seq1 = pF1KB8846.tfa, 1605 bp
seq2 = pF1KB8846/gi568815580f_70224669.tfa (gi568815580f:70224669_70426273), 201605 bp

>pF1KB8846 1605
>gi568815580f:70224669_70426273 (Chr18)

1-1605  (100001-101605)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAAGAAAATTAGTCTTAAAACCTTACGGAAATCTTTTAACTTGAATAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAAGAAAATTAGTCTTAAAACCTTACGGAAATCTTTTAACTTGAATAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AAGTAAAGAAGAAACTGATTTCATGGTAGTACAACAACCATCGCTAGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 AAGTAAAGAAGAAACTGATTTCATGGTAGTACAACAACCATCGCTAGCCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GTGACTTTGGAAAAGATGATTCCTTATTTGGTAGCTGCTATGGTAAAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GTGACTTTGGAAAAGATGATTCCTTATTTGGTAGCTGCTATGGTAAAGAT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 ATGGCCAGCTGCGATATCAACGGTGAAGATGAAAAAGGCGGAAAAAACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 ATGGCCAGCTGCGATATCAACGGTGAAGATGAAAAAGGCGGAAAAAACAG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 ATCAAAAAGCGAGAGCCTGATGGGTACGCTAAAAAGGCGGCTTTCTGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 ATCAAAAAGCGAGAGCCTGATGGGTACGCTAAAAAGGCGGCTTTCTGCAA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 AACAGAAGTCAAAAGGCAAGGCGGGCACACCCTCTGGGAGCTCTGCCGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 AACAGAAGTCAAAAGGCAAGGCGGGCACACCCTCTGGGAGCTCTGCCGAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GAGGACACCTTCTCCTCCTCCTCAGCACCCATAGTCTTTAAAGACGTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GAGGACACCTTCTCCTCCTCCTCAGCACCCATAGTCTTTAAAGACGTGAG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 AGCTCAGAGGCCGATAAGGTCCACGTCGCTCCGCAGCCATCACTACAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 AGCTCAGAGGCCGATAAGGTCCACGTCGCTCCGCAGCCATCACTACAGTC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 CCGCGCCGTGGCCTCTGCGGCCCACAAACTCCGAGGAGACCTGCATCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 CCGCGCCGTGGCCTCTGCGGCCCACAAACTCCGAGGAGACCTGCATCAAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 ATGGAGGTGAGAGTCAAGGCCTTGGTTCACTCTTCCAGCCCGAGTCCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 ATGGAGGTGAGAGTCAAGGCCTTGGTTCACTCTTCCAGCCCGAGTCCAGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CCTGAATGGCGTCCGGAAGGATTTCCATGACCTCCAGTCTGAGACCACGT
        ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
 100501 CCTGAATGGCGTCCGGAAGGATTTCCACGACCTCCAGTCTGAGACCACGT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 GCCAGGAGCAAGCCAATTCACTGAAGAGCTCGGCTTCTCATAATGGAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 GCCAGGAGCAAGCCAATTCACTGAAGAGCTCGGCTTCTCATAATGGAGAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 CTGCATCTTCACCTGGATGAACATGTGCCTGTCGTTATTGGACTTATGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 CTGCATCTTCACCTGGATGAACATGTGCCTGTCGTTATTGGACTTATGCC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 TCAGGACTACATTCAGTATACTGTGCCTTTAGATGAGGGGATGTATCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 TCAGGACTACATTCAGTATACTGTGCCTTTAGATGAGGGGATGTATCCTT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 TGGAAGGATCACGGAGCTATTGTCTGGACAGCTCTTCTCCCATGGAAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 TGGAAGGATCACGGAGCTATTGTCTGGACAGCTCTTCTCCCATGGAAGTC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 TCTGCGGTTCCTCCTCAAGTGGGAGGGCGCGCTTTCCCCGAGGATGAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 