seq1 = pF1KB8852.tfa, 225 bp
seq2 = pF1KB8852/gi568815587f_62608296.tfa (gi568815587f:62608296_62808803), 200508 bp

>pF1KB8852 225
>gi568815587f:62608296_62808803 (Chr11)

1-99  (100001-100099)   100% ->
100-225  (100383-100508)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAAAGGTGAGACCCCGGTGAACAGCACTATGAGTATTGGGCAAGCACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAAAGGTGAGACCCCGGTGAACAGCACTATGAGTATTGGGCAAGCACG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CAAGATGGTGGAACAGCTTAAGATTGAAGCCAGCTTGTGTCGGATAAAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 100051 CAAGATGGTGGAACAGCTTAAGATTGAAGCCAGCTTGTGTCGGATAAAGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    100         GTGTCCAAGGCAGCAGCAGACCTGATGACTTACTGTGATGCC
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TA...CAGGTGTCCAAGGCAGCAGCAGACCTGATGACTTACTGTGATGCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CACGCCTGTGAGGATCCCCTCATCACCCCTGTGCCCACTTCGGAGAACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100425 CACGCCTGTGAGGATCCCCTCATCACCCCTGTGCCCACTTCGGAGAACCC

    200     .    :    .    :    .    :
    192 CTTCCGGGAGAAGAAGTTCTTCTGTGCTCTCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100475 CTTCCGGGAGAAGAAGTTCTTCTGTGCTCTCCTC