seq1 = pF1KB8868.tfa, 378 bp
seq2 = pF1KB8868/gi568815596r_231825428.tfa (gi568815596r:231825428_232026249), 200822 bp

>pF1KB8868 378
>gi568815596r:231825428_232026249 (Chr2)

(complement)

1-90  (100001-100090)   100% ->
91-378  (100535-100822)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCATCTCTCCCAGCTGCTGGCCTGCGCCCTGCTGCTCACGCTGCTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCATCTCTCCCAGCTGCTGGCCTGCGCCCTGCTGCTCACGCTGCTCTC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCTCCGGCCCTCCGAAGCCAAGCCCGGGGCGCCGCCGAAG         G
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 100051 CCTCCGGCCCTCCGAAGCCAAGCCCGGGGCGCCGCCGAAGGTG...CAGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TCCCGCGAACCCCGCCGGCAGAGGAGCTGGCCGAGCCGCAGGCTGCGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100536 TCCCGCGAACCCCGCCGGCAGAGGAGCTGGCCGAGCCGCAGGCTGCGGGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GGCGGTCAGAAGAAGGGCGACAAGGCTCCCGGGGGCGGGGGCGCCAATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100586 GGCGGTCAGAAGAAGGGCGACAAGGCTCCCGGGGGCGGGGGCGCCAATCT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CAAGGGCGACCGGTCGCGACTGCTCCGGGACCTGCGCGTGGACACCAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100636 CAAGGGCGACCGGTCGCGACTGCTCCGGGACCTGCGCGTGGACACCAAGT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CGCGGGCAGCGTGGGCTCGCCTTCTGCAAGAGCACCCCAACGCGCGCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100686 CGCGGGCAGCGTGGGCTCGCCTTCTGCAAGAGCACCCCAACGCGCGCAAA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 TACAAAGGAGCCAACAAGAAGGGCTTGTCCAAGGGCTGCTTCGGCCTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100736 TACAAAGGAGCCAACAAGAAGGGCTTGTCCAAGGGCTGCTTCGGCCTCAA

    350     .    :    .    :    .    :    .
    342 GCTGGACCGAATCGGCTCCATGAGCGGCCTGGGATGT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100786 GCTGGACCGAATCGGCTCCATGAGCGGCCTGGGATGT