACGTGAAAGAGGAGAAGAGGAAGAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CAAGGCAGAGATCAAGAAGACCGACGTGAAAGAGGAGAAGAGGAAGAAGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 AGCTG         AACGAAATCTTGAAAAGCACAGTGAGCAGCAACGAC
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 AGCTGGTC...CAGAACGAAATCTTGAAAAGCACAGTGAGCAGCAACGAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 AAGAAAACCAAAGGCCGGACGGGCTGGCCGCAGCACGTCTGGGCCCTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101951 AAGAAAACCAAAGGCCGGACGGGCTGGCCGCAGCACGTCTGGGCCCTGGA

    650     .    :
    642 GCTCAAGCAG
        ||||||||||
 102001 GCTCAAGCAG