seq1 = pF1KB8869.tfa, 399 bp
seq2 = pF1KB8869/gi568815585f_27522873.tfa (gi568815585f:27522873_27723247), 200375 bp

>pF1KB8869 399
>gi568815585f:27522873_27723247 (Chr13)

1-26  (99112-99137)   100% ->
27-399  (100003-100375)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAAGAGGATCAGGAGCTGGAGAG         AAAAATATCTGGATT
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
  99112 ATGGAAGAGGATCAGGAGCTGGAGAGGTA...TAGAAAAATATCTGGATT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 GAAGACCTCAATGGCTGAAGGCGAGAGGAAGACAGCCCTGGAAATGGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100018 GAAGACCTCAATGGCTGAAGGCGAGAGGAAGACAGCCCTGGAAATGGTCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 AGGCAGCTGGAACAGATAGACACTGTGTGACATTTGTATTGCACGAGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100068 AGGCAGCTGGAACAGATAGACACTGTGTGACATTTGTATTGCACGAGGAA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GACCATACCCTAGGAAATTCTCTACGTTACATGATCATGAAGAACCCGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100118 GACCATACCCTAGGAAATTCTCTACGTTACATGATCATGAAGAACCCGGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 AGTGGAATTTTGTGGTTACACTACGACCCATCCTTCAGAGAGCAAAATTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100168 AGTGGAATTTTGTGGTTACACTACGACCCATCCTTCAGAGAGCAAAATTA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 ATTTACGCATTCAGACTCGAGGTACCCTTCCAGCTGTTGAGCCATTTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100218 ATTTACGCATTCAGACTCGAGGTACCCTTCCAGCTGTTGAGCCATTTCAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 AGAGGCCTGAATGAGCTCATGAATGTCTGCCAACATGTGCTTGACAAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100268 AGAGGCCTGAATGAGCTCATGAATGTCTGCCAACATGTGCTTGACAAGTT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 TGAGGCCAGCATAAAGGACTATAAGGATCAAAAAGCAAGCAGAAATGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100318 TGAGGCCAGCATAAAGGACTATAAGGATCAAAAAGCAAGCAGAAATGAAT

    400     .
    392 CCACATTC
        ||||||||
 100368 CCACATTC