TCTGCGGTTCCTCCTCAAGTGGGAGGGCGCGCTTTCCCCGAGGATGAGAG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 TCAGGTAGACCAGGACCTAGTTGTCGCCCCAGAGATCTTCGTGGATCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 TCAGGTAGACCAGGACCTAGTTGTCGCCCCAGAGATCTTCGTGGATCAGT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 CCGTGAATGGCTTGTTGATTGGCACCACGGGAGTCATGTTGCAGAGCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 CCGTGAATGGCTTGTTGATTGGCACCACGGGAGTCATGTTGCAGAGCCCG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 AGAGCGGGTCACGATGATGTCCCTCCACTCTCACCATTGCTACCTCCAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 AGAGCGGGTCACGATGATGTCCCTCCACTCTCACCATTGCTACCTCCAAT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 GCAGAATAATCAAATCCAAAGGAACTTCAGTGGACTCACTGGCACAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 GCAGAATAATCAAATCCAAAGGAACTTCAGTGGACTCACTGGCACAGAAG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 CCCACGTGGCTGAAAGTATGCGCTGTCATTTGAATTTTGATCCGAACTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 CCCACGTGGCTGAAAGTATGCGCTGTCATTTGAATTTTGATCCGAACTCT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 GCTCCTGGGGTTGCAAGAGTTTATGACTCAGTGCAAAGTAGTGGTCCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 GCTCCTGGGGTTGCAAGAGTTTATGACTCAGTGCAAAGTAGTGGTCCCAT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 GGTTGTGACAAGCCTTACAGAGGAGCTGAAAAAACTTGCAAAGCAAGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 GGTTGTGACAAGCCTTACAGAGGAGCTGAAAAAACTTGCAAAGCAAGGAT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1151 GGTACTGGGGACCAATCACACGTTGGGAGGCAGAAGGGAAGCTAGCAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101151 GGTACTGGGGACCAATCACACGTTGGGAGGCAGAAGGGAAGCTAGCAAAC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1201 GTGCCAGATGGTTCTTTTCTTGTTCGGGACAGTTCTGACGACCGTTACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101201 GTGCCAGATGGTTCTTTTCTTGTTCGGGACAGTTCTGACGACCGTTACCT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1251 TTTAAGCTTGAGCTTTCGCTCCCATGGTAAAACACTTCACACTAGAATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101251 TTTAAGCTTGAGCTTTCGCTCCCATGGTAAAACACTTCACACTAGAATTG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1301 AGCACTCAAATGGTAGGTTTAGCTTTTATGAACAGCCAGATGTGGAAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101301 AGCACTCAAATGGTAGGTTTAGCTTTTATGAACAGCCAGATGTGGAAGGA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1351 CATACGTCCATAGTTGATCTAATTGAGCATTCAATCAGGGACTCTGAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101351 CATACGTCCATAGTTGATCTAATTGAGCATTCAATCAGGGACTCTGAAAA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1401 TGGAGCTTTTTGTTATTCAAGGTCTCGGCTGCCTGGATCTGCAACTTACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101401 TGGAGCTTTTTGTTATTCAAGGTCTCGGCTGCCTGGATCTGCAACTTACC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1451 CCGTCAGACTGACCAACCCAGTGTCCCGGTTCATGCAGGTGCGCTCGTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101451 CCGTCAGACTGACCAACCCAGTGTCCCGGTTCATGCAGGTGCGCTCGTTG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1501 CAGTACCTGTGTCGTTTTGTTATACGTCAGTATACCAGAATAGACTTAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101501 CAGTACCTGTGTCGTTTTGTTATACGTCAGTATACCAGAATAGACTTAAT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1551 TCAGAAACTGCCTTTGCCAAACAAAATGAAGGATTATTTACAGGAGAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101551 TCAGAAACTGCCTTTGCCAAACAAAATGAAGGATTATTTACAGGAGAAGC

   1600     .
   1601 ACTAC
        |||||
 101601 ACTAC