seq1 = pF1KB8864.tfa, 330 bp
seq2 = pF1KB8864/gi568815587r_2059855.tfa (gi568815587r:2059855_2260971), 201117 bp

>pF1KB8864 330
>gi568815587r:2059855_2260971 (Chr11)

(complement)

1-187  (100001-100187)   100% ->
188-330  (100975-101117)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCCTGTGGATGCGCCTCCTGCCCCTGCTGGCGCTGCTGGCCCTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCCCTGTGGATGCGCCTCCTGCCCCTGCTGGCGCTGCTGGCCCTCTG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGGACCTGACCCAGCCGCAGCCTTTGTGAACCAACACCTGTGCGGCTCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGGACCTGACCCAGCCGCAGCCTTTGTGAACCAACACCTGTGCGGCTCAC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ACCTGGTGGAAGCTCTCTACCTAGTGTGCGGGGAACGAGGCTTCTTCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ACCTGGTGGAAGCTCTCTACCTAGTGTGCGGGGAACGAGGCTTCTTCTAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 ACACCCAAGACCCGCCGGGAGGCAGAGGACCTGCAGG         TGGG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 100151 ACACCCAAGACCCGCCGGGAGGCAGAGGACCTGCAGGGTG...CAGTGGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GCAGGTGGAGCTGGGCGGGGGCCCTGGTGCAGGCAGCCTGCAGCCCTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100979 GCAGGTGGAGCTGGGCGGGGGCCCTGGTGCAGGCAGCCTGCAGCCCTTGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CCCTGGAGGGGTCCCTGCAGAAGCGTGGCATTGTGGAACAATGCTGTACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101029 CCCTGGAGGGGTCCCTGCAGAAGCGTGGCATTGTGGAACAATGCTGTACC

    300     .    :    .    :    .    :    .
    292 AGCATCTGCTCCCTCTACCAGCTGGAGAACTACTGCAAC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101079 AGCATCTGCTCCCTCTACCAGCTGGAGAACTACTGCAAC